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qp图

从高通量基因组数据估计遗传和分子调控网络


生物导体版本:释放(3.19)

通过高通量表达和基因分型分析评估基因和eQTL网络。

作者:罗伯特·卡斯特罗[aut,cre],阿尔贝托·罗维拉托[aut]

维护人员:罗伯特·卡斯特罗(Robert Castelo)<upf.edu的罗伯特·卡斯特罗(Robert.Castelo)>

引文(从R中输入引文(“qpgraph”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

if(!require(“生物管理器”,悄悄=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::install(“qpgraph”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“qpgraph”)
基本用户指南.pdf PDF格式
使用qpgraph估计eQTL网络 PDF格式 R脚本
使用qpgraph对转录调控网络进行逆向工程 PDF格式 R脚本
用qpgraph模拟分子调控网络 PDF格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 基因表达式,基因调控,遗传变异性,遗传学,图形和网络,微阵列,网络推理,路径,SNP公司,软件,转录
版本 2.38.0
在生物导体中 生物化学2.4(R-2.9)(15年)
许可证 GPL(>=2)
取决于 R(>=3.5)
进口 方法,并行,矩阵(>=1.5-0),网格,注释,图表(>= 1.45.1),博科生物,S4载体,生物并行,注释Dbi,I范围,基因组信息Db,基因组范围,基因组特征,mvtnorm公司,qtl,Rgraphviz公司
系统要求
统一资源定位地址 https://github.com/rcastelo/qpgraph
错误报告 https://github.com/rcastelo/rcastelo问题
查看更多
建议 RUnit(运行单位),生物遗传学,生物风格,基因过滤器,组织EcK12.eg.db,勒克耶,,类别,GOstats公司
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取决于我
导入我 剪刀,地形GSA
建议我
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生成报告 生成报告

程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 qpgraph2.38.0.tar.gz号
Windows二进制 qpgraph2.38.0.zip文件
macOS二进制(x86_64) qpgraph2.38.0.tgz
macOS二进制(arm64) qpgraph2.38.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/qpgraph
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/qpgraph
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/qpgraph网站/
包短Url https://bioconductor.org/packages/qpgraph/
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