TAPseq公司

针对TAP-seq的靶向scRNA-seq引物设计

生物导体版本：释放（3.19）

为TAP-seq使用的靶向单细胞RNA-seq设计引物。为目标基因面板创建序列模板，并使用Primer3设计基因特异性引物。使用BLAST可以估计潜在的离目标。需要Primer3和BLASTn的工作安装。

作者：Andreas R.Gschwind【aut，cre】，拉尔斯·维尔滕[aut]，Lars M.Steinmetz[aut]

维护人员：Andreas R.Gschwind<斯坦福大学的Andreas.Gschwind>

引文（从R中输入引文（“TAPseq”）):

要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：

if（！require（“生物管理器”，悄悄=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“TAPseq”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览渐晕图（“TAPseq”）

生物视图	CRISPR公司,池式屏幕,排序,单个单元格,软件,技术
版本	1.16.0
在生物导体中	生物柴油3.11（R-4.0）（4.5年）
许可证	MIT+文件许可证
取决于	R（>=4.0.0）
进口	方法，基因组比对,基因组范围,I范围,生物遗传学,S4载体(>= 0.20.1),基因组信息Db,牛基因组,基因组特征,生物串,数字播放器,第三年,生物并行
系统要求	底漆3（>=2.5.0），爆炸+（>=2.6.0）
统一资源定位地址	https://github.com/argschwind/TAPseq

建议	测试那个,英国基因组。哈皮恩斯。加州大学旧金山分校hg38,针织物,rmarkdown公司,ggplot2,修拉,格尔姆奈特,奶牛场,矩阵,rtracklayer公司,生物风格
链接到
增强功能
取决于我
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建议我
指向我的链接
生成报告	生成报告

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	TAPseq_1.16.0.tar.gz
Windows二进制	TAPseq_1.16.0.zip型
macOS二进制（x86_64）	TAPseq_1.16.0.tgz型
macOS二进制（arm64）	TAPseq_1.16.0.tgz型
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/TAPseq
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：包/TAPseq
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/TAPseq网址/
包短Url	https://bioconductor.org/packages/TAPseq/
软件包下载报告	下载统计信息
BioC 3.19的旧源程序包	源存档