聪明的

面向智能基因组数据的4.0集成。SMART(Simple Modular Architecture Research Tool)是一个用于蛋白质结构域识别和注释的web工具(http://SMART.embl.de/),为基因和蛋白质复杂结构域结构的比较研究提供了平台。2004年1月发布的SMART包含685个蛋白质结构域。SMART的新发展集中在整合来自完整后生动物基因组的数据上。SMART现在在其源序列数据库中使用来自完整基因组的预测蛋白质,并将其与正畸学的预测相结合。新的可视化工具已经被开发出来,允许在蛋白质结构域的背景下分析基因的内、外显子结构,并将这些显示对齐,以提供同源基因或同一基因的多个转录本的示意性比较。其他改进包括通过基因本体术语智能查询的能力,改进的结构数据库搜索和多个条目的批检索。


zbMATH中的参考文献(引用于,1标准件)

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按年份排序(引用)

  1. Rout,Subhashree;Mahapatra,Rajani Kanta:\textITi恶性疟原虫CDPK5蛋白的分子建模、对接和动力学分析(2019年)
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  4. 沈洪斌;周国琛:从上到下提高革兰氏阴性细菌蛋白质亚细胞定位预测质量的策略(2010)
  5. Steve Pettifer;Thorne,David;Mcdermott,Philip;Marsh,James;Villéger,Alice;Kell,Douglas B.;Attwood,Teresa K.:可视化生物数据:工具和数据库集成的语义方法(2009)ioport公司
  6. Rendon,Gloria;Ger,Mao Feng;Kantorovitz,Ruth;Natarajan,Shreedhar;Tilson,Jeffrey;Jakobson,Eric:理解分子进化的“水平维度”,以注释、分类和发现具有功能域的蛋白质(2009)ioport公司
  7. 沈洪斌;周国臣,郭晨:用功能域和序列进化信息预测蛋白质折叠模式(2009)
  8. Via,Allegra;Gould,Cathryn M.;Gemünd,Christine;Gibson,Toby J.;Helmer Citterich,Manuela:真核生物线性基序资源的结构过滤器(2009)ioport公司
  9. Bernardes,Juliana S.;Davila,Alberto Mr;Costa,Vitor S.;Zaverucha,Gerson:通过结构比对改进用于远程同源性检测的剖面hmms的模型构建(2007)ioport公司
  10. Mistry,Jaina;Bateman,Alex;Finn,Robert D.:预测pfam数据库中的活性位点残留注释(2007)ioport公司
  11. 夏旭华:生物信息学与细胞。基因组学、蛋白质组学和转录组学的现代计算方法(2007)
  12. Ivica Letunic;Copley,Richard R.;Pils,Birgit;Pinkert,Stefan;Schultz,Jörg;Bork,Peer:SMART 5:基因组和网络背景下的域。(2006年)ioport公司
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  14. Zhu,Tao;Zhou,Jianfeng;An,Yuming;Zhou,Jinhua;Li,Hongyu;Xu,Gang;Ma,Ding:基于岩石簇的EST分析管道的构建和表征(2006)
  15. Ivica Letunic;Richard R.科普利;Schmidt,Steffen;Ciccarelli,Francesca;Doerks,Tobias;Schultz,Jörg;Ponting,Chris P.;Bork,Peer:SMART 4.0:走向基因组数据集成。(2004年)ioport公司
  16. Schultz,Jörg;Copley,Richard R.;Doerks,Tobias;Ponting,Chris P.;Bork,Peer:SMART:一种用于研究基因移动域的基于网络的工具。(2000年)ioport公司