PS匹配

处理和管理肽谱匹配

生物导体版本：释放（3.19）

PSMatch软件包帮助蛋白质组学从业者加载、处理和管理肽谱匹配。它提供了将肽-蛋白质关系建模为邻接矩阵和连接成分的功能，将其可视化为图形，并对共享肽过滤做出明智的决策。该软件包还提供了计算和可视化MS2片段离子的功能。

作者：劳伦特·加托[aut，cre]，约翰内斯·雷纳，塞巴斯蒂安·吉布、塞缪尔·维克佐雷克（Samuel Wieczorek）、托马斯·伯格（Thomas Burger）

维护人员：劳伦特·加托在uclouvane.be>

引文（从R中输入引文（“PSMatch”）):

要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：

if（！require（“生物管理器”，悄悄=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“PSMatch”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览幻影（“PSMatch”）

生物视图	基础设施,质谱学,蛋白质组学,软件
版本	1.8.0
在生物导体中	生物柴油3.15（R-4.2）（2年）
许可证	艺术-2.0
取决于	S4载体
进口	utils、stats、，记录仪、方法、，矩阵,生物并行,生物遗传学,ProtGenerics公司(>= 1.27.1),Q功能,MsCoreUtils（MsCore实用程序）
系统要求
统一资源定位地址	https://github.com/RforMassSpectrometry/PSM
错误报告	https://github.com/RforMassSpectrometry/PSM/问题

建议	msdata（msdata）,rpx公司,mz标识,毫兹罗,光谱,总结性实验,生物风格,rmarkdown公司,针织物,事实附加,测试那个
链接到
增强功能
取决于我
导入我	M数据库,自上而下
建议我	MsDataHub（消息数据中心）
指向我的链接
生成报告	生成报告

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	PS匹配_1.8.0.tar.gz
Windows二进制	PSMatch_1.8.0.zip
macOS二进制（x86_64）	PSMatch_1.8.0.tgz比赛
macOS二进制（arm64）	PS匹配_1.8.0.tgz
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/PSMatch
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：包/PSMatch
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/PSMatch网站/
包短Url	https://bioconductor.org/packages/PSMatch/
软件包下载报告	下载统计信息