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组织生物学和疾病建模
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欧洲生物信息研究所
表观遗传学和神经生物学
示例:1001,载脂蛋白,断层扫描术,罗斯曼MG,第5A1A章
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电子显微镜数据库(EMDB)是低温样品电子显微镜的公共存储库大分子复合物和亚细胞结构的体积和代表性层析图。它涵盖了多种技术,包括单粒子分析、螺旋重建、,电子层析成像、亚谱平均和电子晶体学。 更多。。。
截止日期2024年5月1日,EMDB包含35127条目(最新条目,趋势).
2024年1月6日:我们高兴地分享,ELIXIR已将EMDB正式提升为核心数据资源,并将其视为对更广泛的生命科学界和生物数据长期保存具有根本重要性的欧洲数据资源。
2023年11月22日:我们很高兴分享EMDB核酸研究论文的最新版本。本文在全球蛋白质数据库的背景下描述了EMDB的最新发展和未来计划。现在就去看看吧! https://doi.org/10.1093/nar/gkad1019
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大肠杆菌70S核糖体P位tmRNA*SmpB和A位丙氨酸-tRNA的内源性转译复合物
离子通道
人呼吸双微管中的TUBB4B和TUBA1A异二聚体
结核分枝杆菌ATP合酶Fo与苯二喹啉(BDQ)复合物的冷冻电镜结构
甲基巴豆酰辅酶A羧化酶核二聚体
GTP状态下来自矮脚梭菌的Roco蛋白与活化纳米体NbRoco1和NbRoco2结合
粘胶旋毛虫气皮蛋白孔的冷冻电镜结构
60S核糖体生物生成中间体(Dbp10催化结构-Dbp10局部图谱)
PiB结合的TMEM106B原纤维的低温电镜结构。
大肠杆菌MraY突变株-T23P
与苯二喹啉结合的人ATP合成酶的结构
带THSC20.HVTR04(Fab4)的3向上峰值RBD:状态-II
60S核糖体生物生成中间体(Dbp10催化结构-L1局部图谱
MPXV E5 C末端与DNA复合物的Cryo-EM结构
λ噬菌体的中心尾部纤维在与LamB结合时的开放状态(gpJ713-LamB复合物)
带有延伸因子G的金黄色葡萄球菌70S核糖体与融合酸环戊烷和tRNA在pe/E嵌合杂交状态下锁定
带有延伸因子G的金黄色葡萄球菌70S核糖体与带有tRNA的融合酸在pe/E嵌合状态下锁定
SpRY-Cas9:gRNA复合物靶向2 bp R-loop的TAC-PAM DNA
DSR2-DSAD1的低温电磁结构
琅琊病毒附着(G)糖蛋白K85L/L86K突变
早期B状态下人类外显子定义剪接体的冷冻电镜结构。
60S核糖体生物生成中间体(Dbp10催化后结构-Dbp10局部图谱)
香猫冠状病毒007尖峰糖蛋白闭合构象的冷冻电镜结构
铜绿假单胞菌PAO1Ⅳ型菌毛的冷冻电镜结构
开放状态下λ噬菌体尾尖复合体
Fe3+诱导的α-同步纤维的低温电镜结构。
超收缩状态(全螺旋)下组装在膜上的GDP-结合人动力蛋白(全长)聚合物的冷冻电镜
人Ninjurin1弯曲低聚物的冷冻电镜结构
超收缩状态下组装在膜上的GDP结合的人动力蛋白聚合物的冷冻电镜显示PH域
过硫化物转移期间人体线粒体铁硫簇生物合成复合物的结构(共识图)
固定相泰国伯克霍尔德菌的Binned层析图
SpRY-Cas9:gRNA复合物靶向10 bp R-loop的TAC-PAM DNA
SpG Cas9与NGG PAM DNA靶
apo状态下HKU1-B S蛋白的1up构象
与ACE2复合物中SARS-CoV-2 EG.5.1峰RBD的结构
粗糙脉孢菌RCD-1孔的冷冻电镜结构
平滑肌γ-肌动蛋白(ACTG2)丝状突变体R40C
60S核糖体生物生成中间体(Dbp10预催化结构-总图)
载脂蛋白形式的人DNA聚合酶θ解旋酶结构域四聚体
靶向TAC-PAM DNA的SpRY-Cas9:gRNA复合物
过硫化物转移期间人体线粒体铁硫簇生物合成复合物的结构(不含氟他嗪)
FLVCR2内表面胆碱结合态的低温电磁结构
非洲爪蟾透明质酸合成酶1
SV2A与BoNT/A2-Hc和左乙拉西坦配合物的低温-电镜结构
SpRY-Cas9:gRNA复合物靶向3 bp R-loop的TAC-PAM DNA
小球藻病毒透明质酸合成酶与GlcA扩展GlcNAc引物和UDP结合
酸碱磺酸盐螺纹(0406)灯丝。
与米安色林结合的血清素1E受体(5-HT1eR)-Gi1复合物
SpRYmer与NAC PAM DNA结合
人ASCT2与合胞素-1的异源三聚体复合物
金黄色葡萄球菌70S核糖体与融合酸环戊烷在易位后状态下锁定的延伸因子G
Vgamma5 Vdelta1 TCR的胞外结构域(DeepEMhancer)
SpRY-Cas9:gRNA复合物与具有8bp R-环的非靶DNA结合
受体孵育后HKU1-B S蛋白的2up-TM构象
复方左乙拉西坦中SV2A二聚体的冷冻电镜结构
带有NGC-PAM DNA靶点的SpG Cas9
与苯二喹啉(外周茎结构域)结合的人ATP合成酶的结构
DSR2-TTP的低温电磁结构
与苯二喹啉(复合物)结合的人ATP合成酶的结构
结核分枝杆菌ATP合成酶外周茎的apo-form
粘质沙雷氏菌CdnG-E2复合物的冷冻电镜结构
ASCT2与抑制素的复合物
60S核糖体生物生成中间体(Dbp10催化后结构-H64局部图谱)
胆碱结合的FLVCR2外向状态的低温电磁结构
窄叶1-靠近日本
DSR2-DSAD1状态1的低温电磁结构
λ噬菌体中心尾纤的闭合状态
野生型平滑肌γ-肌动蛋白(ACTG2)的冷冻电镜结构
受体孵育后HKU1-B S蛋白的2up-1构象
HKU1-B S蛋白在载脂蛋白状态下的闭合构象
运输T2
状态-I:带THSC20.HVTR04的尖峰2向上RBD(Fab4)
60S核糖体生物生成中间体(Dbp10预催化结构-局部图Rrp14/Rrp15/Ssf1区域)
人ASCT2与Syncytin-1的复合物
pH 3.7条件下仓鼠朊病毒23-144原纤维的冷冻电镜结构
SV2A二聚体与BoNT/A2-Hc和左乙拉西坦配合物的冷冻电镜结构
受体孵育后HKU1-B S蛋白的3up-TM构象
尼帕病毒附着糖蛋白G与1E5中和抗体复合物构象1的冷冻电镜结构
蝙蝠冠状病毒WIV1尖峰糖蛋白闭合构象的冷冻电镜结构
热带爪蟾酸敏感外向整流通道ASOR三聚体与tRNA结合的结构(中间态)
60S核糖体生物生成中间体(Dbp10催化中间体-Rrp14/Rrp15/Ssf1局部图)
受体孵育后HKU1-B S蛋白的闭合构象
DSR2-DSAD1状态2的低温电磁结构
结核分枝杆菌ATP合成酶F1在apo-form中的表达
受体孵育后HKU1-B S蛋白的1up-2构象
非洲爪蟾透明质酸合成酶1,UDP结合,门控环插入状态
人体NOX5激活的结构基础
具有稳定突变的狼毒G糖蛋白(LayV G)
SpRY-Cas9:gRNA复合物与1 bp R-loop的非靶DNA结合
小球藻病毒透明质酸合成酶与GlcNAc引物和UDP-GlcA结合
过硫化物转移期间人体线粒体铁硫簇生物合成复合物的结构(NFS1和ISCU2上的过硫化物)
对称apo状态下具有10-nt TRS的无ORF-lessⅡC族内含子HYER1
非洲爪蟾透明质酸合成酶1,新生HA聚合物结合状态
结核分枝杆菌apo-form中ATP合酶Fo的冷冻电镜结构
60S核糖体生物生成中间体(Dbp10催化结构-总图)
GTP状态下与激活的纳米体NbRoco1和NbRoco2结合的淡脚梭菌Roco蛋白的集合图
利什曼原虫主要80S核糖体的冷冻电镜聚焦精炼图:野生型复制品1
与GlcA扩展GlcNAc引物结合的小球藻病毒透明质酸合成酶
λ噬菌体中央尾纤维与LamB结合后的开放状态
GTP状态下的矮脚梭菌Roco蛋白与活化纳米体结合
平滑肌γ-肌动蛋白突变体R257C的冷冻电镜结构
60S核糖体生物生成中间体(Dbp10催化后结构-总图)
与肌动蛋白和AMP复合的军团菌效应器的冷冻电镜结构
I-B型级联以3.8埃的分辨率与含有PAM的dsDNA靶结合。
60S核糖体生物生成中间体(Dbp10预催化结构-局部图L1区域)
SpRY-Cas9:gRNA复合物靶向18 bp R-loop的TAC-PAM DNA
MPXV E5与DNA复合物的冷冻电镜结构
人类DNA聚合酶θ解旋酶结构域二聚体在微同源性排列构象中与DNA结合
结核分枝杆菌ATP合酶F1与苯醌(BDQ)复合物
人40S核糖体与PDCD4的冷冻电镜结构
人类DNA聚合酶θ解旋酶结构域二聚体在微同源搜索构象中与DNA结合
与tRNA结合的二聚体爪蟾热带酸敏感外向整流通道ASOR三聚体的结构(闭合状态)
结核分枝杆菌ATP合酶F1与TBAJ-587复合物的冷冻电镜结构
与Setiptiline结合的血清素1E受体(5-HT1eR)-Gi1复合物
细菌腈酶丝与苯甲腈水解共价加合物的低温电磁结构
SV2A与BoNT/A2-Hc和Brivaraceam配合物的低温EM结构
人43S核糖体与PDCD4的冷冻电镜结构
尼帕病毒附着糖蛋白与41-6抗体片段
60S核糖体生物生成中间体(Dbp10催化结构-低通过滤局部精细图)
过硫化物转移过程中人体线粒体铁硫簇生物合成复合物的结构(ISCU2上的过硫化物)
超收缩状态(全螺旋)下组装在膜上的GDP结合的人体动力蛋白聚合物的冷冻电镜
与肌动蛋白和ATP复合的军团菌效应器的冷冻电镜结构
受体孵育后HKU1-B S蛋白的1up-1构象
与贝达奎林结合的人ATP合酶的结构(膜结构域)
嗜热四膜虫K40R株近端48-nm双微管中的微管内蛋白
SIDT1蛋白
2-酮戊二酸脱氢酶(E1)和TCAIM复合物的低温EM结构
成熟前B状态下人类外显子定义剪接体的冷冻电镜结构。
HE0537设计的低温EM图,这是一种采用RFdiffusion设计的D4对称同向异构体。
SARS-CoV-2 EG.5.1棘突糖蛋白与ACE2复合物的结构(1-up状态)
SV2A与BoNT/A2-Hc配合物的低温电磁结构
SpRY-Cas9:gRNA复合物与6 bp R-loop的非靶DNA结合
MPXV E5 apo构象的Cryo-EM结构
GLMP/MFSD1复合体的结构
尼帕病毒与1E5中和抗体结合物G构象2的冷冻电镜结构
结核分枝杆菌ATP合成酶外周茎与TBAJ-587复合物的冷冻电镜结构
靶向TTC-PAM DNA的SpRY-Cas9:gRNA复合物
60S核糖体生物生成中间体(Dbp10预催化结构-PTC局部图谱)
超收缩状态下组装在膜上的GDP结合的人动力蛋白(全长)聚合物的冷冻电镜
热带爪蟾酸敏感外向整流通道ASOR的结构(静息状态)
超收缩状态下组装在膜上的GDP结合的人动力蛋白聚合物的冷冻电镜显示第二个PH域
大肠杆菌70S核糖体P位点含tmRNA*SmpB、A位点含丙氨酸-tRNA、E位点含脱乙酰-tRNA的内源性转译复合物
猴痘病毒DNA复制全酶F8、A22和E4复合物的DNA结合形式
结核分枝杆菌ATP合成酶外周茎与苯醌(BDQ)复合物
GTP状态下与激活的纳米体NbRoco1结合的淡脚梭菌Roco蛋白的Roc-COR结构域的聚焦图
SpRY-Cas9:gRNA复合物靶向0 bp R-loop的TAC-PAM DNA
尾管蛋白的冷冻电镜结构
结核分枝杆菌ATP合酶Fo与TBAJ-587复合物的冷冻电镜结构
结核分枝杆菌ATP合酶与TBAJ-587复合物的冷冻电镜结构
SpRY-Cas9:gRNA复合物靶向13 bp R-loop的TAC-PAM DNA
载脂蛋白形式的人DNA聚合酶θ解旋酶结构域二聚体
Rof抑制Rho转录终止因子的结构机制
溶酶体肽转运体
人类DNA聚合酶θ解旋酶结构域二聚体在微同源退火构象中与DNA结合
成熟B状态下人类外显子定义剪接体的冷冻电镜结构。
SpRY-Cas9:gRNA复合物靶向TGG-PAM DNA
与活化纳米体NbRoco2结合的苔藓梭菌Roco蛋白LRR结构域的聚焦图谱
具有PDCD4和eIF3G的人40S核糖体的冷冻电镜结构
超收缩状态下组装在膜上的GDP结合的人动力蛋白聚合物的冷冻电镜研究
前B状态晚期人类外显子定义剪接体的冷冻电镜结构。
SV2A-LD4与SV2A-乙拉西坦-BoNT/A2-Hc配合物中BoNT/A2-Hc配合物的低温EM结构
人中性氨基酸转运蛋白ASCT2与纳米体469复合物的结构
加纳病毒融合糖蛋白(GhV F)
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