BLAST+(2.9.0)的最新增强功能:内置分类法和从病原体检测项目获取蛋白质

我们最近对BLAST+应用程序进行了一些改进,充分利用了版本5的BLAST数据库(爆破DBv5),其中包括序列的内置分类信息,不再依赖整数序列标识符(gi编号)。

使用最新版本的BLAST,您现在可以:

  • 使用BLAST数据库中内置的信息按分类法限制搜索
  • 使用序列访问列表时更有效地限制搜索
  • 使用从BLAST数据库中按分类检索序列爆破式导弹防御系统
  • 搜索标识符长达四个字符的PDB蛋白质。您可以在我们的Structure数据库上阅读有关PDB更改的更多信息文档.

只有BLASTDBv5支持这些新功能。这些新的BLAST数据库还包含来自重要高通量基因组测序项目的基于附加(无gi-less)的蛋白质,这些蛋白质在以前版本的BLAST数据库中不可用。这些包括来自大规模病原体监测工作的集合注释的蛋白质,这些集合注释是NCBI病原体项目以及来自大规模宏基因组监测的数据。使用v5数据库,您可以对这些集合中的所有蛋白质执行BLAST搜索,以找到感兴趣的蛋白质。

有关新数据库版本BLASTDBv5的更多信息(下载),请参阅上一个NCBI见解文章记录我们的网络研讨会。2019年9月之前,我们将继续更新BLAST数据库的当前版本(BLASTDBv4)。

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