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项目：88589的1至20

1

口腔鳞癌患者肿瘤炎症和基质密度的组织学模式与人口统计学和免疫肿瘤转录谱的相关性

（提交人提供）这项工作的目的是证明口腔鳞状细胞癌（OSCC）肿瘤炎症和基质密度与患者人口统计学以及8种口腔鳞状细胞癌肿瘤组织的差异基因表达（DGE）分析的相关性。使用IO-360 nanoString平台，我们发现在转录水平上，在免疫排斥肿瘤和无瘤周间质炎症的肿瘤中观察到细胞因子信号减少和致癌途径激活。更多。。。
生物体：
智人
类型：
按数组分析表达式
平台：
GPL27956型
8个样品
下载数据：RCC
系列
加入：
GSE220863标准
身份证件：
200220863

用GEO2R分析

2

功能性变体的高通量特征突出了肺癌易感性的异质性和多基因性

（提交人提供）全基因组关联研究（GWAS）已经确定了多个肺癌风险位点，包括那些在主要组织学类型中不同的位点。然而，这些基因座中的大多数还没有功能特征。在这里，我们采用大规模平行报告分析（MPRA）来评估风险相关变异体的等位基因转录活性。我们在东亚和欧洲人群的3个最近GWAS的42个基因座中检测了2245个变异体，涉及肺腺癌和鳞癌细胞，同时将暴露于烟草-烟致癌物苯并[a]芘。更多。。。
生物体：
智人
类型：
通过高通量测序进行表达谱分析
平台：
GPL24676型
22个样品
下载数据：TXT
系列
加入：
45699克
身份证件：
200245699

三。

GLI1+细胞参与缺氧和吸烟时的血管重塑烟-诱导性肺动脉高压

（提交人提供）新形成的α-平滑肌肌动蛋白阳性（ACTA2+）细胞在肺动脉高压（PH）背景下出现在非肌化血管中的确切来源仍有争议，尽管人们认为它们主要来源于先前存在的血管平滑肌细胞（VSMC）。这里是Gli1Core-ERT2；tdTomatoflox小鼠在PH环境下使用两种独立的血管重塑（VR）和反向重塑（RR）模型进行GLI1+细胞的血统追踪：缺氧和吸烟-烟暴露（SE）。更多。。。
生物体：
小家鼠
类型：
通过高通量测序进行表达谱分析
平台：
GPL13112型
1个样品
下载数据：MTX、TSV
系列
加入：
GSE260788标准
身份证件：
200260788

4

GLI1+细胞参与缺氧和香烟烟雾诱导的肺动脉高压的血管重塑

（提交人提供）新形成的α-平滑肌肌动蛋白阳性（ACTA2+）细胞在肺动脉高压（PH）背景下出现在非肌化血管中的确切来源仍有争议，尽管人们认为它们主要来源于先前存在的血管平滑肌细胞（VSMC）。这里是Gli1Core-ERT2；tdTomatoflox小鼠在PH环境下使用两种独立的血管重塑（VR）和反向重塑（RR）模型进行GLI1+细胞的谱系追踪：缺氧和吸烟-烟暴露（SE）。更多。。。
生物体：
智人
类型：
通过高通量测序进行表达谱分析
平台：
GPL24676型
4个样品
下载数据：CSV
系列
加入：
GSE253415标准
身份证件：
200253415

5

单细胞分析揭示进展性特发性肺纤维化的免疫异常

（提交人提供）基本原理：在特发性肺纤维化（IPF）的单细胞分辨率下观察到外周血细胞数量的变化，但未详细说明。目的：提供稳定和进行性IPF患者外周免疫系统变化的图谱。方法：采用10x铬5'单细胞RNA测序（scRNA-seq）对IPF患者和对照者的外周血单个核细胞（PBMC）进行分析。更多。。。
生物体：
智人
类型：
通过高通量测序进行表达谱分析
平台：
GPL20301型
38个样品
下载数据：MTX、TSV
系列
加入：
GSE233844标准
身份证件：
200233844

6

全基因组甲基化分析揭示与疼痛性颞下颌关节紊乱病和积极恢复过程相关的区域

（提交人提供）患有/不患有慢性或急性颞下颌关节紊乱病（TMD）的样本的全基因组DNA甲基化分析。使用Illumina Infinium人类甲基化EPIC芯片获得TMD样本中1051943个CpG的DNA甲基化图谱。样本包括OPPERA I的452例非TMD和496例慢性TMD，OPPERA II的36例健康TMD和123例急性TMD。
生物体：
智人
类型：
利用基因组拼接阵列进行甲基化分析
平台：
GPL21145型
1107样品
下载数据：CSV、IDAT
系列
加入：
24124英镑
身份证件：
200224124

公共医学 类似研究

7

基于COPD患者RNA测序数据的韩国多中心队列研究

（提交人提供）确定导致COPD发生的基因表达变化吸烟者对COPD患者外周血进行高通量RNA测序。通过前瞻性收集肺功能测试结果和来自吸烟者自2020年以来，他访问了三家医院的呼吸内科门诊。本研究通过RNA-Seq转录组分析，根据气流限制程度，证实了COPD患者非编码RNA的基因表达差异。更多。。。
生物体：
智人
类型：
通过高通量测序进行表达谱分析
平台：
GPL24676型 GPL30209标准
294个样品
下载数据：TXT
系列
加入：
GSE240656标准
身份证件：
200240656

8

广泛期小细胞肺癌化疗免疫治疗结果的空间保留多区域转录组亚型和生物标记物[IMfirst_DSP队列]

（提交人提供）转录组分型有望用于广泛期小细胞肺癌（ES-SCLC）的个性化治疗。在这项研究中，我们旨在评估肿瘤内转录组亚型的多样性，并确定与人类ES-SCLC长期化学免疫治疗益处相关的生物标记物。我们的工作强调，肿瘤内高度异质性、与结果缺乏一致性关联以及亚型特异性靶点表达不明确是SCLC亚型精确肿瘤学面临的主要挑战。更多。。。
生物体：
智人
类型：
其他
平台：
GPL30173型
175个样品
下载数据：DCC、PKC、PNG、XLSX
系列
加入：
GSE261348标准
身份证件：
200261348

9

广泛期小细胞肺癌化疗免疫治疗结果的空间保留多区域转录组亚型和生物标记物[CANTABRICO_DSP队列]

（提交人提供）转录组分型有望用于广泛期小细胞肺癌（ES-SCLC）的个性化治疗。在这项研究中，我们旨在评估肿瘤内转录组亚型的多样性，并确定与人类ES-SCLC长期化学免疫治疗益处相关的生物标记物。我们的工作强调，肿瘤内高度异质性、与结果缺乏一致性关联以及亚型特异性靶点表达不明确是SCLC亚型精确肿瘤学面临的主要挑战。更多。。。
生物体：
智人
类型：
其他
平台：
GPL30173型
121个样品
下载数据：DCC、PKC、PNG、XLSX
系列
加入：
GSE261345标准
身份证件：
200261345

10

嗜酸卵热菌使T17细胞极化，并使中性粒细胞成熟度偏斜，从而促进肺腺癌的发展

（提交人提供）失调，或微生物组内的变化，是实体肿瘤的一个常见特征，然而，这种失调是否直接导致肿瘤的发展，目前尚不清楚。我们之前对人类肺癌微生物组进行了表征，并鉴定了在肿瘤中富集并与吸烟状态和TP53突变。为了确定暴露于温曲霉是否有助于肺癌的发展，我们在由突变Kras和Tp53驱动的肺腺癌基因工程小鼠模型中研究了其作用。更多。。。
生物体：
小家鼠
类型：
通过高通量测序进行表达谱分析
平台：
GPL23479型
45个样品
下载数据：TXT
系列
加入：
GSE259408标准
身份证件：
200259408

公共医学 PMC中的全文 类似研究

11

成纤维细胞生长因子（FGF）10对肺形态发生至关重要

（提交人提供）成纤维细胞生长因子（FGF）10对肺形态发生至关重要，Fgf10区域的多态性与人类患者对COPD的高易感性有关。我们发现慢性阻塞性肺病患者肺间隔室FGF10信号受损。FGF10信号（FGF10+/-）受损的小鼠更容易吸烟烟（CS）诱导的肺气肿和肺动脉高压（PH）。更多。。。
生物体：
小家鼠
类型：
按数组分析表达式
平台：
GPL21810型
68个样品
下载数据：GPR
系列
加入：
GSE230854标准
身份证件：
200230854

用GEO2R分析

12

香烟对小鼠A（H7N9）流感病毒感染的抑制作用烟

（提交人提供）本研究旨在确定香烟对小鼠肺部基因表达的影响吸烟感染H7N9流感病毒期间。
生物体：
小家鼠
类型：
按数组分析表达式
平台：
GPL10787号
80个样本
下载数据：TXT
系列
加入：
GSE261627标准
身份证件：
200261627

用GEO2R分析

13

孕妇儿童口腔DNAm的表观基因组分析吸烟者参加VCSIP随机对照试验：NCT03203603

（提交人提供）对子宫内接触母亲的儿童口腔样本进行DNA甲基化分析吸烟怀孕期间（补充或不补充维生素C）和少量非-吸烟者控制
生物体：
智人
类型：
阵列甲基化分析
平台：
GPL21145型
359个样品
下载数据：IDAT、TXT
系列
加入：
GSE252169标准
身份证件：
200252169

14

一个基于网络的框架，用于发现复杂疾病的治疗反应预测生物标记物

（提交人提供）与高通量多组学数据集中发现的分子特征数量相比，数据可用性有限，样本量不足，这往往挑战了精准医学转化复杂自体免疫疾病治疗的潜力。为了解决这个问题，开发了新的框架PRoBeNet（使用网络医学的预测反应生物标记物）。ProBeNet的运作假设是，药物的治疗效果通过蛋白质-蛋白质相互作用网络传播，以逆转疾病状态。更多。。。
生物体：
智人
类型：
通过高通量测序进行表达谱分析
平台：
GPL24676型
12个样品
下载数据：CSV
系列
加入：
邮编：261205
身份证件：
200261205

15

蛋白质组学特征揭示雌激素信号作为Never的靶点-吸烟者无EGFR或ALK改变的肺腺癌患者[甲基化EPIC]

（提交人提供）从不-吸烟者肺腺癌（NSLA）在亚洲人群中普遍存在，在女性中更为常见。EGFR突变和ALK融合是NSLA中观察到的主要改变。我们关注的是无EGFR和ALK改变的NSLA（NENA），而不是有EGFR和ALK改变的NSLA（EA）。首先，我们选择了141个NSLA组织，进行了蛋白质组学分析，包括全基因组测序（WGS）、转录组、甲基化EPIC阵列、总蛋白质组和磷酸蛋白质组。更多。。。
生物体：
智人
类型：
利用基因组拼接阵列进行甲基化分析
平台：
GPL21145型
141个样品
下载数据：IDAT、TXT
系列
加入：
GSE256092标准
身份证件：
200256092

16

蛋白质组学特征揭示雌激素信号作为Never的靶点-吸烟者无EGFR或ALK改变的肺腺癌患者[RNA-seq]

（提交人提供）从不-吸烟者肺腺癌（NSLA）在亚洲人群中普遍存在，在女性中更为常见。EGFR突变和ALK融合是NSLA中观察到的主要改变。我们关注的是无EGFR和ALK改变的NSLA（NENA），而不是有EGFR和ALK改变的NSLA（EA）。首先，我们选择了141个NSLA组织，进行了蛋白质组学分析，包括全基因组测序（WGS）、转录组、甲基化EPIC阵列、总蛋白质组和磷酸蛋白质组。更多。。。
生物体：
智人
类型：
通过高通量测序进行表达谱分析
平台：
GPL24676型
141个样品
下载数据：TAB
系列
加入：
GSE256091标准
身份证件：
200256091

用GEO2R分析

17

孕妇胎盘样本的转录分析吸烟怀孕期间

（提交人提供）59份样本中胎盘基因表达的RNAseq分析吸烟者（参加VCSIP RCT:NCT03203603）和20名从未参加过-吸烟者供参考。
生物体：
智人
类型：
通过高通量测序进行表达谱分析
平台：
GPL16791公司
79个样品
下载数据：CSV
系列
加入：
GSE253158标准
身份证件：
200253158

公共医学 PMC中的全文 类似研究 用GEO2R分析

18

未知原发性头颈癌淋巴结组织DNA甲基化谱

（提交人提供）背景。未知原发性头颈癌（hnCUP）中来源不明的组织导致侵入性诊断程序和患者的非特异性和潜在低效治疗选择。鳞状细胞癌是最常见的组织学亚型，可起源于各种肿瘤的原发部位，包括口腔、口咽、喉、头颈部皮肤、肺和食道。DNA甲基化谱具有高度组织特异性，已成功用于组织起源分类。因此，我们开发了一种支持向量机（SVM）分类器，该分类器使用常见宫颈转移性鳞癌（n=1103）的公开DNA甲基化谱进行训练，以识别我们自己的鳞状细胞hnCUP患者样本队列（n=28）的原发组织。Illumina使用Infinium MethylationEPIC v1.0 BeadChip进行甲基化分析。结果。SVM算法在测试分类器中获得了最高的总体准确率，达到87%。DNA甲基化水平的鳞状细胞hnCUP样本类似于鳞状细胞癌，通常转移到颈部淋巴结。最常预测的癌症部位是11例患者的口腔（39%），其次是口咽和喉（均为725%）、皮肤（2,7%）和食道（1.4%）。这些频率与流行病学研究中预期的淋巴结转移分布相一致。结论。在DNA甲基化水平上，hnCUP与通常转移到颈部淋巴结的原发性肿瘤组织癌类型相当。我们的基于SVM的分类器可以准确预测这些癌症的起源组织，可以显著降低hnCUP诊断的侵袭性，并在临床验证后实现更精确的治疗。
生物体：
智人
类型：
利用基因组拼接阵列进行甲基化分析
平台：
GPL21145型
28个样品
下载数据：IDAT
系列
加入：
GSE256413标准
身份证件：
200256413

公共医学 PMC中的全文 类似研究 用GEO2R分析

19

人类血清：对照组与肺癌组

（提交人提供）血清中的自身抗体（标记Cy3的IgG抗体和标记Cy5的IgM抗体）通过血清孵育人类蛋白微阵列进行定量，并将正常人和肺癌患者的数据进行比较，以找到肺癌中自身抗体的预测标记物
生物体：
智人
类型：
蛋白质阵列蛋白质分析
平台：
GPL29809系列 GPL29810系列
196个样品
下载数据：GPR
系列
加入：
GSE168198
身份证件：
200168198

用GEO2R分析

20

全血转录组学显示G-CSF是体外循环诱导的全身炎症反应综合征的介质

目的：全身炎症反应综合征（SIRS）是体外循环（CPB）的常见并发症。SIRS与显著的发病率和死亡率相关，但其发病机制尚不完全清楚，因此缺乏生物标记物，治疗仍具有预期性和支持性。本研究旨在了解CPB诱导SIRS的病理生理机制，并确定可能减少全身炎症并改善患者预后的新治疗靶点。更多。。。
生物体：
智人
类型：
通过高通量测序进行表达谱分析
平台：
GPL24676型
77个样本
下载数据：CSV
系列
加入：
GSE253782标准
身份证件：
200253782

公共医学 PMC中的全文 类似研究 用GEO2R分析

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