多棱镜

多焦点多功能Crispr/Cas设计

生物导体版本：释放（3.18）

此软件包用于设计Crispr/Cas9和Prime Editing实验。它包含以下功能：（1）定义和转换基因组靶点，（2）查找间隔物，（4）目标计数（错误）匹配，以及（5）计算Doench2016/2014靶效率。已经注意到multicrispr能够很好地向大型目标集扩展，从而能够设计大型Crispr/Cas9库。

作者：Aditya Bhagwat[aut，cre]，Richie Cotton[ctb]，Rene Wiegandt[ctb]，Mette Bentsen[ctb].Jens Preussner[ctb]，Michael Lawrence[ctb].HervéPagès[ctb〕，Johannes Graumann[sad]，Mario Looso[sad，rth]

维护人员：阿迪蒂亚·巴格瓦特（Aditya Bhagwat）

引文（从R中输入引文（“multicrispr”）):

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“4.3”）并输入：

if（！require（“生物管理器”，悄悄=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“multicrispr”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

文件

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览Vignets（“multicrispr”）

基因组算术	HTML格式	R脚本
grna_设计	HTML格式	R脚本
素材_编辑	HTML格式	R脚本
参考手册	PDF格式
新闻	文本

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细节

生物视图	CRISPR公司,软件
版本	1.12.9
在生物导体中	生物柴油3.12（R-4.0）（3.5年）
许可证	GPL-2型
取决于	R（>=4.0）
进口	生物遗传学,生物串,牛基因组,CRISPseek公司，数据表，基因组信息Db,基因组特征,基因组范围，ggplot2，网格，核型图R，magrittr，方法，并行，plyranges系列,勒波蒂、网状、，rtracklayer公司，stats，字符串，tidyr，tidyselect，utils
系统要求
统一资源定位地址	https://github.com/loosolab/multicrispr网站
错误报告	https://github.com/loosolab/multicrispr/issues网站

建议	批注中心,仿生风格,英国基因组。哈皮恩斯。加州大学旧金山分校hg38,英国基因组。姆穆苏卢斯。UCSC毫米10,英国基因组。Scerevisiae公司。加州大学旧金山分校sacCer1,集成数据库,I范围knitr magick rmarkdown测试，TxDb（发送日期）。姆穆苏卢斯。UCSC.mm10.known基因
链接到
增强功能
取决于我
导入我
建议我
指向我的链接
生成报告	生成报告

程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	多风险_1.12.9.tar.gz
Windows二进制	multicrispr_1.12.9.zip码
macOS二进制（x86_64）	多风险_1.12.9.tgz
macOS二进制（arm64）	多风险_1.12.9.tgz
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/multicrispr网站
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：packages/multicrispr
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/multicrispr网址/
包短Url	https://bioconductor.org/packages/multicrispr网站/
软件包下载报告	下载统计信息
BioC 3.18的旧源程序包	源存档