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结构
生物学
第57卷
|
第1部分
国际标准编号:2059-7983
2001年1月发行
封面插图:
通过无磷酸盐和抑制剂计算的溶剂可及表面描述小牛脾PNP的结合囊(
第30页
).
研究论文
《水晶学报》。
(2001).
D类
57
,
1-7
https://doi.org/10.107/S090744900013767
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人红细胞过氧化氢酶四方晶体的结构
M.K.萨福
,
F.N.穆萨耶夫
,
S.-H.Wu先生
,
D.J.亚伯拉罕
和
T.-P.Ko公司
在人红细胞过氧化氢酶的晶体结构中,对应于该基因第一外显子和最后外显子的N端和C端片段不位于四方
我
4
1
HEC分子之间的两种类似的晶格接触由伪-4关联
1
22对称。
PDB参考
:
人红细胞过氧化氢酶1f4j
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57
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8-19
https://doi.org/10.107/S090744900014116
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尖孢镰刀菌
原子分辨率为100和283的胰蛋白酶
K: 配体结合的研究
W.里普涅夫斯基
,
斯特加德
,
M.Nörregaard-Madsen先生
,
M.道特
和
K·S·威尔逊
本文介绍了原子分辨率X射线研究的结果
尖孢F.oxysporum
胰蛋白酶及其自溶产物,在添加氨基酸精氨酸、赖氨酸和谷氨酸的情况下,研究它们在S1特异性囊中的结合。
PDB参考
:
TRY-N,1gdu
;
TRY-F,1gdq
;
TRY-ARG,1fn8
;
TRY-LYS,1gdn
;
TRY-LYS2,1fy5
;
TRY-GLN,1财年4
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57
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20-29
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人体S100A12的三维结构
O.V.莫罗兹
,
A.A.安特森
,
G.N.穆尔舒多夫
,
新泽西州梅特兰
,
G.G.多德森
,
K·S·威尔逊
,
I.Skibshöj
,
E.M.卢卡尼丁
和
I.B.布朗斯坦
人EF-hand钙结合蛋白S100A12钙结合形式的结构测定为1.95
奥分辨率。
S100家族成员之间的比较表明了S100A12靶结合区的位置,并更好地理解了对亚单位内和亚单位间疏水相互作用重要的残基的作用。
PDB参考
:
S100A12,1e8a
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57
,
30-36
https://doi.org/10.107/S09074490001402
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小牛脾嘌呤核苷磷酸化酶:与N(7)-a-环鸟苷抑制剂和磷酸阴离子的三元复合物的结构
M.Luić先生
,
G.科勒纳
,
D.舒加
,
W.Saenger先生
和
A.比佐夫斯卡
小牛脾嘌呤核苷膦酰化酶(PNP)与N(7)-酰氯鸟苷抑制剂和磷酸盐的三元配合物的晶体结构显示鸟嘌呤碱呈反向取向,而酰氯核苷链呈折叠构象。
这种新的结合模式解释了观察到的7-β底物特性-
D类
-核糖核苷,也为PNP抑制剂的设计提供了新的先导。
PDB参考
:
PNP三元配合物,1fxu
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37-43
https://doi.org/10.107/S090744900015547
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β-甘露聚糖酶的结构解析:从电子密度图到DNA序列
M.希尔奇
,
A.佩拉基斯
,
J.P.亚伯拉罕斯
,
K.冬季露营车
,
K.Piontek公司
和
S.M.格洛尔
晶体结构
富斯卡锥虫
尽管缺少氨基酸序列的主要部分,但β-甘露聚糖酶已被解决。
高质量的电子密度图为获得相应的DNA序列提供了必要的信息。
PDB参考
:
β-甘露聚糖酶,1bqc
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,
44-51
https://doi.org/10.107/S09074490001492X
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从CheY–CheA的晶体学研究进一步了解响应调节器CheY的功能机制
124–257
复杂的
P.古埃
,
N.中国路
,
M.韦尔奇
,
V.吉列特
,
S.Cabantous公司
,
C.伯克
,
L.穆里
和
J.-P.萨马马
CheY–CheA的结构
124–257
在三种条件下测定了络合物:天然形式,用磷酸化剂浸泡后和用磷酸化反应抑制剂浸泡后。
根据CheY活性位点的几何形状,这些结构说明了响应调节器的不同功能状态。
PDB参考
:
本地CheY–CheA
124–257
复杂,1ffg
;
乙酰磷酸浸泡的CheY–CheA
124–257
复杂,1ffs
;
二磷酸亚胺浸泡CheY–CheA
124–257
复杂,1ffw
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(2001).
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57
,
52-60
https://doi.org/10.107/S090744900015274
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结晶和2.2
R-藻红蛋白的光学拆分结构
江篱
:完美半面体孪晶的一个例子
C.承包商
,
J.Martinez-Oyanedel
,
M.邦斯特
,
P.罗格朗
,
C.皮拉斯
,
X.凡尔纳
和
J.-C.Fontecilla-Camps公司
R-藻红素的晶体结构已经在
R(右)
使用来自孪晶的3空间群
SHELX公司
97.第2.2节
奥分辨率精细模型显示出良好的立体化学;
这些数据也支持在R-PE的中央通道中存在连接蛋白螺旋段的提议。
PDB参考
:
R-藻红蛋白,1eyx
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57
,
61-68
https://doi.org/10.107/S090744900014578
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四方溶菌酶晶体对相对湿度变化的动态响应:对生长后晶体处理的影响
I.多布里亚诺夫
,
S.克里姆斯基
,
C.L.凯勒
,
S.G.勒梅
,
C.基默
,
A.基谢列夫
,
K·D·芬克尔斯坦
和
R.E.索恩
四方溶菌酶晶体对脱水的动态响应表现出结构转变的突变性、亚稳态和滞后特性。
更普遍的生长后晶体处理的成功可能取决于避免晶格转变,将这种转变过程中产生的无序降至最低,或保持晶格处于有序亚稳状态。
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57
,
69-81
https://doi.org/10.107/S090744900013299
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第三代同步辐射源中的X射线束/生物材料热相互作用
T.M.库扎伊
,
M.卡兹米尔扎克
和
B.J.谢长廷
发展了包括对流在内的改进热模型,取代了Helliwell的绝热近似。
温升6
K是为低温冷却100计算的
µm厚晶体,18
K表示室温风冷1
8毫米厚的晶体
千伏10
13
光子
秒
−1
毫米
−2
横梁。
晶体内部热传导的重要性也得到了仔细研究。
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57
,
82-94
https://doi.org/10.107/S090744900014098
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蛋白质、核酸、配体和溶剂的许多实际空间扭角精炼技术
T.J.奥尔德菲尔德
在建模程序中实现了许多真实空间扭角细化技术,为大分子结构追踪和建模提供了近自动化。
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《水晶学报》。
(2001).
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57
,
95-100
https://doi.org/10.1107/S907444900014244
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从头算
直接空间法测定结构:低密度消除试验
N.Matsugaki公司
和
M.Shiono先生
对低密度消除方法进行了改进,并对其进行了测试
从头算
包括蛋白质在内的几种结构的溶液。
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(2001).
D类
57
,
101-107
https://doi.org/10.107/S090744900014591
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用双波长X射线衍射测量定位晶体中的反常散射体
R.L.金斯顿
研究了蛋白质晶体中反常散射原子的结构因子振幅的计算问题。
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《水晶学报》。
(2001).
D类
57
,
108-121
https://doi.org/10.107/S090744900014608
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低密度脂蛋白颗粒的低分辨率数据分析
V.Y.Lunin先生
,
N.L.Lunina公司
,
S.Ritter公司
,
I.弗雷
,
贝尔格
,
K.Diederichs公司
,
A.D.波贾尼
,
A.乌尔珠姆塞夫
和
M.W.鲍姆斯塔克
以27的分辨率获得了低密度脂蛋白(LDL)颗粒的初步晶体学模型
使用多个
从头算
阶段化方法。
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《水晶学报》。
(2001).
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57
,
122-133
https://doi.org/10.107/S090744900014736
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使用TLS参数模拟高分子细化中的各向异性位移
M.D.Winn博士
,
M.N.Isupov先生
和
G.N.穆尔舒多夫
项目中的实施
REFMAC公司
具有少量参数的各向异性细化
通过
描述了TLS参数化。
给出了两个示例的示例结果,其中显示了免费
R(右)
因子和NCS相关分子的改进描述。
阅读文章
结晶纸
《水晶学报》。
(2001).
天
57
,
134-136
https://doi.org/10.107/S090744900013810
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重组谷胱甘肽agGST1-6的结晶
S公司
-抗DDT菌株的转移酶
冈比亚按蚊
P.H.罗伯茨
,
X.周
,
A.M.福尔摩斯
,
H.兰森
,
G.小型
,
J.海明威
,
J.D.Ng
,
L.Chen先生
和
E.J.Meehan先生
重组形式谷胱甘肽的晶体
S公司
-转移酶来自
冈比亚按蚊
,agGST1-6,已经以至少五种不同的晶体形式生长,具有广泛的有效分辨率。
阅读文章
《水晶学报》。
(2001).
D类
57
,
137-139
https://doi.org/10.107/S090744900013822
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蛾类重组化学感受蛋白(CSP2)
芸苔属哺乳动物
:结晶和初步晶体学研究
V.坎帕纳奇
,
S.斯皮内利
,
A.拉提格
,
C.勒万多夫斯基
,
K.布朗
,
M.特戈尼
和
C.坎比劳
化学传感蛋白CSP2的第一批晶体是通过悬滴蒸汽扩散法获得的。
阅读文章
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(2001).
D类
57
,
140-142
https://doi.org/10.107/S090744900014001
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玉米细胞分裂素葡萄糖苷特异性β-葡萄糖苷酶的纯化、结晶及初步X射线分析
J.Vévodová
,
J.马雷克
,
J.邹哈尔
,
B.布尔佐博哈特
和
X.-D.苏
植物中一种促生长的β-葡萄糖苷酶Zm-p60.1已经过表达、纯化并结晶。
已观察到几种晶体形式,其中一种衍射优于2.0
Å.
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《水晶学报》。
(2001).
D类
57
,
143-144
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结晶和初步X射线晶体学分析
S公司
-等位糖蛋白
S公司
2011财年
-RNase来自
烟草
K.伊达
,
T.新川
,
S.Norioka公司
,
E.纽比金
,
A.E.克拉克
,
F.坂山
和
佐藤先生
单斜晶体
花烟草
S公司
2011财年
-已获得核糖核酸酶。
本地数据已收集到1.55
使用SPring-8同步辐射源的分辨率。
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《水晶学报》。
(2001).
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57
,
145-147
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结晶和初步X射线分析(
R(右)
)-特异烯醇-CoA水合酶
鱼子气单胞菌
参与聚羟基脂肪酸生物合成
T.久野
,
T.福井
,
岩手县
和
Y.Doi(多伊)
(
R(右)
)-水合酶来自
豚鼠
参与PHA生物合成的物质已在空间群中结晶
C类
2,带单位-细胞参数
一
= 111.54,
b条
= 59.29,
c(c)
= 47.27
Å, β = 113.04°.
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57
,
148-149
https://doi.org/10.107/S090744900014232
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DFPase的结晶和初步X射线晶体学分析
寻常型Loligo vulgaris
E.I.沙尔夫
,
C.吕克尔
,
G.弗里奇
,
J.科普克
,
J.哈特莱布
,
S.Dierl公司
和
H.Rüterjans公司
来自的“squid-type”DFPase
普通乳杆菌
已被重组表达和结晶。
正交晶体衍射超过2.0
使用Cu的奥分辨率
K(K)
α辐射源。
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D类
57
,
150-152
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大肠杆菌
5′-甲硫腺苷/
S公司
-腺苷同型半胱氨酸核苷酶
J.E.李
,
K.A.康奈尔
,
M.K.里斯科
和
P.L.豪厄尔
组氨酸标记的5′-甲基硫腺苷/
S公司
-来自
大肠杆菌
过度表达和结晶。
本机数据集,完成到2.3
已收集到奥数。
阅读文章
《水晶学报》。
(2001).
D类
57
,
153-155
https://doi.org/10.107/S090744900015250
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猪肝二氢嘧啶脱氢酶的结晶及初步X射线研究
D.多布里奇
,
K.珀森
,
G.施耐德
和
Y.Lindqvist(林德奎斯特)
二氢嘧啶脱氢酶催化嘧啶碱还原为相应的5,6-二氢衍生物,这是嘧啶分解代谢途径的第一步。
这种酶的晶体衍射到至少2.5倍
和属于空间组
对
2
1
(单元-单元参数
一
= 82.0,
b条
= 159.3,
c(c)
= 163.6
Å, β = 96.1°).
阅读文章
《水晶学报》。
(2001).
天
57
,
156-158
https://doi.org/10.107/S090744900015468
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丙型肝炎病毒四spanin受体CD81大胞外结构域的结晶和初步晶体学研究
K.Kitadokoro公司
,
G.加利
,
R.佩特拉卡
,
F.法鲁吉
,
G.格兰迪
和
M.博洛尼亚
CD81是四spanin家族的成员,也是丙型肝炎病毒包膜E2糖蛋白的受体蛋白,其大的胞外结构域已被表达、纯化并随后使用坐滴气相扩散技术结晶。
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《水晶学报》。
(2001).
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57
,
159-161
https://doi.org/10.107/S09074490001559
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酵母延伸因子复合物eEF1A–eEF1Bα的结晶
L.佩德森
,
G.R.安徒生
,
C.R.Knudsen先生
,
T·G·金齐
和
J.尼博格
酵母翻译延伸因子复合物eEF1A–eEF1Bα已经结晶,数据收集到1.67
Å.
相是通过三波长MAD实验测定的,在61
kDa非对称单位。
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《水晶学报》。
(2001).
D类
57
,
162-164
https://doi.org/10.107/S090744900016413
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天然C类β-内酰胺酶的表达、纯化、结晶和初步X射线分析
阴沟肠杆菌
908R和两个突变体
J.沃特斯
,
P.查利尔
,
D.蒙奈
,
J.-M.Frère先生
和
E.Fonzé
C类β-内酰胺酶的表达、纯化和结晶
阴沟肠杆菌
报告了908R和两点突变株(S64C和S84C)以及初步的X射线分析。
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《水晶学报》。
(2001).
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57
,
165-167
https://doi.org/10.107/S090744900014918
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甘油脱氢酶S305C突变体的纯化、结晶及四级结构分析
嗜热脂肪芽孢杆菌
J.伯克
,
S.鲁日尼科夫
,
S.塞德尔尼科娃
,
P.贝克
,
D.福尔摩斯
,
N.缪尔
,
M.戈尔
和
D.大米
在NAD存在和不存在的情况下,以硫酸铵和聚乙二醇400为沉淀剂,采用悬挂滴气相扩散法获得了S305C-GlyDH突变体的晶体
+
晶体属于空间群
我
422,具有近似的单元-单元参数
一
=
b条
= 105,
c(c)
= 149
以及不对称单元中的一个亚基,对应于2.6的堆积密度
Å
三
Da公司
−1
.
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《水晶学报》。
(2001).
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57
,
168-171
https://doi.org/10.107/S090744900017376
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完整人免疫球蛋白b12的结晶和初步结构测定:一种广泛中和HIV-1主要分离物的抗体
E.O.蓝宝石
,
P.W.H.I.帕伦
,
C.F.Barbas三世
,
D.R.伯顿
和
I.A.威尔逊
具有全长铰链的完整人类免疫球蛋白首次结晶为所有免疫球蛋白结构域有序的形式。
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《水晶学报》。
(2001).
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57
,
172-173
https://doi.org/10.107/S09074490001756X
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与配子体自交不亲和相关的日本梨S-RNase的纯化和结晶
松浦泰明
,
M.Unno先生
,
H.酒井
,
T.筑原
和
S.Norioka公司
日本梨S的单斜晶体
三
-已获得核糖核酸酶。
本地数据已收集到1.5
使用SPring-8同步辐射源的分辨率。
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国际晶体学联合会
《水晶学报》。
(2001).
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57
,
174-179
https://doi.org/10.107/S090744900016383
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