计算机辅助焊接

Windows下的ChIP-Seq分析

生物导体版本：释放（3.19）

用滑动窗口检测ChIP-seq数据中的差异结合区域，采用归一化和适当FDR控制的方法。

作者：亚伦·伦[aut，cre]，戈登·史密斯[aut]

维护人员：亚伦·伦（Aaron Lun）<infine.monkeys.with.keyboards at gmail.com>

引文（从R中输入引文（“csaw”）):

要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：

如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：install（“csaw”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览幻影（“csaw”）

生物视图	注释,ChIPSeq公司,新闻报道,差异峰值呼叫,遗传学,多重比较,规范化,排序,软件
版本	1.38.0
在生物导体中	生物技术3.0（R-3.1）（10年）
许可证	GPL-3公司
取决于	R（>=3.5.0），基因组范围,总结性实验
进口	卢比,矩阵,生物遗传学,Rsamtools软件,边缘R,利马、方法、，S4载体,I范围,基因组信息Db，统计，BiocParallel公司,变脚，实用程序
系统要求	C++11，GNU制造
统一资源定位地址

建议	注释Dbi,组织管理例会.db,TxDb（发送日期）。姆穆苏卢斯。UCSC.mm10.known基因,测试那个,基因组特征,基因组比对,针织物,仿生风格,rmarkdown公司,生物技术经理
链接到	Rhtslib公司,zlibbico公司,卢比
增强功能
取决于我	csawBook公司
导入我	差异Hic,会厌HMM,额外ChIP,冰茶,NAD查找器,乌尔坎人,树狄夫
建议我	差异绑定,GRaNIE公司,芯片序列数据库
指向我的链接
生成报告	生成报告

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	csaw_1.38.0.tar.gz
Windows二进制	csaw_1.38.0.zip文件
macOS二进制（x86_64）	csaw_1.38.0.tgz
macOS二进制（arm64）	csaw_1.38.0.tgz
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/csaw
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：packages/csaw
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/csaw/
包短Url	https://bioconductor.org/packages/csaw/
软件包下载报告	下载统计信息