这里包括什么生物过程?
描述生物过程的词汇,由基因本体联盟(GO),用于在此浏览器中组织PDB结构。根据生物过程映射到PDB实体UniProt公司序列和使用功能、分类和序列的结构集成(SIFTS)项目。只有在PDB结构中映射了一个蛋白质时,这些过程才会列在浏览树中。
为什么按生物过程浏览?
浏览此树可以帮助识别参与相同或相关生物过程的蛋白质实体。你可以通过参与的过程来检查这些结构,看看这些蛋白质中是否有任何共同的特征或其他趋势。
如何使用生物过程浏览器?
生物过程浏览器允许用户在搜索框中键入过程名称,选择GO术语,或输入7位GO ID以查找感兴趣的聚合物。
在浏览器中找到感兴趣的生物过程后,用户可以查看该组中聚合物的数量。点击工艺名称旁边列出的数字,将启动对PDB中与该生物工艺相关的所有聚合物实体的搜索。
例子
浏览与胰岛素信号传导相关的实体,即由酶链接激素受体蛋白信号传导介导的细胞内信号传导,如下所示:
- 通过树及其分支导航“信号转导”>>“细胞表面受体信号通路”>>”酶链接受体蛋白信号通路“和”胰岛素受体信号通路“OR
- 在页面顶部的搜索框中键入胰岛素,并从选项“胰岛素受体信号通路”中选择。或
- 输入7位GO ID:0008286。如果您开始键入ID 8286,则会在页面顶部的搜索框中显示自动完成建议,您可以从中选择适当的选项,以便在浏览器树中进行搜索。