WGS示例文件
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简单文件
样品.fsa>第54组[生物体=智人][染色体=5]acaagctctgtcgatgaaactttagttaaaaagtgcaaacgctgtctcacatgatacacacatatcacatactttccatgcaacatagatgatactttccatccaacatagaaaccatagcaagctacg....样品.tbl>功能Cont5410400 12512基因位置标签CCC_0311610400 10462 mRNA10533 1057710651 1109811182 1164211716 12512产品醛缩酶蛋白质_ id gnl |数据库名| CCC_03116transcript_id gnl | dbname | mrna。CCC_03116号10450 10462信用违约互换10533 1057710651 1109811182 1164211716 12233产品醛缩酶蛋白质_ id gnl |数据库名| CCC_03116transcript_id gnl | dbname | mrna。CCC_03116号推理配置文件：Genscan:2.015801 17688基因位置标签CCC_0311815801 16607 mRNA16750 17688产品假想蛋白质蛋白质_ id gnl |数据库名| CCC_03118transcript_id gnl | dbname | mrna。CCC_03118号15840 16607信用违约互换16750 17610产物假想蛋白蛋白_id gnl |数据库名称| CCC_03118transcript_id gnl | dbname | mrna。CCC_03118号类似RNA序列的推断，mRNA：INSD:AY123456.2下面是最终记录的平面文件视图的定义行使用这些文件：定义智人5号染色体Cont54，全基因组鸟枪序列。
多序列文件
多个.fsa>Cont348.225[生物体=幽门螺杆菌ABC1][菌株=ABC1][宿主=智人][分离源=血液]TTGAAGCAGGCATTAGGCGACCACTGCCTCTCTTTACCTTTTTTCCACACTTTACTTACATACGTTAGGATCTGCGAGCCAGCGGAGTTTTTTTTTCTCGGGGCTGCTTTTTTCTCTGTGGTGTGTGTGGGTGTGTTGTTTTTCCTG>Cont442.125[生物体=幽门螺杆菌ABC1][菌株=ABC1][host=智人][隔离源=血液]TTGAAGCAGGCATTAGGCGACCACTGCCTCTCTTTACCTTTTTTCCACACTTTACTTACATACGTTAGGATCTGCGAGCCAGCGGAGTTTTTTTTTCTCGGGGCTGCTTTTTTCTCTGTGGTGTGTGTGGGTGTGTTGTTTTTCCTG倍数.tbl>功能Cont348.22511 109基因位置标记HPC_002564基因cheA11 109信用违约互换产品CheA蛋白质_ id gnl |数据库名| HPC_002564>功能Cont442.12515 113基因位置标签HPC_00302015 113张CDS产品TPR重复性蛋白质蛋白质_ id gnl |数据库名| HPC_003020实验Northern印迹
部分编码区域
第一个编码区在5'端是部分的，核苷酸3是第一个完整密码子的开始。因此，“<”表示5'部分，codon_start“3”表示第一个密码子的开始。
第二个编码区域在3'端是部分的，因此“>”用于表示3'部分。
部分.fsa>Cont3【有机体=小家鼠】【菌株=BALB/c】【染色体=2】TGcaaagtGGAATTCAACACAGTTTTTTGATGGCAAAGAGAAGAGAGAGATGTACAAAATGTTAGAGCTATCAAAATCTGG加拿大政府gataaatacacgcaagatctacaggtcctatagttagttacacaacctcttggtggtaaggctcaattgggagtcaacgatttggagaaaTGGAAGTTTGGGCTCTGGAGCTTATGGCTTTATACTTACTTAACTTTACAGAAATTTACACATGATGTGTGTGTAGAGTTAAAGTTATGAAACAAATAGAAAAGGTGAAGAGAGAGATTCGAGTCAGGAATACTGAGTCATTAATGTTAGTTAGTAAAATCAAAGCGCTTAGCTAGCTATCTAATTGTGGAGTTAAATTAAAATGAAAAAAAAGATATAAAGATTTTTTTAAAAACTGCCATCACAACTCTCAAAATTTATATAAAAATTTTTAGATAAAAATATATATAATTAAATTTACATCTACAAGCCCTGAAAAAGATAAAAGTCATGGACTTATGGAAAAAAAAACCCGAAACTATATTATAGAACTTCAGACCTAAAAAAGTCTATTTGTGCGAGAATTTGTGCAAAAGATAGAATGTGTGTGGAAATAAAAAGAGAAGTTCAGAGAATTGTGAGAGTGGTGTGTGTAGAGGTTACATAAATCAAAGTTCGTAGAGAAGAATGGGGCACATCAATTATTCAACCCAGTGCACATTTTGTTTTAATCTTTACCAAGTAGAATTCACTAGTATTGAATGAAGTTAAAGGTTGAAGAGTTCTATACTTTGAAAGTTTTATTTATAGAGCTCTGTACTAGTTTAAAAAAAA TCAACTTTTAAACGAAGATAATAAAAATAATAATACAAGAGTTTGGTGAAGAATCTTTACTGCAGAGAGAGGAGAGAGAGCGAGAGACGGATACT公司官方网站AAAAGATTAAACTGAAACTCGATTTATTGAAACTGGTAAACAACCAGAATGGATTTAACTACTAACCAGAGTAAGGCCACTTGTCCTTAGATGAGAGAGAGATTTGCAACATCAGATAACGATTGTTAGAGAGTTATAAAAAAAAATATATATAGATATATATGGATCTAAAGCTCCAGATATAAATTATTAGAAATGAAAAACGAATGTTGCAAGTGTGGATGCTTATAAGCATGAGAGGAGAGTAATTAGAACTGGAAAAACGTCCATTAAAATCTTTGGCTGAATGCTTAAAGGAAAAACACAAG（附件）部分.tbl>特征Cont3<1>497基因位置标记KCS_111011<1497 CDS注释类似于枯草芽孢杆菌醛缩酶产品醛缩酶样蛋白密码_开始3protein_id gnl |数据库名| KCS_111011transcript_id gnl | dbname | mrna。KCS_111011<1>497 mRNA产品醛缩酶样蛋白protein_id gnl |数据库名| KCS_111011transcript_id gnl | dbname | mrna。KCS_111011<499>1516基因本地标签KCS_111012499>1516 CDS产品类肌动蛋白蛋白质_ id gnl |数据库名| KCS_111012transcript_id gnl | dbname | mrna。KCS_111012<499>1516信使核糖核酸产物肌动蛋白样蛋白蛋白质_ id gnl |数据库名| KCS_111012transcript_id gnl | dbname | mrna。KCS_111012
互补链上的特征
这两个基因都是负链。第一张CDS从nt1018开始，部分长度为3'。第二个CDS在其5'端是部分的，在序列的末尾nt1516处，在nt1020处结束。第一个完整的密码子从nt1514开始，所以它的codon_start=3。
互补.fsa>AMCont1022[有机体=伯克霍尔德菌地DEF2][菌株=DEF2][isolation-source=森林土壤][国家=美国：马里兰州]CTTGTTTTCCTTTAAGCATTCAGACAAGATTTATGGACGTTTACCAGTTCCTGTATATATATCTGCCTCTTCTGCCATTATCGAAAGAGCCATCCACTGACATTCGTTTTTCTCTAATATATATCTGGAGCTTTAAGATCCATTAATCTTCAATCTATTTCTATTTATACTCTTCTATAAATCGTTTAGATCTGATGTGCAAATCACTTCCATCTAGAGAGAGAAAGTGGCCTAACTGGTATCAAGGTATAGTTAAAATCATCCATTCTGTTACCAGTTCAATAATGATCAGTTTTTATCTTTTTTTTTATAGATCTTTCTTCAGCAACCTTTGATTTGTCTCATTTATTTTTAATAAAATTTTCTCTTTTATTCAAGTCTATATTTAAATCTCTAGTATCGCCTCTGCCTATTCCTGTAGAGATTTCACCAACTCTCTTGATATTTATTAATTCATCTTCGTTAAAGTTGATTTTTAAGACTTATTAATCCAGGCTCTAAACAATAAACTTTCAAAGATAGAACTTCAACCTTTCAACTCTTTAAGCTTCATAAATATAACTTCAAACTTCTAGTGAAATTCTACTTGGTAAAGATTTAAAAACCAATGTGCAACTGGTGATAATTGTGCCCCATTCTTTTCTCTACGAACATTTGTATTTAGTACCTCTACCACTCTCACAAAATATTCCTCTGAACTTCATTCTTTATATTTTCCACAACATTCGTACTTTTATTGGACCAATATTCGCAAAAATAGGCCGTCTTTTTCAGGTCTGAAAGTTCTATAATATAGTTTCGGGTTTTTTATTTCCCATAAGTCCATGACTTTATCTTTTCAGGGCTTAAAGTAATTTAATATAAAATTTGAGTCTGATATGGCAGTTTCTTTAAAAAAATCTTTAATATCTTTTTTTTTATTTAACTCACATAGAGCGCTTTGATTTCTTTACTAAAAACATATACTCAGGTATCCTGACTCGAATTCTCACTTTACTATTGTTTCATAAACTTAACTCTACCACACATCAGATTTACTTAAAATTTTTGTAAAGTATAAGAGCCCATAAGCTTCCAGACAACTTCCATCTCCAATCGTACCTCCAATTGAGCCTTACCACAAGAGGTGTTGTAACTAACTACATAAGGACCTGTAGATCTTTGTGTATTTACTTACAAGATGTGTAATTTAACATATAATAGAGTCCAACTGTCTCTCTCATCAATTTTCACCTTCACCATCCCACAATTTTTGTGTGACCAGATTTTGGTAATGAAGCTCTAACATATTGTTACATCTCTCTCTTTTTGCGCCATCAAAAAACTGTTGAAATTGGAATCCACTTGCA公司互补.tbl>功能AMCont10221018>1基因位置标签AMt_111231018>1 cd产物假想蛋白蛋白质_ id gnl |数据库名| AMt_11123<1516 1020基因位置标签AMt_11124<1516 1020 CDS产物氧化酶密码_开始3蛋白质_ id gnl |数据库名| AMt_11124
