变速箱R
使用一组变量修改一组参考序列
生物导体版本：释放（3.19）
transmogR提供了使用一组变体构建新参考基因组或参考转录组所需的工具。变量可以是SNP、插入和删除的任意组合。预期用途是创建经变异修改的参考转录组，以纳入转录组假对齐工作流，例如鲑鱼。
作者：史蒂夫·佩德森（Stevie Pederson）[aut，cre]
维护人员：史蒂夫·佩德森（Stevie Pederson）<stephen.Pederson.au at gmail.com>
引文（从R中输入引文（“transmogR”）):
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：
if（！require（“生物管理器”，悄悄=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“transmogR”）
对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：
浏览幻影（“transmogR”）
细节
| 生物视图 |
对齐,基因组变异,排序,软件,转录体变体 |
| 版本 |
1.0.0 |
| 在生物导体中 |
生物活性碳3.19（R-4.4）（<6个月） |
| 许可证 |
GPL-3公司 |
| 取决于 |
生物串,基因组范围 |
| 进口 |
牛基因组,基因组信息Db,基因组特征,ggplot2(>= 3.5.0),I范围，方法，并行，爱尔兰航空公司,规模，统计，S4载体,总结性实验,变量注释 |
| 系统要求 |
|
| 统一资源定位地址 |
https://github.com/smped/transmogR |
| Bug报告 |
https://github.com/smped/transmogR/issues |
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程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。
