标签:蛋白质数据库(PDB)

BLAST+(2.9.0)的最新增强功能:内置分类法和从病原体检测项目获取蛋白质

我们最近对BLAST+应用程序进行了一些改进,充分利用了版本5的BLAST数据库(爆破DBv5),其中包括序列的内置分类信息,不再依赖整数序列标识符(gi编号)。

使用最新版本的BLAST,您现在可以:

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生物信息学论文使用NCBI开放数据分析药物反应

A类研究(PMID:28158543)于2017年7月出版生物信息学收集、分类和分析可能影响对当前批准药物反应的单核苷酸变体(SNV)。他们确定了2640个感兴趣的SNV,其中大多数很少出现在人群中(次要等位基因频率<0.01)。

研究人员使用蛋白质序列比对工具,从通过以下途径访问的多种信息资源中挖掘开放数据电子公用事业包括PubChem化合物(Kim等人,2016年PMID:26400175)NCBI基因(Maglott D等人,2014年。PMID:25355515),NCBI蛋白(塞尔斯,2013), MMDB公司(Madej等人,2012年PMID:22135289)PDB公司(Berman等人,2000 PMID:10592235)数据库SNP(Sherry等人,2001年PMID:11125122),以及ClinVar公司(Landrum等人,2016年PMID:26582918)。

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