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GARSA公司

swMATH ID: 17184
软件作者: Davila,A.M.、Lorenzini,D.M.、Mendes,P.N.等人
描述: GARSA:用于序列注释的基因组分析资源。摘要:基因组数据和分析可能性的增长给科学家理解、整合和处理所有这些不断增加的信息带来了新的困难。在这种情况下,GARSA旨在以灵活的方式促进整合、分析和呈现来自多种生物信息学工具和基因组数据库的基因组信息的任务。GARSA是一个用户友好的基于web的系统,旨在分析管道环境中的基因组数据。EST和GGS数据可以使用该系统进行分析,因为它接受(1)色谱图,(2)从GenBank下载序列,(3)本地存储的Fasta文件,或(4)这三者的组合。色谱图的质量评估、矢量去除和聚类很容易作为管道的一部分执行。可以执行许多本地和可定制的Blast和CDD分析以及Interpo,并辅以系统发育分析。GARSA被用于分析间日锥虫(GSS和EST)、rangeli锥虫(GSS、EST和ORESTES)、jararaca葡萄球菌(EST),中生Piaractus(EST。可用性:GARSA系统在GPL许可下免费可用(http://www.biowebdb.org/garsa/). 有关下载请求,请访问http://www.biowebdb.org/garsa/或联系阿尔贝托·达维拉医生。
主页: http://bioinformatics.oxfordjournals.org/content/21/23/4302.short
相关软件: 浮雕;智能;大坝;阿马达;YACOP公司;戈查;ESTAP公司;自动FACT;PCAP公司;包容的;基因标记;巨嘴鸟;集群;ClustalW公司;潘美;美国金融服务贸易协会;tRNA扫描-SE;菲利普
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1 夏旭华

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