来自外部资源的数据集成到RCSB PDB中

AlphaFold数据库 AlphaFold2计算结构模型
空中交通管制 世界卫生组织解剖治疗化学(ATC)分类系统
绑定MOAD 结合亲和力
绑定数据库 结合亲和力
BMRB公司 BMRB到PDB的映射
卡片 综合抗生素耐药性数据库
CATH公司 蛋白质结构分类-类别、结构、拓扑/折叠和同源超家族
中国税前利润 生物感兴趣的化学实体
ChEMBL公司 具有类药物性质的生物活性分子的手动策划数据库
CSD公司 剑桥结构数据库:剑桥结晶数据中心验证和整理的小分子有机和金属有机晶体结构
药物数据库 药物和药物靶点数据
ECOD公司 蛋白质结构域的进化分类
EMDB公司 3DEM密度图和相关元数据
探索酶 IUBMB酶命名和分类
Gencode(通用代码) 人类和小鼠基因注释
基因本体论 与分子功能、细胞成分和生物过程相关的生物数据组织
基因型-问题表达-GTEx(NIH公共基金数据资源) 组织特异性基因表达数据
GlyCosmos公司 一个门户网站,旨在将糖科学与有关基因、蛋白质、脂质、途径和疾病的生命科学相结合。
GlyGen公司 碳水化合物和糖共轭物相关数据的数据集成和传播资源,为糖科学研究提供计算和信息资源及工具。
GlyTouCan公司 国际聚糖结构库,每个唯一聚糖都有唯一的登录代码。
人类基因命名委员会 人类基因命名和基因组信息
IMGT公司 国际ImMunoGeneTics信息系统
免疫表位数据库 抗体和T细胞表位
国际小鼠表型联合会-IMPC(NIH公共基金数据资源) 小鼠基因表型数据
InterPro公司 蛋白质家族的分类
M-CSA公司 机理和催化位点图谱
MemProtMD公司 跨膜蛋白结构注释
模型存档 计算结构模型(例如RoseTTAFold)
蒙多病本体论 蒙多疾病本体论(Mondo Disease Ontology)旨在协调世界各地的疾病定义
mpstruc结构 跨膜蛋白质结构的分类
NCBI基因 基因信息、参考序列等。
分类学 生物体分类
国家开发银行 实验确定的核酸和复合物组装
OPM公司 跨膜蛋白结构和膜段的分类
PDB绑定CN 结合亲和力
PDB柔性 蛋白质结构灵活性
PDBTM(UniTmp) 跨膜蛋白结构和膜段注释
Pfam公司 蛋白质家族
Pharos-照亮可药基因组(NIH公共基金数据资源) 基于本体的药物靶点和疾病,可从药物靶点本体、蒙多疾病本体、疾病本体、PANTHER和GO获得
蛋白质衍射.org 衍射图像
公共化学 化学信息
公共医学 引文信息
PubMedCentral公共医疗中心 开放获取文献
RESID公司 蛋白质修饰
SAbDab公司 结构抗体数据库
SBGrid公司 结构生物学数据网格/衍射图像
SCOP公司 蛋白质的结构分类
SCOPe公司 蛋白质的结构分类-扩展
SIFTS公司 功能、分类和序列的结构集成
Thera-SAbDab公司 治疗性结构抗体数据库
UniProt公司 蛋白质序列和注释


请向报告任何遇到的断开链接info@rcsb.org
上次更新时间:2024年3月4日