化学品和生物分析
数据库
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NCBI结构组的计算资源 一个集中的页面,提供对NCBI计算生物学分支(CBB)结构组开发的资源的访问和链接。 这些资源包括数据库和工具,以帮助研究大分子结构、保守域和蛋白质分类、小分子及其生物活性、生物途径和系统。 -
PubChem生物检测 由保存的生物活性数据和用于筛选PubChem物质数据库中所含化学物质的生物活性分析描述组成,包括筛选程序特定条件和读数(生物活性水平)的描述。 -
PubChem化合物 包含独特的、经过验证的化学结构(小分子),可以使用名称、同义词或关键字进行搜索。 如果不同的存贮器提供相同的结构,则复合物记录可能链接到多个PubChem Substance记录。 这些化合物记录反映了为描述PubChem物质中的物质而提供的经验证的化学描述信息。 PubChem化合物中存储的结构通过身份和相似性组预先聚集和交叉引用。 此外,计算出的属性和描述符可用于搜索和筛选化学结构。 -
PubChem物质 PubChem物质记录包含存款人以电子方式提交给PubChem.的物质信息。 这包括提交的任何化学结构信息,以及化学名称、评论和到存款人网站的链接。
下载
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FTP:PubChem 该网站提供PubChem Substance、Compound和Bioassay数据库的数据,可通过ftp下载。 数据库的完整下载,以及物质和化合物的每日、每周和每月更新。 物质和化合物数据以ASN.1、SDF和XML格式提供。 有关更多信息,请参阅README文件。 -
PubChem下载服务 该服务允许用户下载与一组PubChem标识符相对应的化合物或物质记录,这些标识符可以手动或通过文本文件提供。 提供了多种下载格式,包括SDF、XML和SMILES。
提交文件
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PubChem上传 该网站允许用户向PubChem Substance和BioAssay数据库提交数据,包括化学结构、实验生物活性结果、注释、siRNA数据等。 它还可以用于更新以前提交的记录。
工具
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PubChem Power用户网关(PUG) PUG通过编程接口提供对PubChem服务的访问。 PUG允许用户下载数据、启动化学结构搜索、标准化化学结构以及与电子工具交互。 可以使用标准URL或通过SOAP访问PUG。 -
PubChem标准化服务 标准化,在PubChem术语中,是指化学结构的处理方法,与根据贡献者的原始结构创建PubChem-Compound记录的方法相同。 该服务让用户了解PubChem如何处理他们想要提交的任何结构。 -
PubChem结构搜索 PubChem Structure Search允许通过化学结构或化学结构模式查询PubChem-Compound Database。 PubChem Sketcher允许手动绘制查询。 用户还可以通过PubChem Compound Identifier(CID)、SMILES、SMARTS、InChI、Molecular Formula或通过上传受支持的结构文件格式指定结构查询输入。