FastMe公司 swMATH ID: 28027 软件作者: V.Lefort、R.Desper、O.Gascuel 描述: FastME 2.0:一个全面、准确、快速的基于距离的系统发育推断程序。FastME提供了距离算法来推断系统发育。FastME基于平衡最小进化,这正是Neighbor Joining(NJ)的原则。FastME通过使用快速、复杂的算法执行拓扑移动,超越了NJ。FastME的第一个版本仅包括最近邻交换。新的2.0版本还包括子树修剪和重绘,同时保持与NJ相同的速度,并提供了许多工具:使用各种模型和选项对DNA和蛋白质进行距离估计、引导和并行计算。FastME可以使用以下几种接口:Commandline(集成在管道中)、PHYLIP-like和Web服务器(网址:http://www.atgc-montpellier.fr/fastme/)。 主页: http://www.atgc-montpellier.fr/fastme/ 相关软件: ASTRAL-II标准;ASTRID公司;SimPhy公司;生物技术研究所;INDELible(索引);OCTAL公司;树修复程序;埃塞特拉;诺顿;RAxML公司;多晶的;iGTP公司;MulRF公司;快速树;DupTree(重复数据树);猿;RNAmmer公司;Phylo-MCOA公司;苹果;德普 引用于: 8文件 全部的 前5名19位作者引用 三 Tandy J.沃诺。 2 丹尼尔·卡坦扎罗 2 马丁·弗洛恩 2 奥利维尔·加斯库埃尔 2 拉斐尔·佩塞蒂 1 萨拉·克里斯滕森 1 斯特凡·福西 1 加布里埃拉·哈默林克 1 姜月瑜 1 洛根·基夫 1 西亚瓦什·米拉拉布 1 埃林·莫洛伊。 1 约翰·安东尼·罗德斯 1 Mrinmoy Saha罗德尔 1 威廉·桑兹(William A.Sands)。 1 Puoya Tabaghi 1 帕恩贾尔·瓦恰斯帕蒂 1 詹姆斯·威尔森(James K.Willson)。 1 萨马内·尤德卡尼 4篇连载文章中引用 1 数学生物学通报 1 计算机与运筹学 1 欧洲运筹学杂志 1 计算生物学 全部的 前5名在6个字段中引用 7 生物学和其他自然科学(92-XX) 4 运筹学、数学规划(90-XX) 1 总体主题;集合(00-XX) 1 组合数学(05-XX) 1 凸和离散几何(52至XX) 1 计算机科学(68至XX) 按年份列出的引文