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swMATH ID: 17190
软件作者: 泰克·M·默克尔·R·。
描述: YACOP:通过结合现有方法获得的增强型基因预测。如果就参数敏感性和特异性或其识别正确起始密码子的能力进行评估,基因药物治疗工具的性能会有很大差异。我们有兴趣验证用于基因预测的工具,并实现一个名为YACOP的元工具,该工具结合了现有工具,具有更高的性能。YACOP解析并合并三个基因药物系统Critiia、Glimmer和ZCURVE的输出。它以其高灵敏度和特异性值以及大量正确预测的基因启动子而优于每一个测试程序。YACOP和基因发现程序的性能是通过将它们的输出与精心选择的一组注释基因组进行比较来测试的。我们发现,通过计算分析识别原核基因组中的基因的问题得到了满意的解决。相反,起始密码子的正确定位似乎仍然是一个问题,因为在所有测试案例中,至少7.5个
主页: http://content.iospress.com/articles/in-silico-biology/isb00108
相关软件: ClustalW公司;PAML公司;菲利普;PCAP公司;ZCURVE公司;基因标记S;RDP2号机组;PhyloBayes 3;分区查找器;克里蒂卡;TICO公司;合奏休息;MOCAT公司;生物之星;SeqVis系列;黄金;MulRF公司;贝叶斯先生;国际GTP;TOPAL公司
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