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第6天磷酸二酯酶6D[家犬(狗)]

基因ID:403781,更新日期2024年3月5日

总结

官方符号
第6天由提供VGNC公司
官方全名
磷酸二酯酶6D由提供VGNC公司
主要来源
VGNC:VGNC:44360
请参阅相关
乐团:ENSCAFG00845024260
基因类型
蛋白质编码
RefSeq状态
临时的
有机体
家犬狼疮(亚种:家犬)
血统
真核生物;后生动物;脊索动物;克兰亚塔;脊椎动物;真造口术;哺乳动物;Eutheria;劳拉动脉粥样硬化;食肉动物;犬形目;犬科;犬科动物
直系同源
新款
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基因组背景

请参阅中的PDE6D基因组数据查看器
位置:
染色体:25
外显子计数:
6
注释发布 状态 装配 Chr公司 位置
106 现在的 ROS_Cfam_1.0型(GCF_014441545.1号) 25 NC_051829.1(43839352..43893418,补码)
106 现在的 狗10K_盒子_Tasha(GCF_ 000002285.5) 25 NC_006607.4(44077007..44130324,补码)
106 现在的 UU_Cfam_GSD_1.0(GCF_011100685.1) 25 NC_049246.1(43766160..43819583,补码)
106 现在的 UMICH_缩放3.1(GCF_00544595.1号) 25 NC_049285.1(43767671..43820847,补体)
106 现在的 UNSW_扫描FamBas_1.0(GCF_013276365.1号) 25 NC_049766.1(43611021..43664227,补码)

染色体25-NC_051829.1描述相邻基因的基因组上下文 Neighboring gene uncharacterized LOC119865964 Neighboring gene prothymosin alpha Neighboring gene COP9 signalosome subunit 7B Neighboring gene U6 spliceosomal RNA

基因组区域、转录物和产物

PubChem的途径

一般蛋白质信息

首选名称
视网膜杆视紫红质敏感cGMP 3',5'-环磷酸二酯酶亚基δ
姓名
GMP-PDE增量
cGMP-磷酸二酯酶δ亚单位
cGMP-磷酸二酯酶δ亚单位的pde6D基因
NP_001003156.1号
XP_038290451.1型

NCBI参考序列(RefSeq)

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独立于注释的RefSeq维护基因组

这些参考序列独立于基因组构建而存在。解释

这些参考序列与基因组无关注释循环,因此其版本可能与当前的RefSeq版本不匹配基因组构建。通过比较中RefSeq的版本来确定版本不匹配本节至中报告的那一节基因组区域,成绩单和产品以上。

mRNA和蛋白质

  1. NM_001003156.1号NP_001003156.1号视网膜杆视紫红质敏感cGMP 3',5'-环磷酸二酯酶亚基δ

    参见NP_001003156.1的相同蛋白质及其注释位置

    状态:暂定

    源序列
    AF109151型
    UniProtKB/Swiss-Prot公司
    第9季度第54季度
    UniProtKB/TrEMBL公司
    A0A8C0LFK1型
    相关的
    ENSCAFP00845033577.1标准,ENSCAFT00845042834.1号文件
    保守领域(1)总结
    pfam05351型
    位置:10149
    GMP_PDE_增量;GMP-PDE,δ亚单位

注释基因组的参考序列:犬狼疮家族注释版本106 细节。。。在新选项卡中打开此链接

以下部分包含属于特定基因组构建。解释

参考ROS_Cfam_1.0

基因组学

  1. NC_051829.1参考ROS_Cfam_1.0

    范围
    43839352..43893418补码
    下载
    GenBank(基因银行),美国金融服务贸易协会,序列查看器(图形)

mRNA和蛋白质

  1. XM_038434523.1号XP_038290451.1型视网膜杆视紫红质敏感cGMP 3',5'-环磷酸二酯酶亚基δ亚型X1

    保守领域(1)总结
    pfam05351型
    位置:1130
    GMP_PDE_德尔塔;GMP-PDE,δ亚单位

替代UMICH_Zoey_3.1

基因组学

  1. NC_049285.1备用UMICH_Zoey_3.1

    范围
    43767671..43820847补码
    下载
    GenBank(基因银行),美国金融服务贸易协会,序列查看器(图形)

替代UNSW_CanFamBas_1.0

基因组学

  1. NC_049766.1替代UNSW_CanFamBas_1.0

    范围
    43611021..43664227补码
    下载
    GenBank(基因银行),美国金融服务贸易协会,序列查看器(图形)

备用UU_Cfam_GSD_1.0

基因组学

  1. NC_049246.1备用UU_Cfam_GSD_1.0

    范围
    43766160..43819583补码
    下载
    GenBank(基因银行),美国金融服务贸易协会,序列查看器(图形)

备用挡块10K_Boxer_Tasha初级组件

基因组学

  1. NC_006607.4备用挡块10K_Boxer_Tasha初级组件

    范围
    44077007..44130324补码
    下载
    GenBank(基因银行),美国金融服务贸易协会,序列查看器(图形)