注册并公开摘要对于生物2024

复制数字图

使用核图R功能创建拷贝编号图


生物导体版本:释放(3.18)

CopyNumberPlots有一组函数,扩展了karyoploteRs的功能,以创建漂亮、可自定义且灵活的与拷贝号相关的数据绘图。

作者:Bernat Gel<bgel at igtp.cat>和Miriam Magallon<mmagallon at igtp.cat>

维护人员:Bernat Gel<igtp.cat的bgel>

引文(从R中输入引文(“CopyNumberPlots”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.3”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::install(“CopyNumberPlots”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览渐晕图(“CopyNumberPlots”)
CopyNumberPlots渐晕图 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 副本编号变化新闻报道DNASeq公司数据导入一个频道排序软件可视化
版本 1.18.0
在生物导体中 生物技术3.9(R-3.6)(5年)
许可证 艺术-2.0
取决于 R(>=3.6),核倍体R
进口 区域RI范围Rsamtools软件总结性实验变量注释,方法,统计信息,基因组信息Db基因组学范围中文操作rhdf5基因,实用程序
系统要求
统一资源定位地址 https://github.com/bernatgel/CopyNumberPlots网站
错误报告 https://github.com/bernatgel/CopyNumberPlots/issues网站
查看更多
建议 仿生风格、knitr、rmarkdown、,面板.顶部英国基因组。哈皮恩斯。UCSC.hg19.屏蔽DNA副本,测试
链接到
增强功能
取决于我
导入我 CNV过滤器CNViz公司
建议我
指向我的链接
生成报告 生成报告

程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 副本编号图_1.18.0.tar.gz
Windows二进制 副本编号Plots_1.18.0.zip
macOS二进制(x86_64) 复制编号Plots_1.18.0.tgz
macOS二进制(arm64) 复制编号Plots_1.18.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/CopyNumberPlots网站
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/CopyNumberPlots
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/CopyNumberPlots网站/
包短Url https://bioconductor.org/packages/CopyNumberPlots网站/
软件包下载报告 下载统计信息