EpiTxDb公司
使用AnnotationDbi接口存储和访问外延信息
生物导体版本:释放(3.19)
EpiTxDb促进了上转录信息的存储。更具体地说,它可以跟踪修饰的身份、位置、将其引入RNA的酶、确定待修饰RNA上的位置的说明符以及与每个修饰相关的文献参考。
作者:费利克斯·G·M·恩斯特〔aut,cre〕
维护人员:Felix G.M.Ernst<Felix.gm.Ernst at outlook.com>
安装
要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:
if(!require(“生物管理器”,悄悄=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“EpiTxDb”)
对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:
浏览幻影(“EpiTxDb”)
细节
生物视图 |
表转录组学,软件 |
版本 |
1.16.0 |
在生物导体中 |
生物C 3.11(R-4.0)(4.5年) |
许可证 |
艺术-2.0 |
取决于 |
R(>=4.0),注释Dbi,Modstrings模式 |
进口 |
方法、实用程序、,高温气冷堆,xml语言2,卷曲,雷克斯,基因组特征,txdb制造商,基因组范围,基因组信息Db,生物遗传学,生物文件缓存,S4载体,I范围,RSQ网站,数据库接口,生物串,tRNA数据库导入 |
系统要求 |
|
统一资源定位地址 |
https://github.com/FelixErnst/EpiTxDb |
Bug报告 |
https://github.com/FelixErnst/EpiTxDb/问题 |
查看更多
建议 |
生物风格,针织物,rmarkdown公司,测试那个,httptest(httptest),批注中心,集成数据库,ggplot2,EpiTxDb。Hs.hg38型,英国基因组。哈皮恩斯。加州大学旧金山分校hg38,英国基因组。Scerevisiae公司。UCSC.sacCer3,TxDb(发送日期)。哈皮恩斯。UCSC.hg38.known基因 |
链接到 |
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增强功能 |
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取决于我 |
EpiTxDb。Hs.hg38型,EpiTxDb。毫米10,EpiTxDb。Sc.sacCer3证书 |
导入我 |
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建议我 |
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指向我的链接 |
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生成报告 |
生成报告 |
程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。