EpiTxDb公司

使用AnnotationDbi接口存储和访问外延信息


生物导体版本:释放(3.19)

EpiTxDb促进了上转录信息的存储。更具体地说,它可以跟踪修饰的身份、位置、将其引入RNA的酶、确定待修饰RNA上的位置的说明符以及与每个修饰相关的文献参考。

作者:费利克斯·G·M·恩斯特〔aut,cre〕

维护人员:Felix G.M.Ernst<Felix.gm.Ernst at outlook.com>

引文(从R中输入引文(“EpiTxDb”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

if(!require(“生物管理器”,悄悄=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“EpiTxDb”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“EpiTxDb”)
EpiTxDb公司 HTML格式 R脚本
EpiTxDb-创建 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 表转录组学,软件
版本 1.16.0
在生物导体中 生物C 3.11(R-4.0)(4.5年)
许可证 艺术-2.0
取决于 R(>=4.0),注释Dbi,Modstrings模式
进口 方法、实用程序、,高温气冷堆,xml语言2,卷曲,雷克斯,基因组特征,txdb制造商,基因组范围,基因组信息Db,生物遗传学,生物文件缓存,S4载体,I范围,RSQ网站,数据库接口,生物串,tRNA数据库导入
系统要求
统一资源定位地址 https://github.com/FelixErnst/EpiTxDb
Bug报告 https://github.com/FelixErnst/EpiTxDb/问题
查看更多
建议 生物风格,针织物,rmarkdown公司,测试那个,httptest(httptest),批注中心,集成数据库,ggplot2,EpiTxDb。Hs.hg38型,英国基因组。哈皮恩斯。加州大学旧金山分校hg38,英国基因组。Scerevisiae公司。UCSC.sacCer3,TxDb(发送日期)。哈皮恩斯。UCSC.hg38.known基因
链接到
增强功能
取决于我 EpiTxDb。Hs.hg38型,EpiTxDb。毫米10,EpiTxDb。Sc.sacCer3证书
导入我
建议我
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 EpiTxDb_1.16.0.tar.gz(英文)
Windows二进制 EpiTxDb_1.16.0.zip
macOS二进制(x86_64) EpiTxDb_1.16.0.tgz
macOS二进制(arm64) EpiTxDb_1.16.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/EpiTxDb
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/EpiTxDb
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/EpiTxDb/
包短Url https://bioconductor.org/packages/EpiTxDb/
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