哈普根2号机组 swMATH编号: 17354 软件作者: Su,Z.、J.Marchini、P.Donnelly 描述: HAPGEN2:模拟多种疾病SNP。动机:在全基因组关联研究中,使用模拟数据进行实验是评估竞争性实验设计和分析方法的一种廉价方法。基于对已知单倍型重新采样的模拟是快速有效的,并且可以产生具有连锁不平衡(LD)模式的样本,其模拟真实数据中的样本。然而,目前的方法无法模拟同一染色体上的多个邻近疾病SNP,这可能会限制它们的应用。结果:我们引入了一种新的模拟算法,该算法基于一种成功的重采样方法HAPGEN,可以模拟同一染色体上的多个邻近疾病SNP。新方法HAPGEN2保留了重采样方法的许多优点,扩展了当前模拟器提供的疾病模型的范围。可用性:HAPGEN2可从免费获得http://www.stats.ox.ac.uk/marchini/software/gwas/gwas.html。 主页: https://mathgen.stats.ox.ac.uk/genetics_software/hapgen/hapgen2.html 相关软件: R(右);KEGG公司;GCTA公司;PLINK公司;梅塔索夫;XPEB公司;艾根斯特拉;dmGWAS公司;HapBlock公司;SKAT公司;姆博斯特;生物导体;Matlab公司;rBiopaxParser公司;格菲;哈普洛维;记录仪;库达;混合器;氟多醇 引用于: 5文件 全部的 前5名17位作者引用 2 朱利安·马尼茨 1 克里斯托弗·阿莫斯。 1 比克勃勒,海克 1 Patricia汉堡 1 詹妮,Chang-Claude 1 斯特凡妮·弗里德里希斯 1 露丝·海勒 1 本杰明·霍夫纳 1 托马斯·奈布 1 林喜红 1 孟新竹 1 安吉拉·里什 1 瑞安·孙 1 王树东 1 王新增 1 海因兹·埃里奇·威克曼 1 丹尼尔·叶库蒂利 4篇连载文章中引用 1 美国统计协会杂志 1 医学中的计算和数学方法 1 应用统计学年鉴 1 国际生物数学杂志 在4个字段中引用 4 生物学和其他自然科学(92-XX) 三 统计学(62-XX) 1 组合数学(05-XX) 1 运筹学、数学规划(90-XX) 按年份列出的引文