ExpHunter套件
转录组数据综合分析包
生物导体版本:释放(3.19)
ExpHunterSuite使用已建立的*R*包并结合其结果,实现了一个综合协议,用于分析转录数据。它涵盖了DEG检测、CEG检测和RNA-seq数据功能分析的所有关键步骤。它被实现为一个R包,其中包含可以交互运行的函数。此外,它还包含包装函数的脚本,可以直接从命令行运行。
作者:詹姆斯·珀金斯[aut,cre],Pedro Seoane Zonjic[aut],费尔南多·莫雷诺·贾巴托[aut],何塞·科尔多瓦·卡巴列罗[aut],埃琳娜·罗亚诺·里维拉[aut],罗西奥·鲍蒂斯塔·莫雷诺[aut],M.Gonzalo Claros[aut]伊莎贝尔·冈萨雷斯-盖特[aut],胡安·安东尼奥·加西亚-拉涅亚[aut]
维护人员:詹姆斯·珀金斯(James Perkins)<jimrperkins at gmail.com>
引文(从R中输入引文(“ExpHunterSuite”)
):
安装
要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:
如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“ExpHunterSuite”)
对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:
浏览幻影(“ExpHunterSuite”)
细节
生物视图 |
GeneExpressionWorkflow(通用表达式工作流),工作流 |
版本 |
1.12.0 |
许可证 |
MIT+文件许可证 |
取决于 |
R(>=4.1.0) |
进口 |
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系统要求 |
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统一资源定位地址 |
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程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。