发行内容

结构生物学
通信

第74卷| 第8部分

国际标准编号：2053-230X

2018年8月发行

糖蛋白和蛋白质-碳水化合物复合物的结晶

Jon Agire和Mark van Raaij编辑

封面插图：高糖基化人白细胞弹性蛋白酶与S2'位点结合抑制剂复合物的结构[霍奇谢尔夫等。(2018),《水晶学报》。F类74, 480-489]. 使用Glycoblocks表示生成的动画[McNicholas和Agirer（2017），《水晶学报》。D类73, 187-194]在CCP4毫克。

社论

碳水化合物结构恰到好处

J.阿吉雷和M.J.van Raaij先生

介绍《水晶学报》。F类糖蛋白和蛋白质-碳水化合物复合物专刊，简要讨论了糖结构生物学的内容、领域现状和未来。

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专题评论

蛋白质结构和机制方面的展望O（运行）-羰基化

E.利拉纳瓦雷特和R.Hurtado-Guerrero先生

蛋白质O（运行）-岩藻糖基转移酶1和2在不同底物上进行相同的转录后修饰。底物的正确折叠对蛋白质识别至关重要，这些蛋白质的晶体结构表明了这两种蛋白质高度特异的机制。

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甜蜜邂逅的旋转芭蕾舞：饱和转移差异核磁共振和X射线晶体学在蛋白质-聚糖相互作用的解释中相辅相成

B.S.布拉姆,U.Neu公司,T.彼得斯和T.斯泰尔

基于质子的饱和转移差异核磁共振（STD-NMR）是一种技术，已被证明在解释蛋白质-聚糖相互作用方面特别有用。本文解释了非核磁共振波谱师的方法，并使用病毒衣壳蛋白与相应聚糖受体复合物的许多晶体结构，将结晶学和STD-NMR的结果并排进行比较，强调了这些方法的互补性。

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研究交流

使糖蛋白更甜PDB重做

B.van Beusekom公司,T·Lütteke和R.P.Joosten先生

讨论了当前PDB-REDO数据库中碳水化合物处理的结果和挑战。

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1型乳剂的构象-N个-蛋白质复合物结构中的biose I单位

S.Fushinobu公司

拉克托-N个-对PDB中的biose I单元进行了调查。综述了各种生物PDB中蛋白质和酶中双糖的实例和构象特征。

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高糖基化人白细胞弹性蛋白酶与S2′位点结合抑制剂复合物的晶体结构

J.霍奇谢尔夫,M.Pietsch先生,W.Tieu公司,K.Kuan先生,A.D.Abell（阿贝尔）,郭台铭先生和K.尼芬

人类白细胞弹性蛋白酶小分子抑制剂与酶的共晶体结构揭示了其新型结合模式。在结构中，附着在酶上的N-聚糖链的相对大部分是可见的。

PDB参考以下为：人类白细胞弹性蛋白酶，6f5m

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a的结构嗜松塔拉菌GH62阿拉伯呋喃糖苷酶与AraDNJ的复合物（1.25）奥数分辨率

O.V.莫罗兹,L.F.索巴拉,E.布拉戈瓦,T.科伊尔,W.Peng先生,K.B.R.Mørkeberg Krogh先生,K.A.Stubbs公司,K·S·威尔逊和G.J.戴维斯

来自CAZY家族GH62的真菌阿糖呋喃糖苷酶的三维结构已在1.25解出与定制的阿拉伯呋喃糖苷酶抑制剂AraDNJ复配，揭示了该催化剂在酶解阿拉伯木聚糖中的活性。

PDB参考以下为：嗜松塔拉菌阿拉伯呋喃糖苷酶，与AraDNJ复合，6f1j

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GH124内切葡聚糖酶异常金属离子位点的结构研究热细胞瘤胃杆菌

S.Urresti公司,A.卡梅尔,F.刘,P.H.沃尔顿和G.J.戴维斯

CAZY家族GH124内切葡聚糖酶嗜热瘤胃梭菌含有一个不寻常的金属离子位点，其特征是共价修饰的“2-氧杂环司他丁”残基。原子分辨率（～1 三维分析，结合ITC和质谱，表明该金属位点可以容纳多种过渡金属，所有这些都对酶具有稳定作用。

PDB参考以下为：GH124内切葡聚糖酶，与G3复合，6g1g;与G5F、6g1i复合

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的效应结合结构域的晶体结构长聚球藻CmpR与1,5-二磷酸核酮糖复合物

D.M.马洪加,H.太阳和Y.-L.江

报道了CmpR与共激活剂1，5-二磷酸核酮糖复合物中效应结合域的结构，揭示了LysR型转录调节因子家族的一种新的配体结合模式。

PDB参考以下为：CmpR效应器结合域，与核酮糖1-5-二磷酸复合物，5z49

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GH9葡萄糖苷酶/葡糖苷酶的结构霍乱弧菌

吴立中（L.Wu）和G.J.戴维斯

的结构霍乱弧菌`来自CAZy家族GH9的exo'-糖苷酶在3.17处被溶解奥分辨率。初步活性测定表明，该酶对壳聚糖衍生低聚糖和β-葡萄糖苷都具有活性。

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