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参考文献和示例

引文政策

参考文献和示例

PDB条目被分配一个PDB ID，该ID对应于数字对象标识符（DOI），并且结构作者经常在出版物中进行描述。

PDB结构的DOI遵循以下格式：https://doi.org/10.2210/pdbXXXX/pdb，其中XXXX替换为PDB ID（例如。，https://doi.org/10.2210/pdb4hhb/pdb). 内政部引文应包括条目作者、结构标题、沉积年份和内政部。

具有相应出版物的PDB结构应通过PDB ID引用，并使用相应的DOI引用和出版物引用。

示例：PDB ID：1埃马

DOI引文：M.Ormo，S.J.Remington，绿色荧光蛋白维多利亚多管发光水母(1996)https://doi.org/10.2210/pdb1ema/pdb

文献引用：M.Ormo、A.B.Cubitt、K.Kallio、L.A.Gross、R.Y.Tsien、S。J.Remington，晶体结构维多利亚多管发光水母绿色荧光蛋白（1996）科学类273: 1392-1395https://doi.org/10.1126/science.273.5280.1392

没有相应出版物的PDB结构应通过PDB ID和DOI引用引用。

示例：PDB ID:1个10
DOI引文：W.Shi，D.A.Ostrov，S.E.Gerchman，V.Graziano，H.Kycia，B.Studier，S.C.Almo，S.K.Burley，纽约SGX结构基因组研究中心（NYSGXRC），PNP氧化酶酿酒酵母(1999)https://doi.org/10.2210/pdb1ci0/pdb
雷达散射截面应使用URL引用RCSB.org网站引文：

H.M.Berman、J.Westbrook、Z.Feng、G.Gilliland、T.N.Bhat、H.Weissig、I.N.Shindyalov、P.E.Bourne、蛋白质数据库（2000）核酸研究28: 235-242https://doi.org/10.1093/nar/28.1.235.

我们的网站上列出的文章中也描述了新的网站功能和资源出版物页面并定期向核酸研究数据库问题，包括最新文章：
RCSB蛋白质数据库（RCSB.org）：提供实验确定的PDB结构以及来自人工智能/机器学习的100万个蛋白质计算结构模型(2023)核酸研究51:D488–D508https://doi.org/10.1093/nar/gkac1077
RCSB PDB是全球PDB（wwPDB）应使用URL引用.wwPDBwwpdb.org网站以及以下引文：
H.M.Berman、K.Henrick和H.Nakamura宣布建立全球蛋白质数据库（2003年）自然结构生物学10:980https://doi.org/10.1038/nsb1203-980.
来自和/或Structure Summary和Group Summary页面和选项卡的图像（包括屏幕截图）应引用RCSB PDB和PDB条目：
来自RCSB PDB的图像(RCSB.org网站)PDB ID 1BNA（H.R.Drew、R.M.Wing、T.Takano、C.Broka、S.Tanaka、K.Itakura、R.E.Dickerson，《B-DNA十二聚体的结构：构象和动力学》（1981）程序。国家。阿卡德。科学。美国78: 2179-2183).
使用PDB数据和其他软件创建的图像应引用PDB ID、相应的结构出版物和分子图形程序。

（K.Luger、A.W.Mader、R.K.Richmond、D.F.Sargent、T.J.Richmond-2.8°分辨率下核心粒子的晶体结构（1997）自然389:251-260）与NGL（A.S.Rose，A.R.Bradley，Y.Valasatava，J.D.Duarte，A.Prlić，P.W.Rose NGL查看器：基于网络的大型复合物分子图形（2018）生物信息学34: 3755–3758)
使用Mol创建的图像*应引用PDB ID、相应的结构出版物Mol*（D.Sehnal、S.Bittrich、M.Deshpande、R.Svobodová、K.Berka、V.Bazgier、S.Velankar、S.K.Burley、J.Koča、a.S.Rose（2021）Mol*Viewer：用于大型生物分子结构三维可视化和分析的现代网络应用程序（2021）核酸研究49：W431-W437https://doi.org/10.1093/nar/gkab314)和RCSB PDB。
请参阅AlphaFold蛋白质结构数据库优先引用AlphaFold公司DB结构
请参阅模型存档优先引用模型存档结构
Molecule of the Month插图位于CC-BY-4.0许可证应将责任归于David S.Goodsell和RCSB PDB。《月度分子》的文章版权归RCSB PDB和文章作者所有。文本可以在获得许可的情况下转载，并带有属性，但无权操纵或更改内容。联系人info@rcsb.org以获得许可。
可以使用数字对象标识符（DOI）引用月度单个分子文章，其格式为：https://doi.org/10.2210/rcsb_pdb/mom_YYYY_MM，其中YYYY是年份，MM是月份的数字（一个或两个数字，例如。https://doi.org/10.2210/rcsb_pdb/mom_2020_1).

Molecule of The Month系列的参考是：
RCSB PDB“月度最佳分子”：20年月度最佳分子的启示（2020年）BAMBed公司48: 350-355https://doi.org/10.1002/bmb.21360
RCSB.org内容的其他用法（例如，用户指南文档、统计图、其他屏幕截图）可在CC-BY-4.0许可证如上所述，应归于RCSB PDB。
布鲁克海文国家实验室（BNL）PDB于1999年6月30日停止运营。BNL PDB的原始日记账参考为：
F.C.Bernstein、T.F.Koetzle、G.J.B.Williams、E.F.Meyer Jr.、M.D.Brice、J.R.Rodgers、O.Kennard、T.Shimanouchi、M.Tasumi，《蛋白质数据库：大分子结构的计算机档案文件》（1977）分子生物学杂志。112: 535-542.
PDB档案首次公布于：蛋白质数据库（1971）自然新生物学233:223.