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智能

swMATH编号: 17187
软件作者: Letunic,I.、Copley,R.R.、Schmidt,S.、Ciccarelli,F.D.、Doerks,T.、Schultz,J.、Ponting,C.P.、Bork,P。
描述: SMART 4.0:走向基因组数据集成。SMART(简单模块化体系结构研究工具)是一种网络工具(网址:http://smart.embl.de/)用于蛋白质结构域的识别和注释,并为基因和蛋白质中复杂结构域的比较研究提供了一个平台。2004年1月发布的SMART包含685个蛋白质结构域。SMART的新发展集中于整合来自完整后生动物基因组的数据。SMART现在在其源序列数据库中使用来自完整基因组的预测蛋白质,并将这些蛋白质与正畸学预测相结合。已开发出新的可视化工具,用于分析蛋白质结构域背景下的基因内含子-外显子结构,并将这些显示对齐,以提供同源基因或同一基因的多个转录物的示意图比较。其他改进包括通过基因本体术语查询SMART的能力、改进的结构数据库搜索和多个条目的批量检索。
主页: 网址:http://smart.embl.de/
相关软件: Pfam公司;UniProt公司;磷铝石;ClustalW公司;PSI-爆炸;ELM公司;美国金融服务贸易协会;MAFFT公司;爆炸;ChEMBL公司;哼-mPLoc;欧盟-mPLoc;Gneg-mPLoc公司;位置传感器;PseAAC公司;R(右);影院;肌肉;SPARQL公司;物理ME
引用于: 7文件

标准条款

1出版物描述软件 年份
SMART:一个基于网络的工具,用于研究基因移动领域。
Jörg Schultz;理查德·科普利(Richard R.Copley)。;Doerks、Tobias;庞廷,克里斯·P。;博克,佩尔
2000

按年份列出的引文