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FastMe公司

swMATH ID: 28027
软件作者: V.Lefort、R.Desper、O.Gascuel
描述: FastME 2.0:一个全面、准确、快速的基于距离的系统发育推断程序。FastME提供了距离算法来推断系统发育。FastME基于平衡最小进化,这正是Neighbor Joining(NJ)的原则。FastME通过使用快速、复杂的算法执行拓扑移动,超越了NJ。FastME的第一个版本仅包括最近邻交换。新的2.0版本还包括子树修剪和重绘,同时保持与NJ相同的速度,并提供了许多工具:使用各种模型和选项对DNA和蛋白质进行距离估计、引导和并行计算。FastME可以使用以下几种接口:Commandline(集成在管道中)、PHYLIP-like和Web服务器(网址:http://www.atgc-montpellier.fr/fastme/)。
主页: http://www.atgc-montpellier.fr/fastme/
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引用于: 8文件

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