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生物
结晶学
第56卷
|
第12部分
国际标准编号:1399-0047
2000年12月发行
封面插图:
带有蛋白质的核小体核心颗粒,由二级结构元件的带状模型表示,DNA指示互补链之间的碱基配对(
第1513页
).
研究论文
《水晶学报》。
(2000).
D类
56
,
1513-1534
doi:10.1107/S0907444900011847
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2.5时核小体核心粒子的不对称性
奥数分辨率
J.M.竖琴
,
B.L.汉森
,
D.E.蒂姆
和
G.J.邦克
2.5时核小体核心粒子的结构
给出了分辨率。
研究和讨论了结构中发现的不对称现象,以及离子结合、水合和晶格堆积相互作用的细节。
PDB参考
:
核小体核心粒子,1eqz
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《水晶学报》。
(2000).
D类
56
,
1535-1540
doi:10.1107/S090744900012002
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利用核磁共振模型进行分子替换的系统案例研究:重访p53四聚结构域
Y.W.Chen先生
和
G.M.克洛尔
一项系统的分子置换案例研究揭示了核磁共振搜索模型的准确性与溶液的清晰度和质量之间的近似相关性。
研究发现,集合模型比单平均模型在不准确性方面有更大的容忍度,并且更有可能取得成功。
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《水晶学报》。
(2000).
D类
56
,
1541-1548
doi:10.1107/S090744900012749
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R(右)
6
六聚胰岛素与
米
-甲酚或间苯二酚
G.D.史密斯
,
E.西萨克
,
L.A.Magrum公司
,
W.A.Pangborn公司
和
R.H.祝福
三个R的结构
6
报道了六聚体胰岛素结构,其中两个是单斜的,并与其中之一络合
米
-甲酚或间苯二酚,以及与
米
-甲酚。
PDB参考
:
单斜间苯二酚-胰岛素,1evr
;
单斜的
米
-甲酚-胰岛素,1ev6
;
菱形的
米
--甲酚-胰岛素,1ev3
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《水晶学报》。
(2000).
D类
56
,
1549-1553
doi:10.1107/S090744900013901
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根据高分辨率X射线粉末衍射数据确定的第一个蛋白质晶体结构:T的变体
三
R(右)
三
研磨制备人胰岛素锌复合物
R.B.冯·德雷勒
,
P.W.斯蒂芬斯
,
G.D.史密斯
和
R.H.祝福
高分辨率同步辐射X射线粉末衍射数据已用于求解一种新的变种T的晶体结构
三
R(右)
三
通过机械研磨多晶样品产生的人胰岛素-锌复合物。
PDB参考
:
T型
三
R(右)
三
胰岛素-锌复合物,1fub
;
T型
三
R(右)
三
DC胰岛素-锌复合物,1fu2
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《水晶学报》。
(2000).
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56
,
1554-1559
doi:10.1107/S0907444900011987
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从头算
4189原子蛋白质结构在1.2时的相位
奥数分辨率
J.R.H.塔姆
相位直接由59个
kDa蛋白OppA与铀酰离子共结晶。
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(2000).
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56
,
1560-1568
doi:10.1107/S0907444900012889
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CBD中IIIa家族支架的结构
纤维素梭菌
第2.2页
奥数分辨率
L.J.W.西蒙
,
S.PagèS公司
,
A.贝莱奇
,
J.-P.贝莱奇
,
E.A.拜耳
,
R.拉米德
,
Y.肖姆
和
F.弗罗洛
细胞壁支架亚基IIIa族纤维素结合域(CBD)的晶体结构
C.纤维素分解
已确定。
事实证明,该结构与之前阐述的CBD脚手架非常相似
C.热电偶
这使得能够对各种CBD家族中浅槽和纤维素结合面的可能功能后果进行比较分析。
PDB参考
:
中央商务区1g43
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《水晶学报》。
(2000).
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56
,
1569-1576
doi:10.1107/S090744900013342
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锌/钙和镉/镉取代刀豆球蛋白A:金属结合、pH和分子堆积的相互作用
J.布卡特
,
R.洛里斯
和
L.Wyns公司
pH值为6.15的ZnCa-conA和pH值为5.0的CdCd-conA的晶体结构揭示了晶体环境在蛋白质表面结构中的作用。
建立了con A亚基的替代分子包装,以满足pH、四元结构和晶体包装的相互依赖条件。
这些填料通过形成补充金属结合位点S3和S4进一步稳定。
PDB参考
:
氧化锌
pH值6.15
、3enr
;
镉镉
5.0比索
,2enr
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《水晶学报》。
(2000).
D类
56
,
1577-1582
doi:10.1010/S090744490001461X
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细胞色素的结构
c(c)
6
来自红藻
条斑紫菜
1.57
奥数分辨率
山田S.Yamada
,
S.-Y.公园
,
H.清水
,
Y.Koshizuka先生
,
卡多库拉
,
T.佐藤
,
K.Suruga公司
,
小川先生
,
Y.伊索盖
,
T.西雄
,
Y.Shiro先生
和
T.奥库
细胞色素的晶体结构
c(c)
6
来自红藻
条斑潜蝇
已确定为1.57
奥分辨率。
真核红藻细胞色素的序列和结构
c(c)
6
与原核蓝藻细胞色素非常相似
c(c)
6
而不是真核绿藻
c(c)
6
细胞色素。
PDB参考
:
细胞色素
c(c)
6
,1gdv
阅读文章
《水晶学报》。
(2000).
D类
56
,
1583-1590
doi:10.1107/S090744900010271
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通过ESI–MS和MALDI–MS表征晶体含量
N.波特
,
V.拉穆尔
,
A.波特斯曼
,
J.C.蒂埃里
,
D.莫拉斯
和
A.范·多塞勒
描述了一种基于质谱的快速鉴定大分子晶体含量的通用方法。
阅读文章
《水晶学报》。
(2000).
D类
56
,
1591-1611
doi:10.1107/S0907444900011859
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ConfMatch(一致性匹配)
:通过匹配构象自动解释电子密度图
C.E.王
ConfMatch(一致性匹配)
是一种全局真实空间拟合程序,它直接从初始电子密度图构建详细的蛋白质模型。
实验表明
ConfMatch(配置匹配)
可能能够完全自动化小蛋白质密度图的解释。
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《水晶学报》。
(2000).
D类
56
,
1612-1621
doi:10.1107/S090744900013263
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实空间和互易空间中的一般二次函数及其在似然相位估计中的应用
K.Cowtan公司
在工作变量的傅里叶变换下,研究了一类二次求和的性质。
研究了与往复空间(类锂基)溶剂压扁的关系。
阅读文章
《水晶学报》。
(2000).
D类
56
,
1622-1624
doi:10.1107/S090744900013780
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分子替换中的多副本搜索方法
A.瓦金
和
A.特普利亚科夫
分子置换方法已经扩展到使用特殊的翻译函数同时搜索单位细胞中大分子的多个拷贝。
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《水晶学报》。
(2000).
D类
56
,
1625-1629
doi:10.1107/S090744900014104
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无激动剂的AMPA受体结合域结晶:碳水化合物含量和闪冷条件的重要性
J.Féthière
,
A.安德松
,
K.Keinánen
和
D.R.马登
酶解糖基化和MPD低温保护将无激动剂AMPA受体配体结合域晶体的分辨率从7提高到2.6
Å.
阅读文章
结晶纸
《水晶学报》。
(2000).
D类
56
,
1630-1633
doi:10.1107/S090744900010726
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核糖体活化大肠杆菌素细胞毒结构域与其免疫蛋白复合物的结晶
S.Carr公司
,
D.沃克
,
R.詹姆斯
,
C.克兰托斯
和
A.M.海明斯
核糖体激活的大肠杆菌素E3与其抑制剂免疫蛋白复合体中的核糖核酸酶结构域已被囊化。
晶体属于太空群
P(P)
三
1
21或其对映体,带单位-细胞参数
一
=
b条
= 93.7,
c(c)
=76.2
Å.
假设不对称单元中的络合物的单一副本产生72%的溶剂含量,当闪速冷冻到100时
K这些晶体衍射到2.4的分辨率
Å.
阅读文章
《水晶学报》。
(2000).
D类
56
,
1634-1637
doi:10.1107/S0907444900011835
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结晶
结核分枝杆菌
细胞视点蛋白FtsZ
A.K.W.Leung先生
,
E.L.怀特
,
L.J.罗斯
和
D.W.博哈尼
描述了分枝杆菌必需的细胞视觉蛋白FtsZ的几种晶体形式,包括与新型聚合抑制剂SRI-7614的复合物。
阅读文章
《水晶学报》。
(2000).
D类
56
,
1638-1640
doi:10.1107/S090744900012208
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一种豆科植物的凝集素
刺槐
两种晶体形式的结晶:初步衍射分析
A.拉比恩斯
,
C.动词
,
E.J.M.范·达姆
,
W.J.Peumans公司
和
C.J.德·兰特
适用于结构分析的晶体由RPbAI制备而成,RPb AI是一种豆科植物凝集素
假刺槐
.
阅读文章
《水晶学报》。
(2000).
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56
,
1641-1643
doi:10.1107/S0907444900012671
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视黄醇脱水酶的结晶
食果夜蛾
:通过乙基硫汞水杨酸盐改性提高晶体质量
S.Pakhomova公司
,
J.G.Luz(卢兹)
,
小林先生
,
D.梅尔曼
,
J.巴克
和
M.E.新人
通过乙基汞对蛋白质进行共价修饰,视黄醇脱水酶晶体的质量显著提高。
阅读文章
《水晶学报》。
(2000).
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56
,
1644年至1646年
doi:10.1107/S0907444900012683
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神经溶素的结晶及初步分析
W.Lian女士
,
G.陈
,
D.吴
,
C.K.布朗
,
K·马杜斯
,
L.B.赫什
和
D.W.罗杰斯
神经肽酶神经溶素的晶体已经产生,并显示出衍射到高分辨率。
圆二色性研究和基于序列的预测表明,该酶主要是α螺旋。
阅读文章
《水晶学报》。
(2000).
D类
56
,
1647-1651
doi:10.1107/S0907444900012695
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参与聚酮生物合成的黄素蛋白羟化酶——四环素A2加氧酶的结晶和初步X射线分析
J.贝农
,
小E.R.Rafanan
,
B.沈
和
A.J.费希尔
四角霉素A2加氧酶催化聚酮天然产物四角霉素C生物合成的最后一步。四角霉酶A2加氧酶类含有FAD辅因子,催化一种新的三羟化反应。
阅读文章
《水晶学报》。
(2000).
D类
56
,
1652年-1655年
doi:10.1107/S0907444900012713
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结晶和初步X射线衍射分析
消息传递程序
I限制性内切酶及其同源DNA复合物
T.J.O’Loughlin公司
,
Q.徐
,
R.B.库塞拉
,
L.F.多纳
,
S.斯威尼
,
一、席尔德克劳特
和
H.-C.郭
结晶和初步表征
消息传递程序
报道了I限制性内切酶-DNA复合物。
晶体属于单斜空间群,衍射超过2.0
Å.
阅读文章
《水晶学报》。
(2000).
D类
56
,
1656-1658
doi:10.1010/S0907444900012890
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牛乳中分离的黄嘌呤脱氢酶和黄嘌呤氧化酶的纯化、结晶及初步X射线衍射研究
B.T.Eger公司
,
冈本康夫
,
C.恩罗斯
,
佐藤先生
,
T.西野
,
E.F.Pai公司
和
T.西野
黄嘌呤氧化还原酶的脱氢酶和氧化酶形式的结构已经确定。
阅读文章
《水晶学报》。
(2000).
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56
,
1659-1661
doi:10.1107/S0907444900012907
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蚯蚓纤溶酶组分A的结晶及初步X射线分析
恶臭艾森氏菌
Y.Tang(唐英年)
,
J.张
,
L.桂
,
C.吴
,
R.风机
,
W.Chang先生
和
D.梁
蚯蚓纤溶酶组分A是一种兼具直接纤溶酶和纤溶酶原激活剂功能的蛋白质,已在正交空间群中结晶
P(P)
2
1
2
1
2
1
单晶衍射到1.95
Å分辨率。
阅读文章
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56
,
1662-1664
doi:10.1010/S090744490001297X文件
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小鼠末端脱氧核苷酸转移酶催化结构域的结晶
N.苏库马尔
,
J.B.布勒
,
N.专家-贝赞松
,
N.乔丹
,
J.莱斯卡
,
F.红葡萄酒
,
C.巴巴尼科劳
和
M.德拉鲁
小鼠末端脱氧核苷酸转移酶的催化结构域已结晶为活性形式。晶体衍射高达2.4
奥分辨率。
阅读文章
《水晶学报》。
(2000).
D类
56
,
1665-1667
doi:10.1107/S090744900013251
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重组蛋白的结晶及初步晶体学表征
L(左)
-甲硫氨酸-α-脱氨基-γ-巯基甲烷裂解酶(甲硫氨酸酶)
V.斯里达尔
,
徐先生
,
Q.韩
,
十、太阳
,
Y.Tan先生
,
R.M.霍夫曼
和
G.S.普拉萨德
重组
L(左)
-蛋氨酸-α-脱氨基-γ-巯基甲烷裂解酶
恶臭杆菌
已经结晶。
本地数据已收集到2.68
同步辐射X射线的光学分辨率。
阅读文章
《水晶学报》。
(2000).
D类
56
,
1668-1669
doi:10.1107/S09074490001305
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内聚半乳糖醛酸酶SE1的结晶及初步X射线分析
青霉丝孢菌
C.-T.鲁
,
T.塔达
,
Y.中村
,
K.瓦达
,
西村K.Nishimura
,
Y.Katsuya先生
,
M.Sawada先生
,
M.高雄
和
T.酒井
内聚半乳糖醛酸酶SE1来自
青霉木霉
结晶并衍射到2.0
奥分辨率。
晶体属于六方空间群
P(P)
6
1
或
P(P)
6
5
,带有单位-细胞参数
一
=
b条
= 135.0,
c(c)
= 70.7
Å, γ = 120°.
阅读文章
《水晶学报》。
(2000).
D类
56
,
1670-1672
doi:10.1107/S09074490001317
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17β-雌二醇复合物中重组Fab片段的结晶和初步X射线分析
U.Lamminmäki公司
和
J.坎卡尔
重组抗17β-雌二醇Fab片段在雌二醇存在和不存在的情况下,通过微注射和共结晶过度表达、纯化和结晶。
晶体衍射到2.0
分辨率和允许高分辨率X射线结构测定。
阅读文章
《水晶学报》。
(2000).
D类
56
,
1673-1675
doi:10.1107/S09074490001366
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腺苷酸硫酸还原酶的结晶及初步X射线分析
富氏古球虫
A.罗斯
,
G.弗里茨
,
T.Bü燧石
,
H.Huber(胡贝尔)
,
K.O.Stetter公司
,
尤·埃姆勒
和
P.M.H.Kroneck先生
腺苷硫酸还原酶来自
A.富列杜斯
在厌氧条件下进行纯化和结晶。
X射线衍射测量表明晶体衍射超过2.0
奥分辨率。
阅读文章
《水晶学报》。
(2000).
D类
56
,
1676-1679
doi:10.1010/S0907444900013378
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鼠疫杆菌主要毒力因子YopM的过度生产、纯化、结晶和初步X射线衍射分析
鼠疫耶尔森菌
A.G.埃夫多基莫夫
,
D.E.安德森
,
K.M.Routzahn先生
和
D.S.Waugh先生
晶体
鼠疫耶氏菌
通过蒸汽扩散法获得了毒力因子YopM。
最好的晶体衍射到2.4
分辨率和属于空间组
P(P)
4
2
22
阅读文章
《水晶学报》。
(2000).
D类
56
,
1680-1684
doi:10.1107/S090744900013627
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人蛋白激酶CK2晶体的结晶及初步表征
K.尼芬
,
B.格拉
,
一、埃尔马科娃
和
O.-G.伊斯辛格
四聚体蛋白激酶CK2全酶
智人
首次成功结晶。
晶体对X射线的衍射至少为3.5
奥分辨率。
阅读文章
《水晶学报》。
(2000).
D类
56
,
1685-1687
doi:10.1107/S090744900015262
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鱼类血红蛋白I的碳氧形式的结晶、初步X射线分析和分子置换溶液
头石脂鲤
R.T.本田
,
P.德拉托雷
,
V.法德尔
,
F.坎杜里
,
M.Dellamano先生
,
小W.F.de Azevedo
和
G.O.博尼拉·罗德里格斯
本文研究了鱼类血红蛋白I羧基形式的结晶、初步X射线分析和分子置换溶液
B.头
描述了。
阅读文章
《水晶学报》。
(2000).
D类
56
,
1688-1690
doi:10.1010/S0907444900015298
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糖醇丙酮酸磷酸二激酶的结晶及初步晶体学研究
布氏锥虫
L.W.科森扎
,
F.布林奥德
,
T.巴尔茨
和
F.M.D.Vellieux公司
糖质酶丙酮酸磷酸二激酶
布氏锥虫
已在太空群中结晶
P(P)
2
1
2
1
2.答3.0
奥分辨率本机数据集已在277收集
K使用单色同步辐射。
阅读文章
《水晶学报》。
(2000).
D类
56
,
1691-1693
doi:10.1010/S0907444900015304
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GlpE晶体,a 12
kDa硫转移酶来自
大肠杆菌
,显示1.06
奥分辨衍射初步报告
D.博尔多
,
T.J.拉尔森
,
J.L.多纳休
,
A.角膜炎
和
博洛涅西
GlpE是第一个由单一的类罗丹烷结构域组成的硫转移酶。
晶体属于
P(P)
三
1
(或
P(P)
三
2
)空间群,每个不对称单元有一个分子。
阅读文章
《水晶学报》。
(2000).
D类
56
,
1694-1695
doi:10.1107/S090744900015316
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一种功能未知的“ORFan”蛋白b0220的结晶和初步晶体学研究
大肠杆菌
C.阿贝格尔
,
V.蒙乔伊斯
,
S.Chenivesse公司
,
S.杰迪
和
J.-M.克拉维里
第一个
大肠杆菌
ORFan基因产物已被克隆、表达、纯化和结晶。
使用硒的MAD方法求解硒代蛋氨酸取代的b0220蛋白质结构。
阅读文章
《水晶学报》。
(2000).
D类
56
,
1696-1698
doi:10.1107/S09074490001860
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晶体的结晶和初步表征
R(右)
-乙醇脱氢酶
短乳杆菌
K.尼芬
,
B.里贝尔
,
J.米勒
,
W.Hummel公司
和
D.朔姆堡
这个
R(右)
-特异性乙醇脱氢酶
短乳杆菌
成功结晶。
晶体对X射线的衍射至少为1.8
Å分辨率。
阅读文章
短通信
《水晶学报》。
(2000).
D类
56
,
1699-1701
doi:10.1107/S090744900013573
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两种依赖pH的细胞色素的结晶和初步X射线分析
c(c)
2
从
沼泽红假单胞菌
G.加劳
,
热血链球菌
,
L.兰达乔
,
L.Vaccari公司
和
M.S.Viezzoli先生
细胞色素
c(c)
2
从
美洲狗鱼蛙
以两种不同的晶体形式结晶:pH 4.4下的单斜晶体和pH 9.0下的三角晶体。
初步结构表明,由于氨分子取代Met配体,在碱性pH下获得的三角形式的铁配位环境发生了重要变化。
阅读文章
补遗和勘误表
《水晶学报》。
(2000).
D类
56
,
1702
doi:10.1107/S09074490001739X
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用直接法测定了从马来亚克拉伊特分离出的一种新型毒素布卡丁的原子分辨结构。
勘误表
P.库恩
,
A.M.执事
,
D.-S.康萨
,
G.拉贾塞格
,
R.M.基尼
,
I.乌森
和
P.R.科拉特卡尔
论文的勘误表
库恩
等。
(2000)
《水晶学报》。
D类
56
, 1401–1407
.
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