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ExProfile™基因qPCR阵列

介绍

用于基因表达的高通量分析

ExProfile™基因qPCR阵列设计用于分析各种组织或细胞中预制或定制的编码基因集的表达。由此产生的异形基因差异表达有助于研究人员识别那些具有生物学意义且与其研究相关的基因。在每个96 well板中，有多达84对qPCR引物和12个对照孔，用于监测从反转录到qPCR反应的整个实验过程的效率。

qPCR阵列中使用的每对引物都经过了实验验证，可以产生一个单独的解离曲线峰，并产生一个正确大小的靶向信使核糖核酸扩增。cDNA库包含10种不同组织总RNA的反向转录产物，用作qPCR验证模板。

开发了一种通用的实时PCR条件，以便以高通量的方式分析基因表达。All-in-One™第一链cDNA合成试剂盒和qPCR Mix试剂盒是推荐和支持的用于ExProfile™基因qPCR阵列的RT-PCR试剂。这些试剂已经过优化，以产生高灵敏度、效率和特异性。

主要优势

验证的mRNA引物

  • 每个引物对都是使用专有算法设计的，并且已经过实验验证

稳健的性能

  • 敏感–使用ExProfile基因qPCR阵列和推荐的试剂/条件检测低至4份RNA
  • 宽线性-同时检测不同表达水平的mRNA
  • 可再现性–高再现性（R2>0.99）对于组间和组内复制

预先安排的组或自定义组

  • 预先安排的癌症相关群体
  • 预先安排的路径相关组
  • 用于重点研究的定制基因阵列

基因qPCR阵列实验工作流程

图1。基因qPCR阵列实验工作流程。

 

性能数据


线性范围和灵敏度（对照RNA峰值）
宽线性范围和高灵敏度

图2。宽线性范围和高灵敏度

使用All-in-One第一链cDNA合成试剂盒反向转录带有连续稀释的尖峰控制RNA的小鼠总RNA。使用全合一qPCR混合物和放置在96 well板中的尖峰对照特异性引物检测反转录cDNA样品。所得Ct值与对照RNA中尖峰量的对数5进行了标绘。数据显示了从4到1.6*10的广泛线性动态范围6输入RNA的拷贝数以及高灵敏度。


总RNA范围内的阳性呼叫
总RNA只有15.36 ng的高阳性呼叫

图3。总RNA只有15.36 ng的高阳性呼叫

用人类乳腺癌基因qPCR阵列（PAG-HGBE96-01）分析不同数量的MCF_7总RNA（1000、200、40、8、1.6ng）。阳性调用的百分比（Ct<35）与每个qPCR反应中总RNA的输入量相比较。


阵列间再现性
高阵列间再现性

图4。高阵列间再现性


使用Bio-Rad iQ5上的人类总RNA（10-组织混合）分析了两个ExProfile™qPCR基因阵列复制品（平板A和B）。将复制板的Ct值相互对照绘制。R（右）2阵列间重现性高，>0.99。R（右）2阵列内再现性也观察到>0.99（数据未显示）。