舷窗

单细胞RNA-Seq分析实用程序

生物导体版本：释放（3.19）

提供执行单单元分析的基本实用程序功能，重点是简单的规范化、质量控制和数据转换。还提供了一些辅助功能来帮助开发其他包。

作者：亚伦·伦[aut，cre]，戴维斯·麦卡锡[aut]

维护人员：亚伦·伦（Aaron Lun）<infine.monkeys.with.keyboards at gmail.com>

引文（从R中输入引文（“scuttle”）):

要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：

如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“scuttle”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览幻影（“scuttle”）

生物视图	数据导入,基因表达式,免疫肿瘤学,规范化,预处理,质量控制,RNA序列,排序,单个单元格,软件,转录组学
版本	1.14.0
在生物导体中	生物柴油3.12（R-4.0）（4年）
许可证	GPL-3公司
取决于	单细胞实验
进口	方法、utils、统计信息，矩阵,卢比,生物遗传学,S4载体,生物并行,基因组范围,总结性实验,DelayedArray（延迟阵列）,延迟矩阵统计,海滩上的人
系统要求	C++11语言
统一资源定位地址

建议	仿生风格,针织物,scRNA序列,rmarkdown公司,测试那个,尖叫声
链接到	卢比,海滩上的人
增强功能
取决于我	散射,尖叫声、OSCA高级、OSCA基本、OSCA简介、OSCA多采样、OSCA工作流、SingleRBook
导入我	BASiCS公司,巴西斯坦,批处理器,DropletUtils公司,表调节子,火焰,imcR工具,米娅,蒙莫萨,麝香葡萄酒,scDblFinder,simPIC公司,单细胞TK,空间热图,飞溅,勺子,速度捕捉器,空间LIBD,数字DLSorteR,混合hvg,空间DDLS
建议我	Banksy银行,咆哮,DESpace空间,梦想家,表雄激素额外,避开（escheR）,ggsc公司,iSeed（搜索引擎代码）,iSEEfier软件,iSEE路径,马斯特R,百万卢比,雷尔,SCArray公司,附表,单细胞通道实验,单个R,草图R,平滑簇,聚光灯清扫器,tpSVG公司,TSCAN公司,HCA数据,鼠标胸腺老化,sc自定义
指向我的链接	DropletUtils公司,尖叫声
生成报告	生成报告

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	舷窗_1.14.0.tar.gz
Windows二进制	舷窗_1.14.0.zip
macOS二进制（x86_64）	舷窗_1.14.0.tgz
macOS二进制（arm64）	舷窗_1.14.0.tgz
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/scuttle网站
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：包裹/舷窗
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/scuttle网站/
包短Url	https://bioconductor.org/packages/scuttle网站/
软件包下载报告	下载统计信息