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    抄送9CD9分子[褐家鼠(挪威鼠)]

    基因ID:24936,更新日期2024年4月11日

    总结

    官方符号
    抄送9由提供RGD公司
    官方全名
    CD9分子由提供RGD公司
    主要来源
    RGD:2318号
    请参阅相关
    乐团:ENSRNOG00000019556 联盟基因组:RGD:2318
    基因类型
    蛋白质编码
    RefSeq状态
    已验证
    有机体
    褐家鼠
    血统
    真核生物;后生动物;脊索动物;克兰亚塔;脊椎动物;真肠造口术;哺乳动物;Eutheria;尤阿古托格利尔斯;闪光;啮齿动物;肌形态;鼠形目;鼠科;穆里奈;大鼠
    总结
    启用整合素结合活性。参与大脑发育;少突胶质细胞发育;以及应对缺水。位于心尖质膜内;细胞表面;和胞外外体。该基因的人类同源基因与前列腺癌有关。与人CD9(CD9分子)同源。【由基因组资源联盟提供,2022年4月】
    表达式
    肺组织(RPKM 2035.2)、肾上腺组织(RPKM 695.5)和7种其他组织中的偏倚表达查看更多
    直系同源
    新款
    尝试新的基因表
    尝试新的成绩单表

    基因组背景

    位置:
    第4季度42
    外显子计数:
    7
    注释发布 状态 装配 Chr公司 位置
    RS_2024_02号 现在的 GRCr8级(GCF_036323735.1号) 4 NC_086022.1(159942553..159975463,补码)
    RS_2023_06号 上一个程序集 mRatBN7.2美元(GCF_015227675.2号) 4 NC_051339.1(158256328..158289136,补体)
    106 上一个程序集 雷诺_6.0(GCF_ 000001895.5) 4 NC_005103.4(157977163..158010091,补遗)

    染色体4-NC_086022.1描述邻近基因的基因组背景 Neighboring gene uncharacterized LOC134486640 Neighboring gene pleckstrin homology and RhoGEF domain containing G6 Neighboring gene RNA, U6 small nuclear 212 Neighboring gene uncharacterized LOC134486684 Neighboring gene von Willebrand factor

    基因组区域、转录物和产物

    表达式

    • 项目名称:跨越11个器官和4个发育阶段的大鼠RNA-Seq转录体BodyMap
    • 描述:从Fischer 344大鼠的11个器官(肾上腺、大脑、心脏、肾脏、肝脏、肺、肌肉、脾脏、胸腺和睾丸或子宫)中分离出320个RNA样本,这些器官来自于四个发育阶段(2-、6-、21-和104周龄)的雌雄大鼠
    • 生物项目:项目编号:238328
    • 出版物:PMID 24510058
    • 分析日期:2016年6月6日星期一17:44:12

    参考文献

    PubMed中的相关文章

    GeneRIFs:功能中的基因参考

    什么是GeneRIF?
    提交: 新GenerRIF 更正

    PubChem的途径

    互动

    产品 交互作用剂 其他基因 复杂 来源 酒吧 描述

    一般基因信息

    标记

    基因本体论 RGD提供

    功能 证据代码 酒吧
    启用整合素结合 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
     
    启用整合素结合 IPI公司
    从物理相互作用推断
    更多信息
    公共医学 
    启用整合素结合 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    实现蛋白质结合 IPI公司
    从物理相互作用推断
    更多信息
    公共医学 
    过程 证据代码 酒吧
    参与细胞粘附 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
     
    参与细胞粘附 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与细胞粘附 国际空间站
    根据序列或结构相似性推断
    更多信息
     
    细胞群增殖上游因子 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    低密度脂蛋白颗粒刺激参与细胞反应 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    低密度脂蛋白颗粒刺激参与细胞反应 国际空间站
    根据序列或结构相似性推断
    更多信息
     
    精卵膜融合参与单受精 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
     
    精卵膜融合参与单受精 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    精卵膜融合参与单受精 国际空间站
    根据序列或结构相似性推断
    更多信息
     
    参与胶质细胞迁移 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
     
    参与胶质细胞迁移 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与成肌细胞融合参与骨骼肌再生 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    成肌细胞融合参与骨骼肌再生 国际空间站
    根据序列或结构相似性推断
    更多信息
     
    acts_upstream_of_or对细胞增殖的负调控 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与血小板聚集的负调控 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
     
    参与血小板聚集的负调控 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与血小板聚集的负调控 国际空间站
    根据序列或结构相似性推断
    更多信息
     
    参与少突胶质细胞发育 IEP公司
    从表达式模式推断
    更多信息
    公共医学 
    卷入偏执连接组件 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    卷入偏执连接组件 国际空间站
    根据序列或结构相似性推断
    更多信息
     
    参与蛋白受体内化 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与受体内化 国际空间站
    根据序列或结构相似性推断
    更多信息
     
    参与巨噬细胞迁移的调控 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    涉及单次受精 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    涉及单次受精 国际空间站
    根据序列或结构相似性推断
    更多信息
     
    参与精卵识别 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与精卵识别 国际空间站
    根据序列或结构相似性推断
    更多信息
     

    一般蛋白质信息

    首选名称
    CD9抗原
    姓名
    CD9抗原(p24)

    NCBI参考序列(RefSeq)

    新款 尝试新的成绩单表

    独立于注释的RefSeq维护基因组

    这些参考序列独立于基因组构建而存在。解释

    这些参考序列与基因组无关注释循环,因此其版本可能与当前的RefSeq版本不匹配基因组构建。通过比较中RefSeq的版本来确定版本不匹配本节至中报告的那一节基因组区域,成绩单和产品以上。

    mRNA和蛋白质

    1. NM_053018.1号NP_444177.1号CD9抗原

      参见NP_444177.1的相同蛋白质及其注释位置

      状态:已验证

      源序列
      BG670145、BQ202980、CF111078、X76489
      UniProtKB/Swiss-Prot公司
      第40241页
      UniProtKB/TrEMBL公司
      B1WBM0型
      相关的
      ENSRNOP00000026633.5号文件,ENSRNOT00000026633.8号
      保守领域(2)总结
      cd03152号
      位置:109191
      CD9_LEL;四spanin,胞外结构域或大胞外环(LEL),CD9家族。四spanins是具有4个跨膜片段的跨膜蛋白。N端和C端均位于膜的细胞内侧。此路线模型跨越。。。
      pfam00335型
      位置:10215
      四spannin;Tetraspanin家族

    注释基因组的参考序列:GCF_036323735.1-RS_2024_02

    以下部分包含属于特定基因组构建。解释

    参考GRCr8

    基因组学

    1. NC_086022.1参考GRCr8

      范围
      159942553..159975463补码
      下载
      GenBank(基因银行),美国金融服务贸易协会,序列查看器(图形)

    mRNA和蛋白质

    1. XM_063285570.1XP_063141640.1型CD9抗原亚型X1

      UniProtKB/TrEMBL公司
      A0A8I5ZZU3型