事实R

自定义转录组的功能注释

生物导体版本：释放（3.19）

factR包含处理自定义组装转录组（GTF）并与之交互的工具。其核心是，factR在自定义转录本上构建CDS信息，然后预测其功能输出。此外，factR具有绘制转录本、更正染色体和基因信息以及筛选新转录本的工具。

作者：福沙姆·哈米德

维护人员：Fursham Hamid<Fursham.h at gmail.com>

引文（从R中输入引文（“factR”）):

要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：

如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“factR”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览幻影（“factR”）

生物视图	交替拼接,功能预测,基因预测,软件
版本	1.6.0
在生物导体中	生物柴油3.16（R-4.2）（2年）
许可证	文件许可证
取决于	R（>=4.2）
进口	生物遗传学(>= 0.46),生物串(>= 2.68),基因组信息Db(>= 1.36),数字播放器(>= 1.1),基因组特征(>= 1.52),基因组范围(>= 1.52),I范围(>= 2.34),呜呜声(>= 1.0),rtracklayer公司(>= 1.60),第三年（>=1.3），方法（>=4.3），生物并行(>= 1.34),S4载体(>= 0.38),数据表(>= 1.14),拉朗(>= 1.1),易怒的(>= 3.2),摇摆图(>= 1.24),RCurl（RCurl）(>= 1.98),XML格式(>= 3.99),提取蛋白质类(>= 1.20),ggplot2(>= 3.4),字符串(>= 1.5),pbapply（应用程序）（>=1.7），统计（>=4.3），实用程序（>=43），图形（>=4.4），蜡笔(>= 1.5)
系统要求
统一资源定位地址	https://fursham-h.github.io/factR/

建议	批注中心(>= 2.22),牛基因组(>= 1.58),英国基因组。姆穆苏卢斯。UCSC毫米10,测试那个,针织物,rmarkdown公司,降价,狂热分子,rmd格式,生物3d(>= 2.4),信号Hsmm(>= 1.5),潮韵诗(>= 1.3),覆盖（covr）,拼凑
链接到
增强功能
取决于我
导入我
建议我
链接到我
生成报告	生成报告

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	事实R_1.6.0.tar.gz
Windows二进制	事实R_1.6.0.zip（仅64位）
macOS二进制（x86_64）	事实R_1.6.0.tgz
macOS二进制（arm64）	事实R_1.6.0.tgz
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/factR
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：包/factR
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/factR/
包短Url	https://bioconductor.org/packages/factR/
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