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生物学的
结晶学
第56卷
|
第4部分
国际标准编号:1399-0047
2000年4月发行
封面插图:
由于多肽中的结构域冗余,三个折叠相关亚单位创建了伪32对称的刀豆球蛋白分子(
第411页
).
研究论文
《水晶学报》。
(2000).
D类
56
,
381-388
doi:10.1107/S0907444900000469
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一类有效HIV-1蛋白酶抑制剂P1–P3组的替代结合位点,是蛋白酶80s环协同结构变化的结果
S.Munshi公司
,
Z.陈
,
Y.Yan先生
,
Y.Li(李彦宏)
,
D.B.奥尔森
,
H.B.肖克
,
B.B.加尔文
,
B.多尔西
和
郭台铭
HIV蛋白酶抑制剂L-756423与HIV-1野生型蛋白酶的复合体,以及Indinavir和Saquinavir各自与含有九点突变的突变蛋白酶的复合物的结构已经确定。
对这些结构的比较分析揭示了Indinavir和L-756423的P1–P3组的交替结合囊。
PDB参考
:
9X突变HIV-1蛋白酶–Indinavir复合物,1c6y
;
野生型HIV-1蛋白酶-L-756423复合物,1c70
;
9X突变HIV-1蛋白酶-L-739622复合物,1c6x
;
9X突变HIV-1蛋白酶–Saquinavir复合物,1c6z
阅读文章
《水晶学报》。
(2000).
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56
,
389-397
doi:10.1107/S0907444900001694
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菠菜乙酰羟基酸异构酶与其反应产物二羟甲基戊酸盐、锰和(磷酸)-ADP-核糖络合的结构
K.托马佐
,
R.杜马
,
F.哈尔甘德
,
E.森林
,
杜斯(R.Douce)
和
V.生物
1.6
介绍了乙酰羟基酸异构酶与其反应产物戊酸二羟甲基酯之间络合物的结构。
PDB参考
:
异构酶还原酶-二羟甲基戊酸盐复合物,1qmg
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《水晶学报》。
(2000).
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56
,
398-405
doi:10.1107/S0907444900001232
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噬菌体PP7的结构测定
铜绿假单胞菌
:从较差的数据到良好的地图
K.焦油
,
K.弗里堡
,
M.束
和
L.利贾斯
噬菌体PP7以三种不同的形式结晶,均为空间群
P(P)
每个细胞有两个二十面体颗粒。
结构求解为3.7
使用这些晶体形式之一的分辨率。
PDB参考
:
噬菌体PP7,1dwn
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《水晶学报》。
(2000).
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56
,
406-410
doi:10.1107/S0907444900001487
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人α-凝血酶与纤维蛋白肽A(7–16)复合的Ser195Ala突变体的结构:残余催化活性的证据
R.克里希南
,
J.E.萨德勒
和
A.图林斯基
已证明α-凝血酶的Ser195Ala突变体通过在Arg16-Gly17水解纤维蛋白肽A(7-22)而具有残余催化活性。
PDB参考
:
FPA(7–16)–突变凝血酶,1dm4
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《水晶学报》。
(2000).
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56
,
411-420
doi:10.1107/S0907444900002237
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菜豆中刀豆蛋白2.1和2.0两种晶型的精细结构
奥数分辨率
T.-P.Ko公司
,
J.天
和
A.麦克弗森
种子蛋白刀豆球蛋白的结构已精炼至约2.0
以立方和六角形单元表示。
该蛋白质的结构已与同源分子进行了比较。
PDB参考
:
卡那瓦林,立方,2杯
;
卡那瓦林,六角,2cav
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《水晶学报》。
(2000).
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56
,
421-430
doi:10.1107/S0907444900000597
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酵母5-氨基乙酰丙酸脱水酶的MAD分析:用于结构测定和确定金属结合位点
P.T.厄斯金
,
E.M.H.杜克
,
I.J.搔痒
,
N.M.高级
,
M.J.沃伦
和
J.B.库珀
在上一期
结晶学学报D辑:生物结晶学
Eileen Jaffe综述了卟啉原合成酶的结构和功能。
在本文中,我们描述了为解决该家族中酶的第一结构而进行的MAD分析,以及这些实验是如何揭示其金属结合特性的。
PDB参考
:
汞络合物,1qml
;
铅络合物,1qnv
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(2000).
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56
,
431至441
doi:10.1107/S0907444900000834
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高原子分辨率单波长反常色散的应用
D.E.布罗德森
,
E.de La Fortelle公司
,
C.冯海因
,
G.布里科内
,
J.尼博格
和
M.Kjeldgaard先生
描述了在晶体学中使用单波长异常色散测量的两个示例。
这些例子概述了异常信号的各种应用,取决于它是强信号还是弱信号。
阅读文章
更正
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(2000).
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56
,
442至450
doi:10.1107/S090744999016868
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R(右)
自由的
和
R(右)
自由的
比率。
二、。
大分子最小二乘求精中交叉验证统计的期望值和方差的计算
I.J.搔痒
,
R.A.拉斯科夫斯基
和
D.S.莫斯
在本系列的第一部分中,自由利率的预期值的估计
R(右)
标准系数
R(右)
给出了结构细化收敛的因子。
在此,给出了该比率方差的估计值,并将其与选定精细结构的预期值的观测偏差进行了比较。
本文讨论了结构-因素模型函数形式中的错误以及其他类型的错误如何影响该比率。
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56
,
451-457
doi:10.1107/S0907444900000573
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直接法阶段中的散装溶剂校正
D.Y.Guo先生
,
R.H.祝福
和
D.A.兰斯
代数分析得出了塞尔方程和切线公式的体积-固体修正形式,并通过对分子量约为100和150的两种蛋白质结构的经验数值计算进行了验证
千帕。
阅读文章
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结晶纸
《水晶学报》。
(2000).
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56
,
458-459
doi:10.1107/S0907444900000718
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头孢菌素C酰化酶的结晶及初步X射线分析
假单胞菌属
sp.菌株N176
T.基诺西塔
,
T.塔达
,
Y.斋藤
,
石井Y.Ishii
,
A.佐藤
和
村田先生
头孢菌素C酰化酶来自
假单胞菌属
菌株N176已经结晶。
晶体衍射到2.7
和属于空间组
P(P)
4
1
2
1
2或
P(P)
4
3
2
1
2
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《水晶学报》。
(2000).
D类
56
,
460-463
doi:10.1107/S0907444900000706
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结构研究
无乳链球菌
透明质酸裂解酶
M.J.杰德泽哈斯
和
L.香塔拉特
截短但完全活跃的晶体
无乳链球菌
已经通过蒸气扩散法获得了透明质酸裂解酶。
对初步的X射线衍射结果进行了讨论。
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《水晶学报》。
(2000).
D类
56
,
464-465
doi:10.1107/S0907444900000913
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碱性木聚糖酶的结晶及初步X射线分析
N.鲁
,
H.森山
,
S.Nakamura公司
,
佐藤(T.Sato)
和
N.田中
碱性木聚糖酶(木聚糖苷酶J)的结晶
芽孢杆菌
通过降低蛋白溶液的温度来生长sp.41M-1。
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《水晶学报》。
(2000).
D类
56
,
466-468
doi:10.1107/S0907444900000925
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磷脂酶D的结晶和初步X射线衍射研究
链霉菌
服务提供商。
I.雷罗斯
,
E.霍夫
,
P.D’Arrigo先生
,
G.卡雷亚
,
G.佩德罗奇·芬托尼
,
F.塞昆多
和
S.Servi公司
结晶,数据收集至1.4
Φ和54的结构测定
kDa磷脂酶D来自
链霉菌
报道了利用单个钨酸盐离子的多波长反常色散产生的sp.应变PMF。
阅读文章
《水晶学报》。
(2000).
D类
56
,
469-471
doi:10.1010/S0907444900000937
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脂肪酸应答转录因子FadR的结晶和X射线衍射研究
大肠杆菌
D.M.F.范阿尔滕
,
J.克努森
,
C.C.迪鲁索
,
T.Kokko公司
和
R.K.维伦加
FadR已结晶并进行了初步衍射研究。
获得了两种晶体形式,均衍射至3.5
在旋转阳极发生器上。
阅读文章
《水晶学报》。
(2000).
D类
56
,
472-474年
doi:10.1107/S09074449900000949
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天然和硒代亚硫基酵母乳清蛋白5′-磷酸去羧化酶的结晶
B.G.米勒
,
A.M.哈塞尔
,
M.V.米尔本
和
S.A.短裤
天然和硒代亚砜重组酵母鸟氨酸5′-磷酸脱羧酶产生的晶体衍射小于2.2
Å.
ODCase与6-羟基尿苷5′-单磷酸(假定的过渡态类似物)的共晶衍射小于2.5
Å。
阅读文章
《水晶学报》。
(2000).
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56
,
475-477
doi:10.1107/S0907444900000950
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液泡H必需亚基VMA13p的克隆、表达和结晶
+
-的ATP酶
酿酒酵母
M.萨格曼
和
B.W.马修斯
我们已经获得了细胞液泡V-ATP酶VMA13p亚单位的晶体
酿酒酵母
这种亚单位对于催化是必需的,但对于酶的组装或靶向不是必需的。
阅读文章
《水晶学报》。
(2000).
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56
,
478-480
doi:10.1107/S0907444900000986
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天然和重组人胆盐依赖脂肪酶的结晶和初步X射线分析:提高衍射质量的策略
R.L.金斯顿
,
H.M.贝克
,
K.M.织机
,
L.Bläckberg先生
,
O.赫内尔
和
E.N.贝克
为了获得合适的人胆盐依赖性脂肪酶晶体,人们采用了多种策略,包括使用酶的修饰形式和重组形式。
阅读文章
《水晶学报》。
(2000).
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56
,
481-483
doi:10.1107/S0907444900001189
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一种单加氧酶的结晶和初步X射线衍射研究
腔色链霉菌
参与聚酮肌动蛋白生物合成的A3(2)
S.G.肯德鲁
,
费德里奇
,
C.萨维诺
,
A.迈勒
,
E.N.G.沼泽
和
B.瓦隆
芳香族单加氧酶ActVA-Orf6
天竺葵
A3(2)在放线菌素生物合成途径上催化一种不寻常的氧化,现已结晶。
阅读文章
《水晶学报》。
(2000).
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56
,
484-488
doi:10.1107/S0907444900001244
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筛选结晶过程中作为重要变量的同源基因:tRNA修饰酶S-腺苷硫堇:tRNA核糖基转移酶/异构酶的初步X射线衍射研究
C.格林
,
G.克莱布
,
R.菲克纳
和
K.路透社
来自12个真细菌来源的tRNA修饰酶S-腺苷蛋氨酸:tRNA核糖基转移酶/异构酶(QueA)的编码基因在
大肠杆菌
并将所得产物纯化至均匀并进行结晶试验。
适用于X射线衍射实验的晶体仅从
队列A
基因产物
枯草杆菌
.
阅读文章
《水晶学报》。
(2000).
D类
56
,
489-491
doi:10.1107/S0907444900001542
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人心脏转氢酶的NADP(H)结合组分(dIII):结晶和初步晶体学分析
S.J.皮克
,
J.B.杰克逊
和
S.A.怀特
首次获得了烟酰胺核苷酸转氢酶的初步晶体数据。
答2.1
已使用
R(右)
合并
6.8%。
阅读文章
《水晶学报》。
(2000).
D类
56
,
492-494
doi:10.1107/S0907444900001700
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酵母精氨酸-tRNA合成酶-酵母tRNA的结晶和初步X射线晶体学分析
精氨酸
复合体
B.德拉古特
,
G.基思
,
D.莫拉斯
和
J.卡瓦雷利
酵母精氨酸-tRNA合成酶复合物的三种不同晶型
蜡样链球菌
(yArgRS)和酵母第二大tRNA
精氨酸
(tRNA
)等受主用悬挂滴蒸气扩散法结晶,其中一种衍射到2.2
奥分辨率。
晶体结构已通过分子置换法解决。
阅读文章
《水晶学报》。
(2000).
D类
56
,
495-497年
doi:10.1107/S0907444900001724
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鲶鱼血红蛋白I的纯化、结晶及初步X射线分析
异尖脂肪肉瘤
A.L.S.斯马拉
,
小W.F.de Azevedo
,
V.法德尔
,
P.德拉托雷
,
M.Dellamano先生
,
M.F.科伦坡
和
G.O.博尼拉·罗德里格斯
鱼类血红蛋白I的结晶和初步X射线分析
茴香属
已报告。
阅读文章
《水晶学报》。
(2000).
D类
56
,
498-500
doi:10.1107/S0907444900001736
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工程的结晶
黄栖热菌
地球和微重力条件下的5S rRNA
S.洛伦兹
,
M.Perbandt先生
,
C.李普曼
,
K.摩尔
,
L.J.德卢卡斯
,
C.贝策尔
和
V.A.埃尔德曼
黄曲霉
分子量约为40kDa的5S rRNA在5′端和3′端被修饰,并在地球和微重力条件下获得晶体。
完整的数据集为7.8
获得了光学分辨率。
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《水晶学报》。
(2000).
D类
56
,
501-503
doi:10.1107/S0907444900001918
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鱿鱼神经元Sec1的结晶和初步X射线分析
A.支架
,
T.德累斯巴赫
,
H.贝茨
和
W.威森霍恩
鱿鱼神经元Sec1是一种进化保守蛋白,参与神经传递的调节。
空间群晶体
P(P)
3
1
21衍射到3.3
通过His-tagged构造获得了Δ分辨率。
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《水晶学报》。
(2000).
D类
56
,
504至505
doi:10.1107/S0907444900002626
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人二磷酸核苷激酶A的结晶和初步X射线晶体学分析
K.最小值
,
S.Y.Kim先生
,
香港宋
,
C.张
,
S.-J.Cho
,
J.月亮
,
J.K.杨
,
J.Y.Lee先生
,
K.-J.李
和
S.W.Suh先生
在空间群中获得了人核苷二磷酸激酶A的晶体
P(P)
2
1
X射线衍射数据已收集到2.15
奥分辨率。
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《水晶学报》。
(2000).
D类
56
,
506-508
doi:10.1107/S0907444900002195
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蛋白质L B1 IgG结合域突变体的结晶和初步X射线衍射研究
大型消化链球菌
K.约翰森
,
J·W·奥尼尔
,
D.E.金
,
D.贝克
和
K.Y.J.Zhang先生
蛋白质L野生型B1结构域的一种含色氨酸的变体和两个突变体Lys61Ala和Val49Ala已经结晶。
已收集野生型和Lys61Ala和Val49Ala突变体的完整数据集,分辨率为1.7、2.3和1.8
分别为:。
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《水晶学报》。
(2000).
D类
56
,
509-511
doi:10.1107/S090744900000081
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一种新晶型的结晶和初步晶体学研究
大肠杆菌
L(左)
-天冬酰胺酶II(Ser58Ala突变)
M.科扎克
和
M.Jaskólski先生
大肠杆菌
L(左)
-具有Ser58Ala突变的天冬酰胺酶II以新的正交形式结晶(空间群
P(P)
2
1
2
1
2) 不对称单元中有六个蛋白质分子。
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《水晶学报》。
(2000).
D类
56
,
512-515
doi:10.1107/S0907444900002377
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莽草酸脱氢酶的结晶和初步X射线分析
大肠杆菌
J.麦克林
,
S.A.坎贝尔
,
K.波洛克
,
S.Chackrewarthy公司
,
J.R.科金斯
和
A.J.拉普索恩
莽草酸脱氢酶来自
大肠杆菌
采用蒸汽扩散法,以硫酸铵为沉淀剂进行结晶。
质谱法证实了酶的纯度,并使用动态光散射来寻找合适的添加剂以获得单分散的酶溶液。
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《水晶学报》。
(2000).
D类
56
,
516-519
doi:10.1107/S0907444900002389
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一种新型晶体的初步X射线分析
大肠杆菌
KDO8P合成酶
S.Radaev公司
,
P.达斯蒂达尔
,
M.帕特尔
,
R.W.伍德德
和
D.L.加蒂
来自单斜晶体和立方晶体的KDO8P合成酶的结构证实了该酶是四聚体,而不是早期生化研究所建议的三聚体。
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《水晶学报》。
(2000).
D类
56
,
520-523
doi:10.1107/S09074449900000299
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天然猪胰腺弹性蛋白酶1.1的原子分辨结构
Å
M.Würtele先生
,
M.哈恩
,
K.希尔伯特
和
W·Höhne
答1.1
猪胰腺弹性蛋白酶的光学分辨结构描述了活性部位的氢键几何结构。
PDB参考
:
猪胰腺弹性蛋白酶
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《水晶学报》。
(2000).
D类
56
,
524-528
doi:10.1107/S090744490000007X
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α-
L(左)
-Iduronidase形成具有淀粉样性质的半结晶球晶
L.鲁思
,
D.艾森伯格
和
E.F.Neufeld公司
在结晶试验中,重组人α-
L(左)
-iduronidase形成具有X射线衍射图案的球粒,刚果红结合使人想起淀粉样状态。
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