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轨迹查看器

带有web界面的R/Bioconductor软件包,用于绘制优雅的交互式轨迹或棒棒糖图,以促进多组分数据的综合分析


生物导体版本:释放(3.18)

将映射读取和注释可视化为NGS数据集的跟踪层,如ChIP-seq、RNA-seq、miRNA-seq、DNA-seq、SNPs和甲基化数据。

作者:欧建宏[aut,cre],朱莉·丽华·朱[aut]

维护人员:欧建宏(Jianhong Ou)<杜克教育学院的欧建宏>

引文(从R中输入引文(“trackViewer”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.3”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::install(“trackViewer”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“trackViewer”)
trackViewer渐晕图:更改轨迹样式 HTML格式 R脚本
trackViewer渐晕图:蒲公英图 HTML格式 R脚本
trackViewer渐晕图:棒棒糖图 HTML格式 R脚本
trackViewer渐晕图:概述 HTML格式 R脚本
trackViewer渐晕图:绘图交互数据 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 软件可视化
版本 1.38.2
在生物导体中 生物技术2.14(R-3.1)(10年)
许可证 GPL(>=2)
取决于 R(>=3.5.0),gr设备,方法,基因组学范围,网格
进口 基因组信息Db基因组比对基因组学特征Gviz公司Rsamtools软件S4载体rtracklayer公司生物遗传学、天平、工具、,I范围注释Dbi、grImport、htmlwidgets、plotrix、,Rgraphviz公司交互集图表,实用程序,rhdf5基因,strawr公司
系统要求
统一资源定位地址
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 轨迹查看器_1.38.2.tar.gz
Windows二进制 trackViewer_1.38.2.zip
macOS二进制(x86_64) 轨迹查看器_1.38.2.tgz
macOS二进制(arm64) 轨迹查看器_1.38.2.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/trackViewer
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/trackViewer
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/trackViewer网站/
包短Url https://bioconductor.org/packages/trackViewer/
软件包下载报告 下载统计信息
BioC 3.18的旧源程序包 源存档