conos:样本网络上的聚类

将大量单细胞RNA-seq数据集连接在一起,这既可以识别复发细胞簇,也可以在多样本或地图集规模的数据集之间传播信息。”Conos专注于异构样本采集中同源细胞类型的统一映射。例如,用户可以调查从癌症患者采集的数十份外周血样本,并结合数十份对照,其中可能包括淋巴结等相关组织的样本。此包与通过“conosPanel”包提供的数据进行交互,该包位于“drat”存储库中。要访问此数据包,请参阅上的说明<https://github.com/kharchenkolab/conos>. “conosPanel”包的大小约为12 MB。

版本: 1.5.2
取决于: R(≥3.5.0),矩阵,记录仪
进口: 阿宾德,奶牛场,复杂热图,右旋糖,数字播放器,ggplot2,gg排斥,额外网格,厄尔巴,莱登阿尔格,马格里特、方法、,一氧化二氮,平行,R6级,重塑2,拉朗,Rtsne公司,sccore公司(≥1.0.0),统计,工具,实用程序
链接到: 卢比,RcppArmadillo公司,RcppEigen基因,Rcpp进度
建议: 注释Dbi,生物并行、conosPanel、,乏味的,DESeq2公司,,ggrastr公司,政府.db,jsonlite公司,针织物,组织Hs.eg.db,组织管理例会.db,p2数据,宝塔2,项目管理局,普利尔,rhdf5基因,rmarkdown公司,rmumps泵,修拉,小型装载机,总结性实验,测试那个,易怒的,超高速,动物园
出版: 2024-02-26
作者: 维克托·佩图霍夫[aut],尼古拉斯·巴卡斯[aut],彼得·哈尔琴科[aut],邱伟良[ctb],埃文·比德斯特特[aut,cre]
维护人员: Evan Biederstedt在gmail.com>
错误报告: https://github.com/kharchenkolab/conos/issues
许可证: GPL-3公司
版权: 有关各种conos版权的详细信息,请参阅文件COPYRIGHTS
conos版权详细信息
网址: https://github.com/kharchenkolab/conos
需要编译:
其他存储(_R): https://kharchenkolab.github.io/drat网址/
材料: 自述文件
在视图中: 组学
CRAN检查: conos结果

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