RESOLVE（解决）
决议：用于有效分析癌症基因组突变特征的R包
生物导体版本：释放（3.19）
癌症是一种由控制关键生物功能（如细胞生长和分裂）的基因的体细胞突变引起的遗传病。这种突变可能通过细胞内和外源过程产生，在基因组上产生特征性的突变模式，称为突变特征。突变特征的研究已经成为现代基因组学研究的标准组成部分，因为它可以揭示肿瘤中哪些（环境和内源性）突变过程是活跃的，并可能突出治疗反应的标记。变异签名计算分析存在许多陷阱。首先，确定签名数量的任务非常复杂，并且依赖于启发式方法。其次，一些特征没有明确的病因，人们怀疑它们是计算伪影，而不是诱变过程。最后，用于分析的签名集对签名分配方法有很大影响。为了克服这些限制，我们开发了RESOLVE（通过rEgularization实现突变签名的稳健估计），这是一个允许有效提取和分配突变签名的框架。RESOLVE实现了一种新的算法，该算法能够实现（i）有效提取，（ii）曝光估计，以及（iii）突变签名计算推断期间的置信度评估。
作者：丹尼尔·拉马佐蒂
，卢卡·德萨诺[cre，aut]
维护人员：卢卡·德萨诺<Luca.desano在gmail.com>
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：
if（！require（“生物管理器”，悄悄=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“RESOLVE”）
对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：
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细节
| 生物视图 |
生物医学信息学,软件,体细胞突变 |
| 版本 |
1.6.0 |
| 在生物导体中 |
生物柴油3.16（R-4.2）（2年） |
| 许可证 |
文件许可证 |
| 取决于 |
R（>=4.1.0） |
| 进口 |
生物串,牛基因组,英国基因组。人乳头状瘤病毒1000个基因组。人乳头状瘤病毒37天5,数据表,基因组信息Db,基因组范围,格尔姆奈特,ggplot2,额外网格,I范围,后勤保障局,突变模式,nnls公司，平行，重新整形2,S4载体 |
| 系统要求 |
|
| 统一资源定位地址 |
https://github.com/danro9685/RESOLVE（决议） |
| Bug报告 |
https://github.com/danro9685/RESOLVE/问题 |
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程序包档案
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