BisqueRNA:用单细胞测序分解批量表达

提供准确估计细胞类型丰度的工具来自异构体表达。基于引用的方法使用单细胞信息生成签名矩阵及其转换批量表达式的精确回归估计。基于标记的该方法利用已知的细胞特异性标记基因来测量样品中的丰度。有关更多详细信息,请参见Jew和Alvarez等人(2019年)<数字对象标识代码:10.1101/669911>.

版本: 1.0.5
取决于: R(≥3.5.0)
进口: 博科生物,limSolve(极限解算),方法,统计信息
建议: 修拉,胶合板,针织者,rmarkdown公司,测试那个
出版: 2021年5月23日
作者: 布兰登犹太人,马库斯·阿尔瓦雷斯
维护人员: 布兰登·犹太人
错误报告: https://github.com/cosygene/bisque/issues网站
许可证: GPL-3公司
网址: https://www.biorxiv.org/content/10.101/1669911v1
需要编译:
材料: 自述文件
在视图中: 组学
CRAN检查: BisqueRNA结果

文档:

参考手册: BisqueRNA.pdf
守夜人: 比斯克示例用法

下载内容:

包源: 比斯克RNA_1.0.5.tar.gz
Windows二进制文件: r-devel公司:比斯克RNA_1.0.5.zip,r版本:比斯克RNA_1.0.5.zip,r-oldrel:比斯克RNA_1.0.5.zip
macOS二进制文件: r释放(arm64):比斯克RNA_1.0.5.tgz,r-oldrel(arm64):比斯克RNA_1.0.5.tgz,r-版本(x86_64):比斯克RNA_1.0.5.tgz,r-oldrel(x86_64):比斯克RNA_1.0.5.tgz
旧来源: BisqueRNA存档

反向依赖关系:

反向建议: 桅杆R

链接:

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