Repitools公司
表观基因组工具
生物导体版本：释放（3.19）
用于分析基于富集的表观基因组数据的工具。特征包括根据基因表达背景总结和可视化启动子间的表观基因组数据，发现差异甲基化/结合区域，BayMeth用于量化甲基化等。
作者：马克·罗宾逊（Mark Robinson）、达里奥·斯特贝纳克（Dario Strbenac）、亚伦·斯塔瑟姆（Aaron Statham）、安德烈·里布勒（Andrea Riebler）、马西·恩特努（math.ntnu.no>）
维护人员：马克·罗宾逊（Mark Robinson）<Mark.Robinson at mls.uzh.ch>
引文（从R中输入引文（“Repitools”）):
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：
if（！require（“生物管理器”，悄悄=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：install（“Repitools”）
对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：
浏览幻影（“Repitools”）
细节
| 生物视图 |
DNA甲基化,基因表达式,甲基Seq,软件 |
| 版本 |
1.50.0 |
| 在生物导体中 |
BioC 2.9（R-2.14）（13年） |
| 许可证 |
LGPL（>=2） |
| 取决于 |
R（>=3.5.0），方法，生物遗传学(>= 0.8.0) |
| 进口 |
平行，S4载体(>= 0.17.25),I范围(>= 2.13.12),基因组信息Db,基因组范围,生物串,Rsamtools软件,基因组比对,rtracklayer公司,牛基因组(>= 1.47.3),gplots（gplots），网格，MASS（质量）,g平滑,边缘R(>= 3.4.0),DNA拷贝,Rsolnp公司,集群 |
| 系统要求 |
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| 统一资源定位地址 |
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程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。
