自1971年以来,蛋白质数据库档案(PDB)一直是关于蛋白质、核酸和复杂组装体的三维结构信息的单一存储库。

庆祝PDB 50年

全球PDB(wwPDB)组织管理PDB存档,并确保PDB可免费向全球社区公开。

庆祝wwPDB合作20年

愿景和使命

愿景

维持生物大分子结构数据和元数据的可自由访问、互操作的核心档案,作为一种持久的公共利益,以促进科学领域的基础和应用研究与教育。

使命

  • 根据公平原则,将wwPDB核心档案作为公共物品进行管理。
  • 免费向全球数据管理员提供专家沉积、验证、生物化和修复服务。
  • 确保公共领域结构生物学数据的普遍开放访问,不受使用限制。
  • 为全球结构生物学数据的存档和交换制定并推广社区认可的数据标准。
wwPDB成员

简单而高级的大分子和配体搜索,针对编程用户的灵活API,专业的1D-3D可视化工具,每月分子奖和PDB-101上的其他培训资源,等等。

支持日语、中文、韩语等多种语言浏览;SeSAW通过定位和注释序列和结构相似性、生物信息学家的工具等来识别功能或进化上保守的基序。

关于所有PDB条目的丰富信息,多种搜索和浏览工具,高级服务,包括PDBePISA、PDBeFold和PDBeMotif,NMR和EM结构的高级可视化和验证,生物信息学家的工具。

从任何实验中收集核磁共振数据,并捕获各种大分子的指定化学位移、耦合常数和峰列表;包含衍生注释,如氢交换率、pKa值和弛豫参数。

收集的3D卷和相关信息大分子复合物&亚细胞结构来自电子冷冻显微术&电子冷冻层析成像;开发用于搜索、数据的资源挖掘、分析、验证和可视化数据。

新闻和公告

04/08/2024

将目标提交给蛋白质结构预测的关键评估,包括通过多种实验方法(冷冻电镜、核磁共振、X射线结晶学、SAXS、交联)确定的结构

阅读更多信息

03/21/2024

阅读wwPDB使用标准化NEF和NMR-STAR格式对NMR约束分析进行的验证改进

阅读更多信息

03/12/2024

阅读有关低温EM数据存档和验证的新社区建议

阅读更多信息