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UU_Cfam_GSD_1.0

生物体名称:
犬狼疮(犬)
具体名称:
品种:德国牧羊犬
隔离:
米奇卡
性别:
女性的
生物样品:
SAMN13230619号
生物项目:
项目编号:587469
提交人:
瑞典乌普萨拉大学
日期:
2020/03/10
同义词:
坎法姆4
装配级别:
染色体
基因组表示:
满的
RefSeq类别:
代表性基因组
GenBank组件加入:
GCA_011100685.1(最新)
RefSeq程序集加入:
GCF_011100685.1(最新)
RefSeq组件和GenBank组件相同:
没有(隐藏详细信息)
  • 仅在GenBank中:染色体MT
  • 为RefSeq版本显示的数据
WGS项目:
JAAHUQ01号机组
装配方法:
FALCON版本0.5.0
预期最终版本:
基因组覆盖率:
100.0倍

标识:6119491[UID(UID)]17410168[GenBank]20192338[参考序列]

请参见基因组有关的信息灰狼

这个有机体有27个组件

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历史(显示修订历史)

注释

全球统计

序列总长度2,481,983,352
总未映射长度2,481,924,852
脚手架之间的间隙0
脚手架数量2,197
脚手架N5064,299,765
脚手架L5015
连续数2,782
康蒂格N5014,840,767
轮廓L5057
染色体和质粒总数39
组件序列数(WGS或克隆)2,782

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全局程序集定义

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装配单元名称
主要组件
装配单元:初级装配(通用代码011100695.1)
分子名称GenBank序列RefSeq序列未本地化
序列计数
染色体1CM021962.1号=NC_049222.1号0
染色体2CM021963.1号=NC_049223.1号0
染色体3CM021964.1号=NC_049224.1号0
染色体4CM021965.1号=NC_049225.1号0
染色体5CM021966.1号=NC_049226.1号0
染色体6CM021967.1号=新冠肺炎049227.10
7号染色体CM021968.1号=NC_049228.1号0
第8号染色体CM021969.1号=NC_049229.1号0
9号染色体CM021970年1月=NC_049230.1号0
第10号染色体CM021971.1号机组=NC_049231.1号0
11号染色体CM021972.1号=NC_049232.1号0
12号染色体CM021973.1号=NC_049233.1号0
13号染色体CM021974.1号=NC_049234.1号0
第14号染色体厘米021975.1=NC_049235.1号0
第15号染色体CM021976.1号=NC_049236.1号0
16号染色体CM021977.1号=NC_049237.1号0
17号染色体CM021978.1号=NC_049238.1号0
18号染色体CM021979.1号=NC_049239.1号0
第19号染色体厘米021980.1=NC_049240.1号0
20号染色体CM021981.1号=NC_049241.1号0
21号染色体CM021982.1号=NC_049242.1号0
22号染色体CM021983.1号=NC_049243.1号0
23号染色体CM021984.1号=NC_049244.1号0
24号染色体CM021985.1号=NC_049245.1号0
25号染色体CM021986.1号=新冠_049246.10
26号染色体CM021987.1号=NC_049247.1号0
第27号染色体CM021988.1号=NC_049248.1号0
第28号染色体CM021989.1号=NC_049249.1号0
29号染色体CM021990.1型=NC_049250.1号0
染色体30CM021991年1月=NC_049251.1号0
31号染色体CM021992.1号=NC_049252.1号0
32号染色体CM021993.1号=NC_049253.1号0
33号染色体厘米021994.1=NC_049254.1号0
34号染色体CM021995.1号=NC_049255.1号0
35号染色体CM021996.1号=NC_049256.1号0
36号染色体CM021997.1号=NC_049257.1号0
37号染色体CM021998年1月=NC_049258.1号0
第38号染色体厘米021999.1=NC_049259.1号0
X染色体CM022000.1型=NC_049260.1号0
未放置的不适用不适用不适用2,158

程序集统计

分子总计
长度
脚手架
计数
未绑定
长度
脚手架
50新元
跨越(Spanned)
差距
未平移
差距
全部2,481,983,3522,1972,481,924,85264,299,7655850
染色体1123,556,4691123,555,469123,556,469100
染色体284,979,418184,977,11884979418美元230
染色体392,479,059192,478,15992,479,05990
染色体489,535,178189,533,97889,535,178120
染色体589,562,946189,562,24689,562,94670
染色体678,113,029178,111,82978,113,029120
7号染色体81,081,59611996年8月10日81,081,59640
第8号染色体76,405,709176,405,30976,405,70940
9号染色体61,171,909161,171,40961,171,90950
第10号染色体70,643,054170,642,5547064305450
11号染色体74,805,798174,803,99874,805,798180
12号染色体72,970,719172,969,91972,970,71980
13号染色体64,299,765164,297,96564,299,765180
第14号染色体61,112,200161,111,20061,112,200100
第15号染色体64676183164,675,28364,676,18390
16号染色体60,362,399160,359,99960,362,399240
17号染色体65,088,165165,086,66565,088,165150
18号染色体56,472,973156,472,57356,472,97340
第19号染色体55,516,201155,514,80155,516,201140
20号染色体58627490个158,626,99058,627,49050
21号染色体51,742,555151,741,25551,742,555130
22号染色体61,573,679161,573,37961,573,6790
23号染色体53,134,997153134597个53,134,99740
24号染色体48,566,227148,565,22748,566,227100
25号染色体51,730,745151,730,34551,730,74540
26号染色体39,257,614139,256,41439,257,614120
第27号染色体46,662,488146,661,7884666248870
第28号染色体41,733,330141,732,93041,733,33040
29号染色体42,517,134142,516,73442,517,13440
染色体3040,643,782140,643,38240,643,78240
31号染色体39,901,454139,900,75439,901,45470
32号染色体40,225,481140,224,58140225481个90
33号染色体32,139,216132,138,51632,139,21670
34号染色体42,397,973142,397,67342,397,9730
35号染色体28,051,305128,050,40528,051,30590
36号染色体2015年12月23日131,223,11531,223,4150
37号染色体30,785,915130,785,71530,785,91520
第38号染色体24,803,098124,802,59824,803,09850
X染色体124,992,0301124,987,930124,992,030410
未放置的128,440,6542,158128418854年61,2922180