单个R
基于参考的单细胞RNA-Seq注释
生物导体版本：释放（3.19）
通过利用纯细胞类型的参考转录组数据集独立推断每个单细胞的起源细胞，从单细胞RNA测序数据中进行无偏见的细胞类型识别。
作者：德维·阿兰[aut，cph]，亚伦·伦[ctb，cre]，丹尼尔·布尼斯[ctb]，杰瑞德·安德鲁斯[ctb]Friederike Dündar[ctb]
维护人员：Aaron Lun<infinite.monkeys.with.keywords at gmail.com>亚伦·伦<infinite.monkeys.with.keywords at gmail.com>
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：
如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：install（“SingleR”）
对于旧版本的R，请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：
浏览Vignette（“SingleR”）
细节
| 生物视图 |
注释,分类,群集,基因表达式,单个单元格,软件,转录组学 |
| 版本 |
2.6.0 |
| 在生物导体中 |
生物技术3.10（R-3.6）（4.5年） |
| 许可证 |
GPL-3+文件许可证 |
| 取决于 |
总结性实验 |
| 进口 |
方法，矩阵,S4载体,延迟阵列,延迟矩阵统计,生物并行,BiocSingular公司，统计，实用程序，卢比,海滩上的人，并行 |
| 系统要求 |
C++17 |
| 统一资源定位地址 |
https://github.com/LTLA/SingleR |
| 错误报告 |
https://support.bioconductor.org/ |
查看更多
| 建议 |
测试,针织物,rmarkdown公司,仿生风格,生物遗传学,单细胞实验,舷窗,拾荒者,尖叫声,scRNA序列,ggplot2,情势图，gr设备，额外网格,翡翠色,细胞索引 |
| 链接到 |
卢比,海滩上的人,生物邻居 |
| 增强功能 |
|
| 取决于我 |
OSCA高级、OSCA基本、OSCA多采样、OSCA工作流、SingleRBook |
| 导入我 |
单细胞TK |
| 建议我 |
草图R,tidySingleCell实验,tidy空间实验,潮间带 |
| 指向我的链接 |
|
| 生成报告 |
生成报告 |
程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。
