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SPLINTER公司

成绩单拼接口译员


生物导体版本:释放(3.19)

提供工具分析备选剪接位点,基于序列信息解释结果,选择和设计用于位点验证的引物,并提供事件的可视化表示以指导下游实验。

作者:戴安娜·洛[aut,cre]

维护人员:黛安娜·洛(Diana Low)在gmail.com>

引文(从R中输入引文(“SPLINTER”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“SPLINTER”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“SPLINTER”)
SPLINTER公司 PDF格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 交替拼接基因表达式免疫肿瘤学RNA序列软件可视化
版本 1.30.0
在生物导体中 生物柴油3.4(R-3.3)(7.5年)
许可证 GPL-2型
取决于 R(>=3.6.0),gr设备,统计
进口 绘图,ggplot2seq徽标生物串pwalling(pwallign)生物反应器基因组比对基因组范围基因组特征Gviz公司I范围S4矢量基因组信息Db,实用程序,普利尔字符串、方法、,英国基因组。姆穆苏卢斯。UCSC毫米9谷歌视窗
系统要求
统一资源定位地址 https://github.com/dianalow/SPLINTER网站/
错误报告 https://github.com/dianalow/SPLINTER/issues
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 SPLINTER_1.30.0.tar.gz公司
Windows二进制 SPLINTER_1.30.0.zip(仅64位)
macOS二进制(x86_64) 分瓣器_1.30.0.tgz
macOS二进制(arm64)
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/SPLINTER网站
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/SPLINTER
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/SPLINTER网站/
包短Url https://bioconductor.org/packages/SPLINTER网站/
软件包下载报告 下载统计信息
BioC 3.19的旧源程序包 源档案