标签：基本局部对齐搜索工具（BLAST）

自2024年4月起，FTP站点上不再提供BLAST FASTA文件

轻松生成BLAST FASTA文件！ 

2024年4月基本路线搜索工具（BLAST）数据库将不再可用文件传输协议现场。然而，通过使用独立BLAST程序附带的BLAST实用程序blastdbcmd，您可以轻松地从格式化BLAST数据库生成FASTA文件。这为您提供了使用NCBI针对特定生物体或组的分类法ID生成特定于生物体的FASTA文件的灵活性。  

请参阅以下示例和BLAST命令行应用程序用户手册有关独立BLAST程序和使用BLAST数据库的更多详细信息。  继续阅读“自2024年4月起，FTP站点上不再提供BLAST FASTA文件” →

更新的细菌和考古参考基因组集合可用！

更新的细菌和考古参考基因组集合可用！

下载更新的细菌和古细菌参考基因组采集! 本次收集（截至2024年1月18日，共有18941个基因组）是通过在330000多个原核基因组中为每个物种选择“最佳”基因组组合而建立的参考序列（大肠杆菌除外，其中两个组件被选为参考）。你可以通过对这些高质量的基因组而不是整个核苷酸或蛋白质数据库运行它们来加快序列搜索。

The 标准为给定种类选择参考程序集的方法包括程序集的连续性、RefSeq注释的完整性和质量。继续阅读“更新的细菌和考古参考基因组集合可用！” →

在研究项目中使用NCBI数据和工具

在研究项目中使用NCBI数据和工具

你是生物系的学生吗？NCBI提供了对各种资源和工具的免费访问帮助您查找和下载项目的数据。  

您如何以及为什么使用我们的资源？查看以下示例：

你的教授分配给你一个研究项目，研究家猫TP53基因的序列和结构(费利斯·卡图s） ●●●●。此外，你还被要求在猫科动物（猫科动物）的其他成员中找到有关该基因及其基因组区域的信息。  继续阅读“为您的研究项目使用NCBI数据和工具” →

啤酒酿造和面包制作中酵母种类的比较

啤酒酿造和面包制作中酵母种类的比较

利用NIH比较基因组学资源（CGR）获取关于研究较少的生物的知识 

科学界在很大程度上依赖模型生物研究来获取知识和发现。然而，仅仅关注这些物种会错过有价值的变化。比较基因组学允许我们使用来自模型物种的知识，例如酿酒酵母，了解其他相关生物的特征，例如巴斯德酵母菌或尤巴亚努斯酵母菌应用此信息可能会为其他研究较少的生物体提供有价值的见解。美国国立卫生研究院（NIH）比较基因组学资源提供了一个由高质量基因组学数据和工具组成的尖端NCBI工具包，可以帮助您做到这一点。  继续阅读“啤酒酿造和面包制作中使用的酵母种类比较” →

BLAST ClusteredNR数据库现在可供下载！

BLAST ClusteredNR数据库现在可供下载！

现在可用！你可以下载ClusteredNR蛋白质数据库，以前仅在BLAST web应用程序上可用。作为最近推出的，我们的ClusteredNR数据库允许您更快地获得BLAST结果，并访问有关您的点击在更广泛的生物体和进化距离中分布的信息。该包包括ClusteredNR BLAST数据库、SQLite3数据库和几个用于访问集群信息和成员的脚本。  

功能和优点
  • 减少冗余
  • 更快的搜索
  • BLAST结果中有更多不同的蛋白质和生物体

继续阅读“BLAST ClusteredNR数据库现在可供下载！” →

现在可用！更新的细菌和考古参考基因组收集

现在可用！更新的细菌和考古参考基因组收集

更新的细菌和古细菌参考基因组采集可用！这个由18343个基因组组成的集合是通过在312000多个原核基因组中为每个物种选择一个基因组组合而建立的参考序列，除了大肠杆菌其中选择了两个程序集作为参考。

这个标准用于选择给定物种的参考组件的参考组件包括组件邻接性以及RefSeq注释的完整性和质量。 

有什么新功能？

继续阅读“现已提供！更新的细菌和古生菌参考基因组集合” →

哪些动物可以感染并传播人类病毒感染？

哪些动物可以感染并传播人类病毒感染？

利用美国国立卫生研究院比较基因组资源（CGR）了解易感性到SARS-CoV-2型 和其他感染秒 

您是否正在研究人类病毒感染（如新冠肺炎）的动物介导传播？美国国立卫生研究院（NIH）比较基因组学资源提供了一个由高质量基因组数据和工具组成的尖端NCBI工具包，以帮助对真核基因进行比较基因组学分析，例如血管紧张素转换酶2（ACE2）这是SARS-CoV-2的目标 

NCBI资源有助于科学界了解与公共卫生危机相关的病毒感染，如新冠肺炎和流感，并可用于研究可能代表新威胁的新病毒。   继续阅读“哪些动物可以感染并传播人类病毒感染？” →

新的和改进的NCBI数据集基因组和组装页

新的和改进的NCBI数据集基因组和组装页

旧页现在重定向 

自2023年7月10日起生效，NCBI的汇编和基因组记录页面现在重定向到新的 NCBI数据集 页。作为之前宣布的，这些更新是我们不断努力现代化和改善您的用户体验的一部分。NCBI数据集是一种新资源 这使得查找和下载基因组数据更加容易。   

以下页面已更新：
  • NCBI 装配 记录页面现在重定向到新的 NCBI数据集 基因组 记录描述组装基因组的页面，并提供到相关NCBI工具（如Genome Data Viewer和BLAST）的链接。  
  • NCBI 基因组 记录页现在重定向到 NCBI数据集 分类学 记录页面，为基因、基因组和其他NCBI资源提供以分类学为中心的门户。   

在此过渡期间，您可以选择返回到传统的基因组和汇编记录页面。我们将在2024年初删除遗留页面。   继续阅读“新的和改进的NCBI数据集基因组和组装页” →

利用NIH比较基因组资源（CGR）革新您的研究

利用NIH比较基因组资源（CGR）革新您的研究

与美国国立卫生研究院（NIH）一起充分挖掘真核生物研究有机体及其基因组数据的潜力比较基因组学资源.CGR通过社区协作以及由互联、互操作数据和工具组成的NCBI工具包，促进了可靠的比较基因组学分析。  

比较基因组学是一个研究领域，它使用许多不同生物体的基因组来帮助我们了解基本的生物过程和人类疾病。NCBI正在开发CGR，以帮助研究人员充分利用快速增长的真核生物数量，由于最近的技术进步，这些真核生物现已测序基因组和相关数据，可用于这些类型的研究。其NCBI工具包为此类分析提供了新的现代资源，其对社区协作的重视为共享和连接数据带来了新的机会。   继续阅读“利用NIH比较基因组资源（CGR）革新您的研究” →