空间LIBD

spatialLIBD：一个用于可视化空间解析转录组学数据的R/Bioconductor包

生物导体版本：释放（3.19）

交互式检查来自10x Genomics Visium平台的空间解析转录组学数据，以及来自利伯大脑发育研究所（LIBD）研究人员和合作者分析的Maynard、Collado-Torres等人《自然神经科学》2021项目的数据。

作者：莱昂纳多·科拉多·托雷斯[aut，cre]，克里斯汀·梅纳德，安德鲁·贾菲布伦达·帕尔多艾比·斯潘格勒，Jesús Vélez Santiago[ctb]，卢卡斯·韦伯，路易丝·休基·迈尔斯[ctb]，尼古拉斯·伊格斯

维护人员：莱昂纳多·科拉多·托雷斯<lcoladotor at gmail.com>

引文（从R中输入引文（“空间LIBD”）):

要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：

如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：install（“空间LIBD”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览渐晕图（“空间LIBD”）

生物视图	实验数据,实验中心,表达式数据,人乳头数据,包类型数据,排序数据,单细胞数据,空间数据,组织
版本	1.16.2
许可证	艺术-2.0
取决于	空间实验（>=1.3.3），R（>=3.6）
进口	闪亮的,傀儡,ggplot2,奶牛场,巧妙地,绿柱石,闪亮小工具,sessioninfo（会话信息），网格，gr设备，方法，批注中心，实用程序，png公司,散射,DT公司,实验中心,R彩色啤酒,总结性实验、统计、图形、，S4载体,I范围,领域,基准,单细胞实验,生物文件缓存,硅钠铝石,易怒的,rtracklayer公司,矩阵,生物遗传学,基因组范围,魔法,调色板,舷窗,边缘R,利马,随机反演,矩阵泛型,爱尔兰航空公司
系统要求
统一资源定位地址	https://github.com/LieberInstitute/spatialLIBD网站
错误报告	https://support.bioconductor.org/tag/spatialLIBD（https://support.bioconductor.org/tag/spatialLIBD）

建议	针织物,参考管理R,市场营销,仿生风格,测试那个(>= 2.1.0),覆盖（covr）,在这里,生物技术经理,洛布斯特尔,DropletUtils公司
链接到
增强功能
取决于我
导入我
建议我	Banksy银行,贝叶斯空间,DESpace空间
指向我的链接
生成报告	生成报告

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	空间LIBD_1.16.2.tar.gz
Windows二进制
macOS二进制（x86_64）
macOS二进制（arm64）
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/spatialLIBD
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：包/spacialLIBD
包短Url	https://bioconductor.org/packages/spatialLIBD/
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