在早期的一项研究中[Heinemann&Hahn(1992)。生物学杂志。化学。 267,7332–7341],双链B-DNA十聚体d(CCAGGCm)的晶体结构5CTGG)用NUCLSQ公司到R(右)=17.4%,相对于分辨率范围8–1.7的3799 2σ结构振幅 Å. 该结构现在已根据相同的衍射数据重新定义,使用TNT公司或X(X)-PLOR公司为了确定产生的DNA构象在多大程度上会有所不同,并检查这些程序对优化寡核苷酸结构的适用性。这个R(右)值来自NUCLSQ公司两者都无法达到细化TNT公司或X(X)-PLOR公司尽管这两个程序都产生了合理精炼的DNA模型,显示出与NUCLSQ公司0.25和0.32倍降液器的模型 分别为:。某些导出的局部结构参数因使用的细化过程而异。这适用于糖磷主链的几个外环扭转角,而糖皱褶以及螺旋和基面堆叠参数仅受到微弱影响。在所有三个模型中,具有低温因子的15个溶剂位点的子集是保守的。