PAML公司

最大似然法(PAML)系统发育分析。PAML是一个使用最大似然法对DNA或蛋白质序列进行系统发育分析的程序包。它由杨子恒免费维护和分发,供学术使用。为UNIX/Linux/macosx分发了ansic源代码,并为MS-Windows提供了可执行文件。PAML不适合造树。当您使用其他程序(如PAUP*、PHYLIP、MOLPHY、PhyML、RaxML等)重建树时,它可用于估计参数和测试假设,以研究进化过程。


zbMATH参考文献(38篇文章引用)

显示结果1到20,共38个。
按年份排序(引用)
  1. Andres Veidenberg,Ari L:Pline:命令行程序的现代web界面的自动生成(2020)阿尔十四
  2. 肖尔,茱莉亚A.;萨姆纳,杰里米G.;霍兰德,芭芭拉R.:乘性封闭密码子模型的不切实际性:向线性替代品撤退(2020年)
  3. Tahir,Daniah;Glémin,Sylvain;Lascoux,Martin;Kaj,Ingemar:在随机物种树上模拟与分子进化相关的性状多样性过程(2019年)
  4. Yoshida,Ruriko;Fukumizu,Kenji;Vogiatzis,Chrysafis:基因树聚类的多位点系统发育分析(2019年)
  5. Liu,Yong;Chen,Jiangan;Qian,Jiaying;Lin,Hao;Sun,Ning;Huang,Zunnan:沉香组中倍半萜合酶的进化分析和结构表征:一项计算研究(2018)
  6. 基思,乔纳森M.(编辑):生物信息学。第一卷:数据、序列分析和进化(2017)
  7. Chi,Peter B.;Chattopadhyay,Sujay;Lemey,Philippe;Sokurenko,Evgeni V.;Minin,Vladimir N.:同义和非同义距离有助于解开聚合进化和重组(2015)
  8. Erciyes,K.:生物信息学的分布式和序列算法(2015)
  9. Soares,AndréE.R.;Schrago,Carlos G.:谱系间速率异质性情景下分类单元抽样对贝叶斯散度时间推断的影响(2015)
  10. Loza Reyes,E.;Hurn,M.A.;Robinson,A.:使用贝叶斯系统发育混合模型对分子序列数据进行分类(2014年)
  11. Schrago,Carlos G.:人类和黑猩猩祖先有效种群规模的极限分布(2014)
  12. Benger,Etam;Sella,Guy:模拟选择压力变化对多态性和差异性的影响(2013)
  13. Ahn,Insung;Son,Hyeon Seok:分析甲型H1N1流感神经氨酸酶基因进化模式的计算模型(2012)
  14. 基因进化的概率最大化模型;基因进化的概率估计;Yuorgi,2010ioport公司
  15. de Oliveira Martins,Leonardo;Kishino,Hirohisa:拓扑结构之间距离的分布及其对检测系统发生重组的影响(2010)
  16. Durand,Pierre M.;Hazelhurst,Scott;Coetzer,Theresa L.:密码子位点的进化速率可用于排列序列和推断蛋白质结构域功能(2010年)ioport公司
  17. 范晓丹;袁媛;刘俊S.:EM算法与计算生物学的兴起(2010)
  18. JSumner,J.G.;Charleston,M.A.:用偏似然张量进行系统发育估计(2010)
  19. Kim,Jaebum;Sinha,Saurabh:走向非编码序列多重比对的现实基准(2010)ioport公司
  20. 马格努森·福特,凯伦;穆尔斯,阿恩;里奥克斯·帕奎特,塞巴斯蒂安;斯蒂尔,迈克:保护进化多样性的比较策略(2010)