版本: |
5.1.0 |
取决于: |
R(≥4.0.0),方法,修饰符对象(≥ 5.0.2) |
进口: |
集群,奶牛场,fast假人,菲迪斯特普卢斯,未来,未来应用程序,泛型(≥ 0.1.3),ggplot2(≥ 3.3.0),gg排斥,ggridges公司,图形,grDevices,网格,高温气冷堆,独立分量分析,记录仪,厄尔巴,jsonlite公司,科恩平滑,莱顿(≥ 0.3.1),生命周期,lmtest测试,MASS(质量),矩阵(≥ 1.5-0),矩阵统计,迷你用户界面,拼凑,pbapply(应用程序),巧妙地(≥ 4.9.0),png公司,进步者,呜呜声,RANN公司,R彩色啤酒,卢比(≥ 1.0.7),Rcpp讨厌(≥ 0.0.18),RcppHNSW公司,网状的,拉朗,收益率,R光谱,Rtsne公司,规模,散漫的(≥ 1.2),sc变换(≥ 0.4.1),闪亮的,spastat.explore软件,spastat.geom公司,统计,易怒的,工具,实用工具,超高速(≥ 0.1.10) |
链接到: |
卢比(≥ 0.11.0),Rcpp特征,Rcpp进度 |
建议: |
猿,箭头、BPCells、,rsvd公司,测试那个,hdf5r型,S4载体,总结性实验,单细胞实验,桅杆,DESeq2公司,生物遗传学,基因组范围,基因组信息数据库,I范围,rtracklayer公司,快速2,单片的,博科生物,VGAM公司,利马,变形金刚,丰富R,混合工具,ggrastr公司,数据表,R.utils公司,马上,DelayedArray(延迟阵列),和谐 |
出版: |
2024-05-10 |
作者: |
安德鲁·巴特勒【ctb】,Saket Choudhary公司【ctb】,戴维·科林斯【ctb】,夏洛特·达比【ctb】,杰夫·法雷尔,伊莎贝拉·格拉布斯基【ctb】,克里斯托夫·哈菲梅斯特【ctb】,余汉浩【ctb】,奥斯汀·哈特曼【ctb】,保罗·霍夫曼【ctb】,杰森·杰恩【ctb】,龙大江【ctb】,马德琳·科瓦尔斯基【ctb】,李斯凯拉[ctb],盖斯米拉·莫拉【ctb】,帕帕莱西Efthymia Papalexi【ctb】,帕特里克·罗利,拉胡尔·萨蒂亚[aut,cre],Karthik Shekhar【ctb】,阿维·斯里瓦斯塔瓦【ctb】,蒂姆·斯图亚特【ctb】,克里斯托夫·托肯奇【ctb】,郑世伟(Shiwei Zheng)【ctb】,Satija实验室和合作者[fnd] |
维护人员: |
拉胡尔·萨蒂亚(Rahul Satija)<seurat at nygenome.org> |
错误报告: |
https://github.com/satijalab/seurat/issues |
许可证: |
麻省理工学院+文件许可证 |
网址: |
https://satijalab.org/seurat网站,https://github.com/satijalab/seurat网站 |
需要编译: |
对 |
其他存储(_R): |
https://satijalab.r-universe.dev网站,https://bnprks.r-universe.dev网址 |
引用: |
修拉引文信息 |
材料: |
自述文件 新闻 |
在视图中: |
组学 |
CRAN检查: |
Seurat结果 |
反向取决于: |
卡西马尔,赛利德,ReactomeGSA.数据,sc注释器,SCArray.sat公司,sc自定义,SCdecor公司 |
反向进口: |
阿南塞·修拉,A克隆包,APL公司,英国广播公司,河坝的,CAMML公司,CDI公司,群集折叠相似性,科坦,CuratedAtlasQueryR,解译X,恐龙,DR.SC公司,DWLS公司,基因NMF,ggsc公司,gg扇区,推断,混合hvg,MOSim(莫西姆),星云,部件CNV,管道Comp,预制,ProFAST公司,区域ST,rPanglaoDB公司,scAnnotate(注释),扫帚工,scBFA公司,scBubbletree公司,scCB2型,sccca公司,scDataviz公司,scDiffCom公司,sc功能,scGate公司,scG集群,scMapper报告,sc扰动R,斯克泊松,SCRIP公司,scRNAseq应用程序,scRNA抑制剂,scTreeViz软件,SignacX公司,单细胞TK,SoupX系列,西班牙猎犬,SPECK公司,斑点,斑点清洁,st连接计数,条纹,潮间带 |
反向建议: |
阿苏拉特,Banksy银行,贝叶斯空间,BisqueRNA,卡内克,蜂房,CIARA公司,俱乐部评估,clustifyrdatahub集群,聚类树,联合国,科诺斯,康西卡,乡村,CR指标,细胞单纯形,DCATS公司,解耦器R,解复用SNP,DIscBIO公司,同上序号,多萝西娅,强化剂,EasyCell类型,EpiMix公司,逃跑,避开(escheR),美食,fgsea公司,Geomx工具,格兰德R,和谐,HCAT库存数据,M3下降,财政部2,单片的,muscData(蘑菇数据),星云,尼帕尔斯MCIA,后代,重置,里格,附表,斯科皮乌斯,SC发布,sc曲目,scTensor公司,西尼亚克,SimBenchData(模拟基准数据),辛布,空间装饰,空间特征实验,空间热图,TAPseq公司,TCG生物链,潮汐鱼,树脚,三轮车,UCell公司,VAM公司 |
反向增强: |
反应物GSA,修饰符对象 |