什么是dbEST？
数据库EST（《自然遗传学》4:332-3；1993）是一个划分GenBank（基因银行）包含序列数据和其他关于“单程”cDNA序列或“表达序列”的信息标签”GenBank中的人类EST可用（《生物化学科学趋势》20:295-6；1995）。此外，请参阅《自然》特别版《基因组目录》（第377卷，第6547S期，1995年9月28日）。
关于EST
表达序列标签（EST）很短（通常<1000 bp），单程序列读取mRNA（cDNA）。通常是批量生产。它们代表基因的快照在特定组织和/或特定发育阶段表达阶段。它们是用于感兴趣的cDNA文库。
有关EST的其他信息，请参阅：Boguski理学硕士、Lowe TM、Tolstoshev CM。1993.dbEST——“表达序列标签”数据库。《自然遗传学》4（4）：332-333。
大多数EST项目生成大量序列。这些是通常以数十批提交给GenBank和dbEST数千条条目，共享引用、提交者和来源信息。提高提交过程的效率对于这种类型的数据，我们设计了一个简化的提交进程使用tbl2asn（待定）.
dbEST保留用于单次读取。组装顺序应不提交给dbEST。GenBank接受汇编的EST提交通过TSA（交通安全管理局）（转录组枪组件）部门。请联系gb-admin@ncbi.nlm.nih.gov了解更多有关向TSA提交EST程序集的信息。个人阅读组件的组成应提交给dbEST或Short在提交程序集之前，请阅读存档（SRA）。
注：来自“下一代”测序平台的序列应提交给短读存档（SRA）（如需了解，请联系sra@ncbi.nlm.nih.gov.)
不应包含在EST提交中的序列包括如下：线粒体序列、rRNA、病毒序列、载体、，污染物和低质量序列。矢量和链接器区域应为使用标识VecScreen（视频屏幕）并在提交之前删除。
如何提交数据
从2019年开始，您可以使用tbl2asn（待定）. 只有REQUIRED下的输入数据文件1和2才能生成EST提交。
- 模板文件包含文本ASN.1 Submit-block对象（后缀.sbt）
- 核苷酸序列数据FASTA格式（后缀.fsa）。FASTA文件中的每个序列应包括[organic=Genus species][tech=EST][moltype=mRNA]。SeqID将用作克隆值。您可以使用其他相关源修饰符也包括组织类型、发育阶段等，如[组织类型=心肌]、[发育阶段=成人]、[应变=ABC123]等。
- 功能不是必需的，但您可以包括要素表注释中带有“类似…”的每个序列不超过一个misc_feat。EST不能应用其他功能。
生成template.sbt和ESTs.fsa文件后，运行tbl2asn的命令行如下所示：
tbl2asn-t模板.sbt-i ESTs.fsa-a s-V V
本例中生成的提交文件为ESTs.sqn
有关可能的命令行参数的更详细描述，请参见tbl2asn（待定）第页。
您还可以包括生物项目或生物样品信息，如果EST是一个更大的正在进行的项目的一部分。
请将EST提交文件（.sqn文件）发送至gb-sub@ncbi.nlm.nih.gov。
任何问题均可发送至info@ncbi.nlm.nih.gov或gb-admin@ncbi.nlm.nih.gov。
访问dbEST的其他方法
EST序列包含在GenBank的EST部分，可从NCBI通过E-Utilities获得。
EST序列也可以通过匿名ftp在ftp.ncbi.nih.gov的/repository/dbEST目录中获得
请注意，2018年底之前收到的EST可通过FTP获取，网址为ftp.ncbi.nlm.nih.gov/仓库/dbEST
2018年后收到的EST将不包括在此格式中。
