交互集

用于存储基因组相互作用数据的基类

生物导体版本：释放（3.19）

提供GInteractions、InteractionSet和ContactMatrix对象以及相关方法，用于存储和操作来自Hi-C和ChIA-PET实验的基因组相互作用数据。

作者：亚伦·伦[aut，cre]，马尔科姆·佩里[aut]，伊丽莎白·英·塞门斯[aut]

维护人员：亚伦·伦（Aaron Lun）<infine.monkeys.with.keyboards at gmail.com>

引文（从R中输入引文（“InteractionSet”）):

要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：

如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：install（“InteractionSet”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览幻影（“交互集”）

建议	测试那个,针织物,rmarkdown公司,仿生风格
链接到	卢比
增强功能
取决于我	基因组相互作用,HiCDOC公司,差异Hic,七摄氏度,空范围数据
导入我	CAGEfightR公司,ChIPpeakAnno公司,DegCre公司,EDIR查询,HiCE实验,HiC比较,Hi联系人,HiCool公司,HicAggR病毒,额外ChIP,hicVenn图,水手,空范围,交互作用,轨迹查看器,树差异
建议我	绘图员,变速箱R,更新对象,CAGE工作流
指向我的链接
生成报告	生成报告

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	交互集_1.32.0.tar.gz
Windows二进制	交互Set_1.32.0.zip（仅64位）
macOS二进制（x86_64）	交互设置_1.32.0.tgz
macOS二进制（arm64）	交互设置_1.32.0.tgz
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/InteractionSet
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：包/InteractionSet
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/InteractionSet/
包短Url	https://bioconductor.org/packages/InteractionSet/
软件包下载报告	下载统计信息