基因组分布数据

GenomicDistributions包的参考数据


生物导体版本:释放(3.19)

该软件包为GenomicDistributions软件包提供了现成的参考数据。原始数据从ensembldb中获得,并使用helper函数进行处理。数据文件可用于以下基因组组合:hg19、hg38、mm9和mm10。

作者:Michal Stolarczyk[aut]、Kristina Kupkova[aut,cre]、Jose Verdezoto[aut]、John Lawson[ctb]、Jason Smith[ctb]、Nathan C.Sheffield[ctb]

维护人员:克里斯蒂娜·库普科娃(Kristyna Kupkova)

引文(从R中输入引文(“基因组分布数据”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::install(“GenomicDistributionsData”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览渐晕图(“基因组分布数据”)
1.GenomicDistributionsData入门 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本
许可证 文本

细节

生物视图 实验数据,实验中心,基因组
版本 1.12.0
许可证 BSD_2_clause+文件许可证
取决于 R(>=4.1)
进口 实验中心(>= 1.14.0),批注中心,批注筛选器,数据表,实用程序,牛基因组,基因组信息Db,基因组特征,基因组范围,集成数据库
系统要求
统一资源定位地址
错误报告 http://github.com/databio/GenomicDistributions数据
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 基因组分布数据_1.12.0.tar.gz
Windows二进制
macOS二进制(x86_64)
macOS二进制(arm64)
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GenomicDistributions数据
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:软件包/GenomicDistributionsData
包短Url https://bioconductor.org/packages/GenomicDistributions数据/
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