eisaR公司
R中的外显子-内含子分裂分析(EISA)
生物导体版本:释放(3.19)
外显子-内含子分裂分析(EISA)使用普通RNA-seq数据测量成熟RNA和前体mRNA在不同实验条件下的变化,以量化基因表达的转录和转录后调控。有关详细信息,请参见Gaidatzis等人,《2015年国家生物技术》。doi:10.1038/nbt.3269。eisaR在R中实现了EISA的主要步骤。
作者:迈克尔·斯塔德勒[aut,cre],迪莫斯·盖达齐斯[aut],卢卡斯·汉堡包[aut],夏洛特·索内森[aut'
维护人员:迈克尔·斯塔德勒(Michael Stadler)<Michael.Stadler at fmi.ch>
安装
要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:
如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“eisaR”)
对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:
浏览幻影(“eisaR”)
细节
生物视图 |
功能基因组学,基因表达式,基因调控,RNA序列,回归,软件,转录,转录组学 |
版本 |
1.16.0 |
在生物导体中 |
生物柴油3.11(R-4.0)(4.5年) |
许可证 |
GPL-3公司 |
取决于 |
R(>=4.1) |
进口 |
图形、统计、,基因组范围,S4载体,I范围,利马,边缘R(>=4.0),方法,总结性实验,生物遗传学,实用程序 |
系统要求 |
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统一资源定位地址 |
https://github.com/fmicompbio/eisaR |
错误报告 |
https://github.com/fmicompbio/eisaR/issues |
查看更多
建议 |
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链接到 |
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增强功能 |
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取决于我 |
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程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。